107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0333 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0333  DNA repair protein RecO  100 
 
 		 255 aa  509  1e-143  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4198  DNA repair protein RecO  25.7 
 
 		 248 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4036  DNA repair protein RecO  25.7 
 
 		 248 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000824167  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4046  DNA repair protein RecO  25.7 
 
 		 248 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4522  DNA repair protein RecO  25.7 
 
 		 248 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000535932  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4431  DNA repair protein RecO  25.7 
 
 		 248 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000532421  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0821  DNA repair protein RecO  25.41 
 
 		 248 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000159175  decreased coverage  1.09268e-22 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4320  DNA repair protein RecO  25.7 
 
 		 248 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2531e-58 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4415  DNA repair protein RecO  25 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000274955  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3024  DNA repair protein RecO  27.32 
 
 		 248 aa  72  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.42951  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4378  DNA repair protein RecO  25.3 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000495524  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4149  DNA repair protein RecO  24.08 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0297878  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12480  DNA repair protein RecO  24.6 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2419  DNA repair protein RecO  24.69 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2799  DNA repair protein RecO  27.81 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.428956  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1066  DNA replication and repair protein RecO  27.01 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0194  DNA repair protein RecO  24.38 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12290  DNA replication and repair protein RecO  23.53 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0537049  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1346  DNA repair protein RecO  24.79 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000264775  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1504  DNA repair protein RecO  23.16 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0430427  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3103  DNA repair protein RecO  22.53 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0647  DNA repair protein RecO  26.92 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2393  DNA repair protein RecO  25.86 
 
 		 261 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3062  DNA repair protein RecO  23.14 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000268327  decreased coverage  0.0000000887022 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0118  DNA repair protein RecO  22.83 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.522104  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2475  DNA repair protein RecO  23.79 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000834216  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1031  DNA repair protein RecO  22.65 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0581  DNA repair protein RecO  23.12 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17140  DNA replication and repair protein RecO  20.3 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.136708  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3447  DNA repair protein RecO  23.33 
 
 		 279 aa  53.5  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0180024 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3826  DNA repair protein RecO  25 
 
 		 300 aa  53.5  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.230334  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0801  DNA repair protein RecO  20.33 
 
 		 254 aa  53.5  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1558  DNA repair protein (recombination protein O)  21.24 
 
 		 250 aa  52.8  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1411  DNA repair protein RecO  24.14 
 
 		 244 aa  52.4  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000257171  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7039  DNA repair protein RecO  24.19 
 
 		 243 aa  52.4  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0415  DNA repair protein RecO  38.1 
 
 		 244 aa  52.4  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1255  DNA repair protein RecO  21.24 
 
 		 250 aa  52.4  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.361247  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2250  DNA repair protein RecO  36.67 
 
 		 291 aa  52  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1663  DNA repair protein RecO  23.03 
 
 		 263 aa  52  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3482  recombination protein O, RecO  22.73 
 
 		 250 aa  51.2  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.531591  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1930  DNA repair protein RecO  21.39 
 
 		 244 aa  52  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2084  DNA repair protein RecO  38.71 
 
 		 256 aa  50.8  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.987652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2416  DNA repair protein RecO  37.5 
 
 		 298 aa  50.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1176  DNA repair protein RecO  23.3 
 
 		 260 aa  51.2  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2556  DNA repair protein RecO  25.45 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.105743  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0408  DNA repair protein RecO  38.1 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2708  DNA repair protein RecO  19.42 
 
 		 253 aa  50.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00607294  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0930  DNA repair protein RecO  37.7 
 
 		 273 aa  50.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133285  normal  0.103629 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4273  DNA repair protein RecO  20.93 
 
 		 273 aa  50.4  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1065  DNA repair protein RecO  37.1 
 
 		 272 aa  49.7  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0820208  normal  0.0227401 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1206  DNA repair protein RecO  26.74 
 
 		 257 aa  50.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0262183  normal  0.203633 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0995  DNA repair protein RecO  37.7 
 
 		 273 aa  50.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212682  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0506  DNA repair protein RecO  20.5 
 
