88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0416 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0416  glycosyl transferase family 8  100 
 
 
273 aa  552  1e-156  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1397  glycosyl transferase family protein  48.69 
 
 
272 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0451  glycosyl transferase family 8  43.51 
 
 
275 aa  228  5e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1329  glycosyl transferase family 8  41.89 
 
 
276 aa  225  8e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0950  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  38.4 
 
 
274 aa  216  2.9999999999999998e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1294  glycosyl transferase family 8  39.16 
 
 
280 aa  207  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0936  glycosyl transferase family protein  40.73 
 
 
282 aa  204  1e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0365621  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0812  glycosyl transferase family protein  39.08 
 
 
272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1821  glycosyl transferase family protein  29.1 
 
 
307 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.192884  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2255  glycosyl transferase family 8  31.68 
 
 
283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0672322 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2193  glycosyl transferase family 8  32.79 
 
 
283 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1098  glycosyl transferase family protein  30.24 
 
 
278 aa  108  9.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0504909  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1009  glycosyl transferase family 8  26.02 
 
 
305 aa  105  9e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.219691  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0634  glycosyl transferase family 8  26.74 
 
 
315 aa  87.4  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.469103 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2558  glycosyl transferase family protein  28.62 
 
 
331 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3683  glycosyl transferase family protein  33.86 
 
 
334 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0415394  normal  0.880044 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2061  glycosyl transferase family protein  24.73 
 
 
401 aa  79  0.00000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4104  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  26.59 
 
 
337 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.049978  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4378  Lipopolysaccharide glucosyltransferase I  27.03 
 
 
336 aa  77  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.993607  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1459  glycosyl transferase family protein  28.11 
 
 
413 aa  75.1  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5779  glycosyl transferase family 8  28.28 
 
 
347 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149079 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4053  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  24.41 
 
 
331 aa  73.6  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4129  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  24.41 
 
 
331 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0229706  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3963  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  24.02 
 
 
331 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.170676  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4997  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  24.8 
 
 
337 aa  72.8  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250725  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0700  glycosyl transferase family 8  27.34 
 
 
336 aa  72  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000278509  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3837  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  23.62 
 
 
331 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000031402  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2101  glycosyl transferase family 8  26.27 
 
 
242 aa  70.9  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.924704  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0083  lipopolysaccharide glucosyltransferase I  23.62 
 
 
331 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.110554  hitchhiker  0.00261992 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4377  Lipopolysaccharide 3-alpha-galactosyltransferase  21.18 
 
 
336 aa  69.7  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44760  Lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  25.64 
 
 
326 aa  69.3  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0753  glycosyl transferase family 8  28.57 
 
 
328 aa  68.2  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.833822  normal  0.756645 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0583  glycosyl transferase family protein  29.65 
 
 
381 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2733  glycosyl transferase family 8  23.66 
 
 
301 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.265669  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2994  glycosyl transferase family 8  23.31 
 
 
300 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.162818  normal  0.206335 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0702  glycosyl transferase family 8  26.77 
 
 
334 aa  66.6  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000654129  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3916  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  27.17 
 
 
337 aa  65.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.620452  normal  0.010871 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0617  glycosyl transferase family 8  26.47 
 
 
358 aa  65.5  0.0000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.170905  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5876  glycosyl transferase family 8  23.53 
 
 
328 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00913304  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0082  lipopolysaccharide 3-alpha-galactosyltransferase  22.71 
 
 
338 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.313803  hitchhiker  0.00265615 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03438  hypothetical protein  22.54 
 
 
338 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3997  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  25.79 
 
 
336 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.321916  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03486  UDP-glucose:(Glucosyl) LPS alpha1,3-glucosyltransferase WaaO  22.54 
 
 
338 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3964  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  21.72 
 
 
338 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.185573  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4130  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  22.54 
 
 
338 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00481358  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4042  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  25.79 
 
 
336 aa  62.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.436401  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1382  glycosyl transferase family protein  26.81 
 
 
316 aa  62.4  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3935  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  25.79 
 
 
336 aa  62.4  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3838  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  22.13 
 
 
338 aa  62  0.000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000851053  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4054  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  22.45 
 
 
338 aa  61.2  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4127  lipopolysaccharide 1,2-galactosyltransferase  24.29 
 
 
341 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1460  glycosyl transferase family protein  24 
 
 
401 aa  60.1  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3961  lipopolysaccharide 1,2-galactosyltransferase  25.2 
 
 
342 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0769884  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0079  Lipopolysaccharide glucosyltransferase I  25 
 
 
338 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3835  lipopolysaccharide 1,2-galactosyltransferase  25.2 
 
 
341 aa  59.3  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101924  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0085  lipopolysaccharide glucosyltransferase I  25.2 
 
 
341 aa  59.3  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.416805  normal  0.0154654 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4000  hypothetical protein  24.71 
 
 
326 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.011807  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03432  hypothetical protein  25.2 
 
 
341 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.442893  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4051  lipopolysaccharide 1,2-galactosyltransferase  24.1 
 
 
341 aa  58.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03481  UDP-galactose:(Galactosyl) LPS alpha1,2-galactosyltransferase  25.2 
 
 
341 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.635685  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0078  Lipopolysaccharide 3-alpha-galactosyltransferase  24.72 
 
 
339 aa  57  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2963  glycosyl transferase family protein  25.98 
 
 
319 aa  56.6  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0383599 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0058  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  29.32 
 
 
316 aa  56.2  0.0000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0031105  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0167  glycosyl transferase family protein  23.47 
 
 
318 aa  56.2  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.512508 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0939  glycosyl transferase family 8  24.9 
 
 
371 aa  56.2  0.0000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1515  hypothetical protein  23.47 
 
 
318 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4999  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  25.57 
 
 
335 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13851  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0059  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  22.83 
 
 
317 aa  52.8  0.000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00101  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0705  glycosyl transferase family 8  25.45 
 
 
347 aa  52.4  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000314752  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4105  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  19.05 
 
 
337 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0664462  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3917  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  19.05 
 
 
337 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.752434  normal  0.01081 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1677  glycosyl transferase family 8  22.05 
 
 
610 aa  50.4  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3936  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  19.05 
 
 
337 aa  50.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0704  glycosyl transferase family 8  24.82 
 
 
331 aa  50.1  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000224419  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1675  glycosyl transferase family 8  21.54 
 
 
602 aa  50.1  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3998  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  19.05 
 
 
337 aa  50.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.313383  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4043  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  19.05 
 
 
337 aa  49.7  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.149434  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1112  glycosyl transferase family 8  22.1 
 
 
1014 aa  48.9  0.00008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1346  glycosyl transferase  22.67 
 
 
697 aa  48.5  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.938308  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2060  glycosyl transferase family protein  21.43 
 
 
398 aa  47.8  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.939333  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2389  glycosyl transferase family protein  21.58 
 
 
335 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.352127  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03437  hypothetical protein  24.43 
 
 
167 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2334  glycosyl transferase family protein  23.81 
 
 
317 aa  44.3  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1676  glycosyl transferase family 8  25.27 
 
 
615 aa  44.3  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0060  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  31.85 
 
 
274 aa  44.7  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00709812  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1434  putative sugar transferase  22.34 
 
 
401 aa  43.1  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000727163  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0399  glycosyl transferase family protein  27.84 
 
 
279 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3427  lipopolysaccharide 1  22.68 
 
 
342 aa  42.7  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>