More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0461 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0461  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 313 aa  630  1e-180  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  37.22 
 
 		 349 aa  209  3e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  33.65 
 
 		 309 aa  202  4e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  34.37 
 
 		 314 aa  199  5e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  34.18 
 
 		 307 aa  193  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1058  periplasmic solute binding protein  35.4 
 
 		 333 aa  192  5e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.985578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 332 aa  191  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  37.22 
 
 		 293 aa  181  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2435  periplasmic solute binding protein  38.32 
 
 		 301 aa  180  2.9999999999999997e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148152  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  35.2 
 
 		 316 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  34.89 
 
 		 316 aa  177  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  34.89 
 
 		 316 aa  175  7e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  34.89 
 
 		 316 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  34.89 
 
 		 316 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  34.89 
 
 		 316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  32.94 
 
 		 323 aa  173  2.9999999999999996e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  33.96 
 
 		 317 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  34.16 
 
 		 316 aa  170  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  31.69 
 
 		 318 aa  170  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  34.27 
 
 		 316 aa  170  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0895  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  34.97 
 
 		 514 aa  169  4e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00479451  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7033  periplasmic solute binding protein  36.82 
 
 		 315 aa  169  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  34.85 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  33.64 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2791  periplasmic solute binding protein  33.22 
 
 		 314 aa  166  5e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000435611  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  33.57 
 
 		 320 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  34.53 
 
 		 298 aa  165  8e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0535  zinc ABC transporter, zinc-binding adhesion liprotein  33.64 
 
 		 506 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0968782  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0046  periplasmic solute binding protein  31.78 
 
 		 316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0580  periplasmic solute binding protein  29.31 
 
 		 328 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  30.22 
 
 		 317 aa  162  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  30.22 
 
 		 317 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  32.71 
 
 		 316 aa  161  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  31.99 
 
 		 311 aa  156  3e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  34.06 
 
 		 282 aa  155  1e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1234  laminin-binding surface protein  31.87 
 
 		 306 aa  152  5.9999999999999996e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000444188  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2139  periplasmic solute binding protein  29.03 
 
 		 333 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000485962  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1938  adhesion lipoprotein  31.8 
 
 		 307 aa  152  1e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3534  periplasmic solute binding protein  30.21 
 
 		 304 aa  151  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2419  zinc ABC transporter substrate-binding protein  32.68 
 
 		 280 aa  150  2e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0902077  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36810  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  32.23 
 
 		 288 aa  150  4e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00286711  normal  0.394696 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2190  periplasmic solute binding protein  32.9 
 
 		 287 aa  149  5e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000321353  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  30.31 
 
 		 353 aa  149  6e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2047  periplasmic solute binding protein  29.79 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3600  periplasmic solute binding protein  29.76 
 
 		 304 aa  146  5e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0516  periplasmic solute binding protein  31.13 
 
 		 365 aa  144  1e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  33.46 
 
 		 296 aa  144  1e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3814  periplasmic solute binding protein  30.07 
 
 		 331 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.906416  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  31.52 
 
 		 312 aa  144  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  30.77 
 
 		 318 aa  143  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0916  periplasmic solute binding protein  28.42 
 
 		 307 aa  143  5e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0333  periplasmic solute binding protein  30.5 
 
 		 302 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000273282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0993  zinc ABC transporter, zinc-binding protein  31.67 
 
 		 323 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.27598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1833  periplasmic solute binding protein  28.08 
 
 		 321 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.475081  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2066  putative adhesion lipoprotein  34.98 
 
 		 265 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  29.5 
 
 		 304 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  27.8 
 
 		 294 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  27.66 
 
 		 328 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  30.84 
 
 		 326 aa  139  6e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2343  periplasmic solute binding protein  30.57 
 
 		 312 aa  139  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  27.34 
 
 		 313 aa  139  7e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  32.28 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  32.73 
 
 		 306 aa  138  1e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1775  periplasmic solute binding protein  30.69 
 
 		 312 aa  137  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2304  putative ABC-transporter metal-binding lipoprotein  30.18 
 
 		 311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0722  AfeA  29.48 
 
 		 290 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.738909  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  28.26 
 
 		 292 aa  136  5e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3749  periplasmic solute binding protein  26.89 
 
 		 294 aa  135  7.000000000000001e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.287102  hitchhiker  0.00387824 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1533  periplasmic solute binding protein  28.98 
 
 		 308 aa  135  8e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.411014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1602  periplasmic solute binding protein  28.57 
 
 		 324 aa  135  9e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1937  periplasmic solute binding protein  31.06 
 
 		 311 aa  135  9e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3437  periplasmic solute binding protein  28.71 
 
 		 358 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2211  periplasmic solute binding protein  28.87 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00443052  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0816  periplasmic solute binding protein  31.92 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.313747  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  28.14 
 
 		 301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1919  periplasmic solute binding protein  27.07 
 
 		 304 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00461225  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1891  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  30.88 
 
 		 288 aa  132  6e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2898  periplasmic solute binding protein  29.17 
 
 		 301 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3262  periplasmic solute binding protein  27.21 
 
 		 341 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000710757  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2064  periplasmic solute binding protein  27.72 
 
 		 325 aa  130  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0534  periplasmic solute binding protein  31.06 
 
 		 293 aa  130  4.0000000000000003e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2600  periplasmic solute binding protein  26.64 
 
 		 316 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3938  periplasmic solute binding protein  29.83 
 
 		 310 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.165215 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2133  periplasmic solute binding protein  29.29 
 
 		 314 aa  129  6e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.501771 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1341  ABC transporter substrate-binding protein  27.08 
 
 		 291 aa  129  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.328207 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1226  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  26.65 
 
 		 312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2168  periplasmic solute binding protein  27.91 
 
 		 333 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0250158  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2065  periplasmic solute binding protein  31.25 
 
 		 304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  27.05 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1815  periplasmic solute binding protein  26.67 
 
 		 322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.566125  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3888  periplasmic solute binding protein  29.49 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3171  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  25.72 
 
 		 305 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.866924 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3014  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  25.72 
 
 		 305 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0700149 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3066  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  25.72 
 
 		 305 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.354258  normal  0.0719754 
 
 
-
 
NC_002936  DET0631  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  29.74 
 
 		 290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2630  periplasmic-binding protein  26.33 
 
 		 322 aa  126  5e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00574815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1705  chelated iron ABC transporter, periplasmic iron binding protein YfeA  26.33 
 
 		 311 aa  126  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3050  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  25.72 
 
 		 305 aa  126  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0195762 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2983  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  25.72 
 
 		 305 aa  126  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  28.25 
 
 		 292 aa  125  6e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>