253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0241 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1542  sucrose phosphorylase  65.28 
 
 		 485 aa  669    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.296567  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0241  Sucrose phosphorylase  100 
 
 		 483 aa  983    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1779  glycosidase  62.76 
 
 		 489 aa  640    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0384  glycosidase  63.2 
 
 		 492 aa  656    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00983965  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0651  sucrose phosphorylase  49.15 
 
 		 482 aa  483  1e-135  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0824794  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0232  sucrose phosphorylase  37.78 
 
 		 493 aa  348  2e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.528502  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1331  sucrose phosphorylase  40.17 
 
 		 508 aa  342  7e-93  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00201506  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0066  sucrose phosphorylase  39.52 
 
 		 494 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000218626 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0064  sucrose phosphorylase  39.52 
 
 		 494 aa  336  5.999999999999999e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000722293 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0065  sucrose phosphorylase  40.96 
 
 		 492 aa  336  7e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3361  alpha amylase catalytic region  36.75 
 
 		 491 aa  335  7.999999999999999e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0062  sucrose phosphorylase  39.52 
 
 		 494 aa  335  1e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0945971  unclonable  0.0000350237 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4288  sucrose phosphorylase  40.96 
 
 		 492 aa  334  2e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00965772  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0066  sucrose phosphorylase  40.73 
 
 		 492 aa  333  3e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.530318  hitchhiker  0.00316152 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0061  sucrose phosphorylase  40.96 
 
 		 492 aa  333  3e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3990  sucrose phosphorylase  38.58 
 
 		 493 aa  323  6e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00149762  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01971  sucrose phosphorylase  37.58 
 
 		 498 aa  322  9.999999999999999e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01286  predicted glucosyltransferase  28.85 
 
 		 559 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2337  alpha amylase catalytic region  28.85 
 
 		 559 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0459721  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1519  alpha amylase family protein  28.85 
 
 		 559 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2316  alpha amylase catalytic region  28.85 
 
 		 559 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.278573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1424  alpha amylase family protein  28.85 
 
 		 559 aa  197  3e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1813  alpha amylase family protein  28.12 
 
 		 559 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.653374 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2600  sucrose phosphorylase  29.59 
 
 		 591 aa  184  4.0000000000000006e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0436867 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3029  alpha amylase catalytic subunit  28.87 
 
 		 556 aa  180  5.999999999999999e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.172997 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1771  alpha amylase catalytic region  27.2 
 
 		 585 aa  179  7e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.232326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2165  alpha amylase, catalytic region  29.34 
 
 		 565 aa  179  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0993887 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1248  alpha amylase catalytic region  29.39 
 
 		 568 aa  177  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.55232  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1824  putative sucrose phosphorylase  28.82 
 
 		 587 aa  177  3e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.552548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0418  alpha amylase, catalytic region  28.79 
 
 		 577 aa  177  5e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.537622  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2164  alpha amylase, catalytic region  29.26 
 
 		 586 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.659302  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02161  putative sucrose phosphorylase  29.74 
 
 		 584 aa  175  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0246  alpha amylase domain-containing protein  28.03 
 
 		 583 aa  172  9e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0774  Alpha amylase, catalytic region  28.08 
 
 		 589 aa  171  2e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09141  glycoside hydrolase family protein  27.41 
 
 		 583 aa  171  3e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000264002 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0665  alpha amylase catalytic region  27.25 
 
 		 555 aa  169  7e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.694695  normal  0.614349 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3210  sucrose phosphorylase  28.88 
 
 		 596 aa  167  4e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2588  alpha amylase  29.72 
 
 		 598 aa  166  9e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2846  alpha amylase, catalytic region  27.05 
 
 		 581 aa  162  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.218279  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2566  alpha amylase, catalytic region  28.45 
 
 		 578 aa  160  6e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0104089  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2573  alpha amylase, catalytic region  28.45 
 
 		 578 aa  160  6e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000337914  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2580  alpha amylase, catalytic region  28.45 
 
 		 578 aa  160  6e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.008896  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2243  alpha amylase domain-containing protein  25.45 
 
 		 575 aa  159  1e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1523  alpha amylase catalytic region  29.71 
 
 		 561 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.346384  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0838  alpha amylase domain-containing protein  25.9 
 