 		 249 aa  49.3  0.00006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.00293649  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1732  DNA repair protein RecO  38.1 
 
 		 286 aa  49.3  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.467987  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2040  DNA repair protein RecO  18.5 
 
 		 251 aa  49.3  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.086646  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1757  DNA repair protein RecO  42.59 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.108646  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2189  DNA repair protein RecO  20.26 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.577631  normal  0.126644 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13550  DNA replication and repair protein RecO  18.23 
 
 		 281 aa  48.5  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.179739 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0545  DNA repair protein RecO  36.51 
 
 		 286 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2893  DNA repair protein RecO  36.51 
 
 		 286 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2464  DNA repair protein RecO  36.51 
 
 		 275 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2817  DNA repair protein RecO  36.51 
 
 		 275 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2777  DNA repair protein RecO  36.51 
 
 		 275 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2838  DNA repair protein RecO  36.51 
 
 		 275 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1787  DNA repair protein RecO  36.51 
 
 		 275 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.806002  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2118  DNA repair protein RecO  21.62 
 
 		 262 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1709  DNA repair protein RecO  17.88 
 
 		 260 aa  47.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1766  DNA repair protein RecO  20.78 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0794  recombination protein O, RecO  27.37 
 
 		 246 aa  46.6  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0601  DNA replication and repair protein RecO  20.79 
 
 		 267 aa  47  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1751  DNA repair protein RecO  41.67 
 
 		 251 aa  47  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00839209  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2271  DNA repair protein RecO  23.64 
 
 		 225 aa  47  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1986  DNA repair protein RecO  23.64 
 
 		 225 aa  47  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1117  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)  24 
 
 		 250 aa  47  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1962  DNA repair protein RecO  24.03 
 
 		 250 aa  46.6  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000273379 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl267  DNA repair/recombination protein  24.14 
 
 		 267 aa  46.2  0.0006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000227319  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0725  DNA repair protein RecO  22.77 
 
 		 249 aa  45.8  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.191921  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2973  DNA repair protein RecO  47.37 
 
 		 239 aa  45.8  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.318586  hitchhiker  0.00228518 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1123  DNA repair protein RecO  24.48 
 
 		 255 aa  45.8  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1402  DNA repair protein RecO, putative  24.48 
 
 		 255 aa  45.8  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13640  DNA repair protein RecO  19.69 
 
 		 283 aa  45.8  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.461135  normal  0.670097 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1638  DNA repair protein RecO  17.89 
 
 		 256 aa  45.8  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393403 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3633  DNA repair protein RecO  30.14 
 
 		 249 aa  45.8  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0729  DNA repair protein RecO  20.69 
 
 		 243 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0596  DNA repair protein RecO  22.11 
 
 		 256 aa  44.7  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00201329 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2031  DNA repair protein RecO  28.57 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0971735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2037  recombination protein O, RecO  26.38 
 
 		 264 aa  43.9  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0117854  normal  0.79539 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2168  DNA repair protein RecO  34.92 
 
 		 278 aa  43.9  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.239438  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0843  DNA repair protein RecO  34.38 
 
 		 336 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.236883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1087  DNA repair protein RecO  32.76 
 
 		 306 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0047  DNA repair protein RecO  26.83 
 
 		 251 aa  43.9  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0046  DNA repair protein RecO  24.39 
 
 		 257 aa  43.5  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2897  DNA repair protein RecO  32.76 
 
 		 309 aa  43.9  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.64605  normal  0.158668 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1012  DNA repair protein RecO  34.48 
 
 		 279 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.39895  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1016  DNA repair protein RecO  34.48 
 
 		 279 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2310  DNA repair protein RecO  19.92 
 
 		 252 aa  43.5  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0770241  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01719  DNA repair protein RecO  42.5 
 
 		 240 aa  43.1  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.748158  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11770  DNA repair protein RecO  20.85 
 
 		 257 aa  43.1  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0355162 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0852  DNA repair protein RecO  18.99 
 
 		 243 aa  42.7  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.352076  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1969  recombination protein O, RecO  21.19 
 
 		 283 aa  42.4  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>