18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0326 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0326  protein of unknown function DUF107  100 
 
 
206 aa  408  1e-113  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0124428  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0766  protein of unknown function DUF107  30.96 
 
 
423 aa  81.6  0.000000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2844  serine protease, ClpP class  31.05 
 
 
407 aa  77.8  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1193  protein of unknown function DUF107  28.29 
 
 
458 aa  74.7  0.0000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0874985  normal  0.16265 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1632  hypothetical protein  31.58 
 
 
235 aa  73.2  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1666  hypothetical protein  31.58 
 
 
235 aa  73.2  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0857  hypothetical protein  31.85 
 
 
163 aa  71.6  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0391  protein of unknown function DUF107  30.61 
 
 
452 aa  70.1  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1572  hypothetical protein  30.51 
 
 
436 aa  68.6  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.951288  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2900  protein of unknown function DUF107  30 
 
 
158 aa  64.7  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0230935  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1141  hypothetical protein  35.45 
 
 
236 aa  63.5  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0730  protein of unknown function DUF107  29.28 
 
 
828 aa  58.2  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.553992  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1190  protein of unknown function DUF107  33.33 
 
 
447 aa  56.2  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00806251  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1662  hypothetical protein  28.21 
 
 
493 aa  50.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.174432 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1818  hypothetical protein  26.77 
 
 
424 aa  46.6  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.163142  normal  0.174622 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0392  protein of unknown function DUF107  24.65 
 
 
170 aa  45.1  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2227  protein of unknown function DUF107  29.08 
 
 
424 aa  43.5  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.46745  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2489  hypothetical protein  27.59 
 
 
171 aa  43.1  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000314918  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>