More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0427 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  100 
 
 		 446 aa  890    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  29.71 
 
 		 469 aa  219  6e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  28.98 
 
 		 475 aa  199  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  28.54 
 
 		 452 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  26.85 
 
 		 461 aa  166  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  28.5 
 
 		 450 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  26.7 
 
 		 458 aa  145  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  25.5 
 
 		 475 aa  145  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  25.62 
 
 		 464 aa  143  6e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  25.62 
 
 		 464 aa  143  6e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  26.49 
 
 		 456 aa  143  7e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  27.33 
 
 		 464 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  28.25 
 
 		 464 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3993  MATE efflux family protein  27.88 
 
 		 447 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  25.83 
 
 		 468 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  25.17 
 
 		 459 aa  137  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  26.34 
 
 		 483 aa  137  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4087  MATE efflux family protein  27.65 
 
 		 447 aa  137  5e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  27.46 
 
 		 464 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  27.43 
 
 		 464 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  28.02 
 
 		 464 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  27.46 
 
 		 464 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  27.46 
 
 		 464 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  27.46 
 
 		 464 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  27.74 
 
 		 463 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  26.02 
 
 		 469 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  25.57 
 
 		 438 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  26.41 
 
 		 459 aa  131  3e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  28.42 
 
 		 463 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  26.54 
 
 		 469 aa  130  6e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  24.31 
 
 		 467 aa  130  6e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  25.69 
 
 		 464 aa  129  8.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  28.12 
 
 		 464 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  26.34 
 
 		 450 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  24.78 
 
 		 453 aa  127  6e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  25.6 
 
 		 460 aa  126  6e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000940  Na+ driven multidrug efflux pump  25.68 
 
 		 446 aa  126  8.000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000926882  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  23.9 
 
 		 495 aa  125  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  24.72 
 
 		 450 aa  126  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09173  MATE efflux family protein  29.11 
 
 		 457 aa  125  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  23.36 
 
 		 546 aa  124  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06935  Na+-driven multidrug efflux pump  25 
 
 		 446 aa  124  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  23.9 
 
 		 495 aa  124  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4400  MATE efflux family protein  27.08 
 
 		 453 aa  124  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0651  MATE efflux family protein  25.68 
 
 		 446 aa  124  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000388571  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  23.9 
 
 		 484 aa  124  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000399298  normal  0.437543 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  23.36 
 
 		 547 aa  124  5e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  23.36 
 
 		 547 aa  124  5e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1138  MATE efflux family protein  23.2 
 
 		 450 aa  124  5e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000318212  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  26.95 
 
 		 446 aa  123  5e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  23.9 
 
 		 546 aa  124  5e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2872  hypothetical protein  23.21 
 
 		 474 aa  123  6e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0273189  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  27.13 
 
 		 470 aa  123  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  23.76 
 
 		 484 aa  123  8e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0358  multi anti extrusion protein MatE  26.37 
 
 		 452 aa  121  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0441  MATE efflux family protein  27.08 
 
 		 446 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000223642  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1590  hypothetical protein  23.43 
 
 		 476 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00267858  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  24.16 
 
 		 467 aa  119  7e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2423  MATE efflux family protein  28.88 
 
 		 451 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0441886  normal  0.25868 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1767  MATE efflux family protein  24.16 
 
 		 462 aa  118  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  24.73 
 
 		 500 aa  117  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0764  MATE family efflux pump NorM  28.88 
 
 		 451 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1359  multi anti extrusion protein MatE  27.45 
 
 		 408 aa  117  6e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0830  MATE efflux family protein  24.72 
 
 		 445 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000918772  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3760  MATE efflux family protein  25.34 
 
 		 464 aa  115  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0330  MATE efflux family protein  25.58 
 
 		 479 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  26.06 
 
 		 437 aa  114  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  24.05 
 
 		 445 aa  114  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0537  hypothetical protein  25.33 
 
 		 460 aa  114  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000109  adhesin  23.98 
 
 		 461 aa  114  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.466925  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2828  MATE efflux family protein  22.69 
 
 		 463 aa  113  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1531  hypothetical protein  23.49 
 
 		 478 aa  113  7.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  23.83 
 
 		 500 aa  113  8.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2514  MATE efflux family protein  22.69 
 
 		 463 aa  113  9e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2766  MATE efflux family protein  23.66 
 
 		 453 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984562  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  26.06 
 
 		 437 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 462 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0755  MATE efflux family protein  26.21 
 
 		 456 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0124459  normal  0.621342 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1504  hypothetical protein  23.3 
 
 		 502 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.969676  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05890  putative efflux protein, MATE family  22.73 
 
 		 472 aa  111  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1295  multidrug efflux protein  26.42 
 
 		 453 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0578421  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1267  multidrug efflux protein  26.42 
 
 		 453 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1472  multidrug efflux protein  26.42 
 
 		 453 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  25.5 
 
 		 466 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1402  multidrug efflux protein  26.42 
 
 		 453 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3909  multidrug efflux protein  26.63 
 
 		 452 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2404  hypothetical protein  25.98 
 
 		 429 aa  110  4.0000000000000004e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.146193  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18490  MATE efflux family protein  26.89 
 
 		 442 aa  110  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000174233  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1109  multidrug efflux protein  26.24 
 
 		 452 aa  110  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.654532  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1501  multidrug efflux protein  26.32 
 
 		 454 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1856  multidrug efflux protein  25.39 
 
 		 455 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.30191  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2574  hypothetical protein  23.75 
 
 		 480 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3129  MATE efflux family protein  24.47 
 
 		 452 aa  108  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2117  MATE efflux family protein  26.13 
 
 		 458 aa  108  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0110658  normal  0.0465778 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  25.85 
 
 		 448 aa  108  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1435  multidrug efflux protein  27.23 
 
 		 452 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.602082  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0411  MATE efflux family protein  25.8 
 
 		 453 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  23.08 
 
 		 450 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1694  hypothetical protein  22.44 
 
 		 474 aa  107  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.832751  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1269  multidrug efflux protein  26.88 
 
 		 453 aa  107  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.801506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>