More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0510 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0510  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 
425 aa  842    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.249513  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11810  Na+/H+ dicarboxylate symporter  57.38 
 
 
440 aa  475  1e-133  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0215347 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  47.72 
 
 
436 aa  385  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  47.38 
 
 
442 aa  382  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  46.43 
 
 
439 aa  381  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  46.28 
 
 
445 aa  379  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  47.23 
 
 
440 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  47.23 
 
 
440 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  46.43 
 
 
436 aa  377  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  48.68 
 
 
445 aa  374  1e-102  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.126443  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  46.99 
 
 
440 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  46.75 
 
 
437 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  46.75 
 
 
437 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  47.23 
 
 
440 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  45.56 
 
 
434 aa  370  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  45.08 
 
 
434 aa  370  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  46.04 
 
 
433 aa  371  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  46.36 
 
 
437 aa  370  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  45.48 
 
 
436 aa  367  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  48.91 
 
 
438 aa  365  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  44.52 
 
 
437 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  45 
 
 
437 aa  361  2e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  45.39 
 
 
434 aa  360  4e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  47.2 
 
 
411 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  45.56 
 
 
441 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  47.55 
 
 
411 aa  351  1e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  47.79 
 
 
411 aa  352  1e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  47.55 
 
 
411 aa  350  2e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  47.55 
 
 
411 aa  350  2e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  47.55 
 
 
411 aa  350  2e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  47.55 
 
 
411 aa  350  2e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  47.79 
 
 
411 aa  350  2e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  47.3 
 
 
411 aa  350  4e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  44.26 
 
 
447 aa  348  8e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  47.3 
 
 
411 aa  346  5e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  47.06 
 
 
411 aa  344  2e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  43.93 
 
 
449 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0646  Na+/H+ - glutamate/aspartate symport protein  46.1 
 
 
436 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  45.89 
 
 
409 aa  335  7.999999999999999e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02356  putative proton/glutamate symporter  44.52 
 
 
448 aa  333  5e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.126636  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2121  sodium:dicarboxylate symporter  43.51 
 
 
457 aa  328  9e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.343777  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1836  sodium/proton:dicarboxylate (glutamate) symporter  43.51 
 
 
457 aa  326  5e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0366  sodium:dicarboxylate symporter  42.79 
 
 
457 aa  317  2e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538008  hitchhiker  0.000704417 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1097  sodium:dicarboxylate symporter  43.27 
 
 
452 aa  317  3e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  39.4 
 
 
435 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  39.4 
 
 
440 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  39.91 
 
 
443 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  39.4 
 
 
440 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  40.63 
 
 
424 aa  311  1e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  40.79 
 
 
449 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  40.19 
 
 
433 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  42.13 
 
 
432 aa  302  7.000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  40.49 
 
 
409 aa  298  1e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  41.33 
 
 
430 aa  296  4e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  37.5 
 
 
444 aa  293  5e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  37.27 
 
 
444 aa  292  8e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  37.5 
 
 
444 aa  292  9e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  37.5 
 
 
444 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0397  sodium:dicarboxylate symporter  41.29 
 
 
409 aa  290  3e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000267322  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  40.27 
 
 
417 aa  288  1e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  40.41 
 
 
410 aa  285  7e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  38.98 
 
 
402 aa  282  8.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0616  sodium:dicarboxylate symporter  38.55 
 
 
413 aa  276  4e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1033  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  40.65 
 
 
430 aa  275  1.0000000000000001e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000352201  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2904  sodium:dicarboxylate symporter  38.22 
 
 
451 aa  268  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.555878  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0390  sodium:dicarboxylate symporter  42.05 
 
 
428 aa  258  1e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000203  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1290  sodium:dicarboxylate symporter  36.32 
 
 
443 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1993  Sodium:dicarboxylate symporter  39.26 
 
 
405 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1020  sodium--dicarboxylate symporter  36.76 
 
 
479 aa  250  4e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0209  sodium:dicarboxylate symporter  37.74 
 
 
419 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0330286  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1241  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  36.68 
 
 
432 aa  242  9e-63  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1793  glutamate/aspartate:proton symporter  34.7 
 
 
438 aa  241  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72340  glutamate/aspartate:proton symporter  34.5 
 
 
444 aa  242  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0042  glutamate/aspartate:proton symporter  33.72 
 
 
443 aa  241  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192783  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6277  glutamate/aspartate:proton symporter  34.27 
 
 
444 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3882  sodium:dicarboxylate symporter  37.41 
 
 
424 aa  239  5e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2704  sodium:dicarboxylate symporter  35.38 
 
 
438 aa  239  5e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0174  glutamate/aspartate:proton symporter  34.11 
 
 
443 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0233  proton/glutamate symporter  33.95 
 
 
443 aa  239  8e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1450  proton/glutamate symporter family protein  34.19 
 
 
423 aa  238  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000273308  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1395  glutamate/aspartate:proton symporter  32.79 
 
 
438 aa  239  1e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1524  proton/glutamate symporter family protein  34.19 
 
 
423 aa  238  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.0675800000000005e-55 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1487  proton/glutamate symporter family protein  34.35 
 
 
424 aa  238  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000311717  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03949  glutamate/aspartate:proton symporter  34.17 
 
 
437 aa  237  3e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4322  glutamate/aspartate:proton symporter  34.17 
 
 
437 aa  237  3e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03909  hypothetical protein  34.17 
 
 
437 aa  237  3e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1315  proton/sodium-glutamate symport protein  34.19 
 
 
423 aa  237  3e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.63752e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5583  glutamate/aspartate:proton symporter  34.17 
 
 
437 aa  237  3e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3950  glutamate/aspartate:proton symporter  34.17 
 
 
437 aa  237  3e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4633  glutamate/aspartate:proton symporter  34.17 
 
 
437 aa  237  3e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4540  glutamate/aspartate:proton symporter  34.17 
 
 
437 aa  237  3e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4598  glutamate/aspartate:proton symporter  34.17 
 
 
437 aa  237  3e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3915  sodium:dicarboxylate symporter  34.17 
 
 
437 aa  236  4e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4628  glutamate/aspartate:proton symporter  33.71 
 
 
436 aa  237  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.740703 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4543  glutamate/aspartate:proton symporter  33.71 
 
 
436 aa  237  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.707717  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4628  glutamate/aspartate:proton symporter  33.71 
 
 
436 aa  237  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4677  glutamate/aspartate:proton symporter  33.71 
 
 
436 aa  237  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.844872  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4537  glutamate/aspartate:proton symporter  33.71 
 
 
436 aa  237  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.94288  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1593  proton/glutamate symporter family protein  33.96 
 
 
423 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000481335  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1314  proton/sodium-glutamate symport protein  34.66 
 
 
423 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000288738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>