84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0286 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0286  Methicillin resistance protein  100 
 
 
341 aa  695    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1773  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  34.4 
 
 
345 aa  188  1e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1444  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  35.19 
 
 
339 aa  177  2e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.593499  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  28.48 
 
 
363 aa  135  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  30.03 
 
 
360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2417  methicillin resistance protein  28.53 
 
 
366 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00836283  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1844  femX protein  25.91 
 
 
416 aa  107  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.700473  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0509  beta-lactam resistance factor  24.22 
 
 
403 aa  100  3e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.695705  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3975  methicillin resistance protein  23.42 
 
 
366 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4673  methicillin resistance protein  25.14 
 
 
383 aa  96.7  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1609  Methicillin resistance protein  27.01 
 
 
347 aa  95.5  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1611  Methicillin resistance protein  24.84 
 
 
370 aa  90.5  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0885  Methicillin resistance protein  26.36 
 
 
357 aa  90.1  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2288  methicillin resistance protein  26.07 
 
 
421 aa  88.2  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00915844  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2329  methicillin resistance protein  26.07 
 
 
421 aa  88.2  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.179607  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1112  peptidoglycan branched peptide synthesis protein  22.99 
 
 
404 aa  87.4  3e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3053  Methicillin resistance protein  22.69 
 
 
354 aa  85.9  9e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000266593 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1256  Methicillin resistance protein  28.42 
 
 
347 aa  84.7  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000274445 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0801  Methicillin resistance protein  29.8 
 
 
373 aa  83.6  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2858  methicillin resistance protein  26.25 
 
 
342 aa  82  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1415  methicillin resistance protein  23.93 
 
 
366 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.89632  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0771  methicillin resistance protein  22.87 
 
 
377 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.455727  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2372  UDP-N-acetylmuramoylpentapeptide-lysine N(6)-alanyltransferase  25.13 
 
 
396 aa  76.6  0.0000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16380  uncharacterized methicillin resistance protein  23.33 
 
 
329 aa  76.3  0.0000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5796  Methicillin resistance protein  21.85 
 
 
370 aa  75.9  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2093  Methicillin resistance protein  21.55 
 
 
346 aa  74.7  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.801885  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0792  methicillin resistance protein  25.78 
 
 
337 aa  73.2  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0340  Methicillin resistance protein  24.24 
 
 
394 aa  72.8  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1294  Methicillin resistance protein  22.7 
 
 
340 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.402759 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1442  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  23.66 
 
 
422 aa  70.5  0.00000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0510  murM protein, putative  20.94 
 
 
406 aa  67.8  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1465  methicillin resistance protein  24.59 
 
 
419 aa  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.109752  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1739  femAB family protein  20.99 
 
 
354 aa  65.5  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00186266  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1436  methicillin resistance protein  24.59 
 
 
419 aa  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.250722  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0083  methicillin resistance protein  21.45 
 
 
354 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2865  hypothetical protein  22.37 
 
 
370 aa  63.9  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0947  femB protein  23.2 
 
 
417 aa  62.8  0.000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.453149  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0961  methicillin resistance protein  24.24 
 
 
359 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2001  fmhA protein  22.78 
 
 
415 aa  60.5  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1307  methicillin resistance protein  25.71 
 
 
414 aa  59.3  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.200076  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1332  methicillin resistance protein  25.71 
 
 
414 aa  59.3  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0318895  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2344  hypothetical protein  21.84 
 
 
344 aa  58.9  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2059  FemAB family protein  35.71 
 
 
445 aa  59.3  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2347  FemAB family protein  35.71 
 
 
445 aa  59.3  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.439209  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2969  hypothetical protein  17.45 
 
 
346 aa  57.8  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.852464  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0599  FemA protein  22.39 
 
 
347 aa  58.2  0.0000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.33847  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2404  hypothetical protein  23.25 
 
 
344 aa  58.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1598  Methicillin resistance protein  24.62 
 
 
364 aa  57.4  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.075491  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1775  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  20.75 
 
 
344 aa  57  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2853  hypothetical protein  22.95 
 
 
348 aa  57.4  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.957178  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2436  methicillin resistance protein  20.11 
 
 
416 aa  57  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2484  methicillin resistance protein  20.11 
 
 
416 aa  57  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2472  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  21.8 
 
 
344 aa  56.6  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0220  hypothetical protein  23.62 
 
 
331 aa  56.6  0.0000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.186583  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1980  hypothetical protein  21.92 
 
 
352 aa  56.2  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1393  hypothetical protein  21.34 
 
 
331 aa  56.2  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.238447  normal  0.393853 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2169  hypothetical protein  23.21 
 
 
360 aa  55.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.764152  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0970  hypothetical protein  20.72 
 
 
346 aa  55.8  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.534214  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1195  hypothetical protein  23.93 
 
 
355 aa  54.7  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1247  femAB family protein  23.5 
 
 
352 aa  53.1  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0683  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  20.96 
 
 
348 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1435  methicillin resistance protein  23.95 
 
 
420 aa  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.452442  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1464  methicillin resistance protein  23.95 
 
 
420 aa  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.297112  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1516  hypothetical protein  19.87 
 
 
343 aa  50.8  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.069659  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0589  hypothetical protein  18.57 
 
 
347 aa  50.8  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.611508 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0882  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  20.71 
 
 
388 aa  50.4  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0946  femA protein  23.74 
 
 
417 aa  50.1  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.70677  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2216  FemAB-related protein, PEP-CTERM system- associated  21.72 
 
 
342 aa  50.1  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0386  peptidoglycan branched peptide synthesis protein  29.67 
 
 
381 aa  50.4  0.00005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8162  Methicillin resistance protein  25.28 
 
 
343 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848631  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2342  hypothetical protein  22.36 
 
 
352 aa  49.7  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2511  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  20 
 
 
356 aa  49.7  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.723604 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2523  hypothetical protein  20.39 
 
 
361 aa  48.5  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.193947  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01304  hypothetical protein  18.65 
 
 
357 aa  48.5  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0832  hypothetical protein  20.52 
 
 
349 aa  48.5  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00050056  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2634  hypothetical protein  22.94 
 
 
377 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0584962  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1028  hypothetical protein  22.87 
 
 
436 aa  47.8  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1029  hypothetical protein  20 
 
 
422 aa  47  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3065  hypothetical protein  17.98 
 
 
348 aa  46.2  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0204721  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0719  hypothetical protein  25.15 
 
 
333 aa  45.4  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00617075  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3275  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  20.47 
 
 
353 aa  46.2  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299337  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0327  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  22.03 
 
 
417 aa  45.1  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.297856  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0886  Methicillin resistance protein  23.89 
 
 
437 aa  43.9  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2928  Methicillin resistance protein  28.28 
 
 
410 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.651446 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>