More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0490 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0490  ABC transporter related  100 
 
 
241 aa  481  1e-135  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  62.66 
 
 
241 aa  316  2e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  63.07 
 
 
240 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  62.24 
 
 
240 aa  310  2e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  60.17 
 
 
241 aa  306  3e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  60.17 
 
 
241 aa  306  3e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  59.75 
 
 
241 aa  304  9.000000000000001e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  59.75 
 
 
241 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  59.75 
 
 
241 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  61.83 
 
 
240 aa  302  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  59.34 
 
 
241 aa  301  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  59.34 
 
 
241 aa  301  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  57.68 
 
 
242 aa  301  7.000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  61.83 
 
 
240 aa  301  8.000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  60.58 
 
 
241 aa  301  9e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  59.34 
 
 
241 aa  301  9e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  58.92 
 
 
241 aa  300  1e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.92 
 
 
241 aa  300  2e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  58.51 
 
 
242 aa  299  2e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61 
 
 
240 aa  298  6e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  59.58 
 
 
247 aa  297  9e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  58.09 
 
 
242 aa  297  1e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  60.58 
 
 
240 aa  296  2e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  58.09 
 
 
240 aa  296  2e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  58.51 
 
 
244 aa  296  2e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  56.85 
 
 
242 aa  295  3e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  56.43 
 
 
240 aa  296  3e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0598  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.68 
 
 
242 aa  295  4e-79  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00132309  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  59.75 
 
 
244 aa  294  7e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  58.09 
 
 
240 aa  294  9e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1042  ABC transporter related  57.26 
 
 
241 aa  294  9e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0556178  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  58.09 
 
 
243 aa  293  2e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1387  ATPase  57.96 
 
 
243 aa  292  3e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  57.68 
 
 
243 aa  292  4e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  56.85 
 
 
244 aa  292  4e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  56.85 
 
 
240 aa  291  7e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  57.44 
 
 
247 aa  291  7e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0468  ABC transporter related  62.24 
 
 
240 aa  290  1e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.43 
 
 
240 aa  290  2e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.43 
 
 
240 aa  290  2e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.43 
 
 
240 aa  290  2e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.43 
 
 
240 aa  290  2e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  57.26 
 
 
246 aa  289  2e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  58.33 
 
 
249 aa  290  2e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.02 
 
 
240 aa  290  2e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.43 
 
 
240 aa  289  3e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1342  ABC transporter related  58.61 
 
 
243 aa  289  3e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.494343 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0414  putative ABC transporter, ATP-binding protein  56.43 
 
 
242 aa  289  3e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.43 
 
 
240 aa  288  4e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  56.43 
 
 
242 aa  288  4e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.43 
 
 
240 aa  288  4e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3165  ABC transporter related  56.67 
 
 
257 aa  288  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.127499  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.02 
 
 
240 aa  288  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  56.85 
 
 
243 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  55.6 
 
 
242 aa  288  6e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  57.26 
 
 
240 aa  288  7e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.26 
 
 
240 aa  288  7e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4901  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.26 
 
 
240 aa  288  7e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  57.26 
 
 
240 aa  287  9e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.09 
 
 
240 aa  287  1e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  55.6 
 
 
240 aa  287  1e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  58.51 
 
 
239 aa  287  1e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0494  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  56.43 
 
 
242 aa  286  1e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0433  glutamine transport ATP-binding protein GlnQ  55.19 
 
 
242 aa  286  2e-76  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  55.6 
 
 
242 aa  286  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  57.26 
 
 
242 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  55.19 
 
 
242 aa  284  7e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  54.77 
 
 
240 aa  284  7e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  59.75 
 
 
242 aa  284  8e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  54.77 
 
 
246 aa  284  8e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  55.6 
 
 
244 aa  284  8e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0469  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.43 
 
 
240 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0354  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.43 
 
 
240 aa  283  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0468  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.43 
 
 
240 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0368  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.43 
 
 
240 aa  283  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1445  ABC transporter related  53.53 
 
 
249 aa  283  1.0000000000000001e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.124868  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.85 
 
 
253 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  56.43 
 
 
242 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0337  glutamine transport, ATP-binding protein  56.43 
 
 
240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.410517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0340  glutamine transport, ATP-binding protein  56.43 
 
 
240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.474686  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0403  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.43 
 
 
240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  55.83 
 
 
246 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  59.75 
 
 
242 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  54.77 
 
 
244 aa  283  2.0000000000000002e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  56.43 
 
 
242 aa  283  2.0000000000000002e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4704  ABC transporter-related protein  55.42 
 
 
257 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.874551  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  56.02 
 
 
242 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  56.57 
 
 
256 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  53.11 
 
 
240 aa  282  4.0000000000000003e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0693  ABC transporter-related protein  56.25 
 
 
249 aa  281  6.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.413615  normal  0.685528 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1231  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.94 
 
 
242 aa  281  6.000000000000001e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  55.6 
 
 
244 aa  281  7.000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2280  ABC transporter related protein  51.64 
 
 
274 aa  281  9e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000113339  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0981  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.94 
 
 
242 aa  280  1e-74  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  57.68 
 
 
252 aa  280  1e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2389  ABC transporter related  54.88 
 
 
266 aa  280  1e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  53.53 
 
 
240 aa  280  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0911  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.53 
 
 
242 aa  280  1e-74  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.233716  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.19 
 
 
244 aa  280  2e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.02 
 
 
284 aa  279  2e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>