More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0307 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  100 
 
 		 451 aa  892    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1583  MATE efflux family protein  30.58 
 
 		 445 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000267124  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  28.83 
 
 		 455 aa  210  4e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  28.73 
 
 		 459 aa  205  1e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  29.49 
 
 		 440 aa  205  1e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  29.43 
 
 		 442 aa  202  8e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3452  MATE efflux family protein  29.44 
 
 		 445 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000316888  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  28.25 
 
 		 455 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  27.93 
 
 		 455 aa  197  3e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2404  MATE efflux family protein  29.55 
 
 		 440 aa  195  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000448098  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1120  MATE efflux family protein  29.63 
 
 		 444 aa  192  8e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  27.29 
 
 		 451 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  27.58 
 
 		 451 aa  192  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  27.52 
 
 		 452 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0514  multi antimicrobial extrusion protein MatE  30 
 
 		 437 aa  191  2.9999999999999997e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000852803  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  27.29 
 
 		 451 aa  190  4e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  27.29 
 
 		 451 aa  190  4e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  27.29 
 
 		 451 aa  190  4e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  27.35 
 
 		 451 aa  190  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  27.29 
 
 		 451 aa  190  5e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  29.12 
 
 		 456 aa  190  5e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  29.44 
 
 		 456 aa  188  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  28.18 
 
 		 477 aa  188  2e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  27.58 
 
 		 451 aa  188  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  26.68 
 
 		 455 aa  187  4e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1655  multi antimicrobial extrusion protein MatE  26.74 
 
 		 450 aa  187  4e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.2584 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  27.13 
 
 		 451 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18540  putative efflux protein, MATE family  28.04 
 
 		 435 aa  185  2.0000000000000003e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  28.05 
 
 		 447 aa  182  1e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2191  multi antimicrobial extrusion protein MatE  26.64 
 
 		 446 aa  181  2e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  28.51 
 
 		 452 aa  179  9e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0585  MATE efflux family protein, authentic frameshift  27 
 
 		 442 aa  178  1e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.636807  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  28.81 
 
 		 448 aa  179  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  28.33 
 
 		 448 aa  178  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  26.3 
 
 		 496 aa  177  4e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  25.22 
 
 		 455 aa  177  4e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  27.29 
 
 		 454 aa  177  5e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  27.78 
 
 		 452 aa  176  9e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  26.17 
 
 		 454 aa  173  5.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  28.22 
 
 		 461 aa  172  9e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  27.91 
 
 		 450 aa  169  1e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  29.09 
 
 		 467 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  27.45 
 
 		 446 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0153  MATE efflux family protein  26.21 
 
 		 447 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0819  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.33 
 
 		 459 aa  164  3e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.10085 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  26.05 
 
 		 454 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0967  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27 
 
 		 434 aa  162  1e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000590306  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  24.83 
 
 		 448 aa  162  2e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  26.67 
 
 		 449 aa  160  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3521  multi anti extrusion protein MatE  31.65 
 
 		 455 aa  160  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1332  multi anti extrusion protein MatE  25.71 
 
 		 451 aa  160  5e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.478618  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1368  multi anti extrusion protein MatE  25.71 
 
 		 451 aa  160  5e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4053  multidrug efflux pump VmrA  26.35 
 
 		 465 aa  160  6e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1506  MATE efflux family protein  25.52 
 
 		 448 aa  158  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0795  multi antimicrobial extrusion protein MatE  26.28 
 
 		 451 aa  157  3e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2825  multi anti extrusion protein MatE  26.21 
 
 		 450 aa  157  3e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2923  multi anti extrusion protein MatE  26.21 
 
 		 450 aa  157  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  24.49 
 
 		 461 aa  157  4e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2747  multi anti extrusion protein MatE  26.21 
 
 		 450 aa  157  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3016  multi antimicrobial extrusion protein MatE  25.71 
 
 		 451 aa  156  7e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160373  normal  0.416485 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  27.04 
 
 		 451 aa  156  9e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  26.4 
 
 		 447 aa  155  1e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1259  multi anti extrusion protein MatE  26.18 
 
 		 449 aa  155  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2669  multi antimicrobial extrusion protein MatE  26.29 
 
 		 452 aa  154  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.612532  normal  0.353791 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2445  multi anti extrusion protein MatE  25.99 
 
 		 443 aa  154  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1959  multi antimicrobial extrusion protein MatE  25.28 
 
 		 472 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.849908  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  27.05 
 
 		 447 aa  154  4e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0140  multidrug efflux pump VmrA  25.41 
 
 		 464 aa  153  5e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  23.92 
 
 		 442 aa  153  5.9999999999999996e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  26.05 
 
 		 448 aa  152  8e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1342  multi anti extrusion protein MatE  25.47 
 
 		 451 aa  152  8e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.934996  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  27.34 
 
 		 449 aa  152  1e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1448  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 470 aa  150  5e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2975  multidrug efflux pump VmrA  25.23 
 
 		 459 aa  149  8e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0592966 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2775  MATE efflux family protein  25.86 
 
 		 456 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  25.58 
 
 		 456 aa  147  3e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  23.97 
 
 		 466 aa  147  4.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  25.31 
 
 		 448 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0160  multidrug efflux pump VmrA  27.7 
 
 		 468 aa  145  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3482  multi anti extrusion protein MatE  25.17 
 
 		 449 aa  145  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456655  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  25.71 
 
 		 455 aa  145  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  26.54 
 
 		 455 aa  142  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  25.49 
 
 		 460 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0874  putative integral membrane protein  27.21 
 
 		 439 aa  142  1.9999999999999998e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.512566  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  24.75 
 
 		 460 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  26.77 
 
 		 451 aa  141  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0582  MATE efflux family protein  29.53 
 
 		 466 aa  139  7.999999999999999e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  24.59 
 
 		 466 aa  139  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  23.74 
 
 		 451 aa  138  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  25.99 
 
 		 464 aa  137  5e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  25.55 
 
 		 458 aa  137  5e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03710  Na+-driven multidrug efflux pump  24.78 
 
 		 456 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.323146  normal  0.0291298 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  27.82 
 
 		 453 aa  137  6.0000000000000005e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0373  MATE efflux family protein  23.57 
 
 		 490 aa  135  9.999999999999999e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  27.06 
 
 		 451 aa  134  1.9999999999999998e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  28.18 
 
 		 447 aa  134  5e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  24.82 
 
 		 464 aa  133  7.999999999999999e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02200  Na+-driven multidrug efflux pump  24.83 
 
 		 466 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1298  MATE efflux family protein  25 
 
 		 446 aa  130  5.0000000000000004e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1225  multi anti extrusion protein MatE  23.62 
 
 		 439 aa  127  5e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.874219  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>