 		 586 aa  153  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2606  alpha amylase domain-containing protein  24.35 
 
 		 575 aa  152  1e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.281377 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08951  glycoside hydrolase family protein  25.79 
 
 		 586 aa  150  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.497034  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10441  glycoside hydrolase family protein  26.04 
 
 		 589 aa  150  6e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08971  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 586 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.540308  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0506  putative sucrose phosphorylase  28.26 
 
 		 544 aa  144  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06751  glycoside hydrolase family protein  24.8 
 
 		 578 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.335085 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00676  alpha-amylase, amylosucrase  27.54 
 
 		 649 aa  72.8  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.145273  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0572  alpha amylase, catalytic region  26.46 
 
 		 650 aa  70.1  0.00000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3684  alpha amylase catalytic region  24.39 
 
 		 663 aa  68.9  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0308  alpha amylase catalytic subunit  25.47 
 
 		 636 aa  68.6  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3860  alpha amylase catalytic region  24.84 
 
 		 667 aa  66.6  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0136  trehalose synthase  22.11 
 
 		 1116 aa  66.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0117  trehalose synthase  23.71 
 
 		 1116 aa  65.9  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0236355 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1153  alpha amylase catalytic region  26.91 
 
 		 657 aa  65.1  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00213284  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02416  alpha-amlyase  26.09 
 
 		 638 aa  64.3  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2030  alpha amylase, catalytic region  26.82 
 
 		 638 aa  64.3  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194844  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0305  alpha amylase, catalytic region  27.18 
 
 		 646 aa  64.3  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0218  Alpha amylase, catalytic region  24.88 
 
 		 650 aa  63.9  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3820  alpha amylase, catalytic region  26.17 
 
 		 645 aa  63.9  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.166544  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1267  alpha amylase, catalytic region  25.11 
 
 		 645 aa  63.9  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0972  alpha amylase catalytic region  24.76 
 
 		 644 aa  62.4  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3605  alpha amylase catalytic region  25 
 
 		 643 aa  61.6  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  24.89 
 
 		 548 aa  61.6  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0324  alpha amylase catalytic region  24.76 
 
 		 641 aa  61.6  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3590  alpha amylase catalytic region  20.82 
 
 		 661 aa  60.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0704974 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2596  alpha amylase, catalytic region  24.41 
 
 		 558 aa  60.1  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  26.15 
 
 		 1100 aa  60.1  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0937  alpha amylase domain-containing protein  24.41 
 
 		 548 aa  59.7  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2914  alpha amylase catalytic region  24.55 
 
 		 650 aa  60.1  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0152  trehalose synthase  25.81 
 
 		 1113 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.38856 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3514  alpha amylase, catalytic region  24.29 
 
 		 651 aa  58.5  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.482546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  24.77 
 
 		 1102 aa  57.4  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  24.15 
 
 		 1093 aa  57.4  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  24.58 
 
 		 1093 aa  57.4  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2978  alpha amylase, catalytic region  23.83 
 
 		 548 aa  57  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.533119  normal  0.0820165 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0240  trehalose synthase  24.52 
 
 		 1105 aa  57  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  24.77 
 
 		 1102 aa  57  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3679  trehalose synthase-like  24 
 
 		 1099 aa  56.6  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3928  alpha amylase catalytic region  24.51 
 
 		 544 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1465  trehalose synthase-like  21.35 
 
 		 1088 aa  56.2  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  24.77 
 
 		 1102 aa  56.6  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3322  alpha amylase catalytic region  25.71 
 
 		 672 aa  55.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  24.07 
 
 		 1121 aa  55.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  23.29 
 
 		 1115 aa  55.5  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  23.72 
 
 		 1100 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4791  trehalose synthase  23.53 
 
 		 1114 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0872883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1208  alpha amylase  20.88 
 
 		 1094 aa  55.1  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  23.81 
 
 		 1088 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1307  alpha amylase catalytic region  22.48 
 
 		 652 aa  54.7  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323164 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  23.81 
 
 		 1088 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  24.55 
 
 		 1092 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3038  alpha amylase, catalytic region  27.59 
 
 		 568 aa  54.3  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2115  alpha amylase catalytic region  23.73 
 
 		 553 aa  53.9  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal  0.0296214 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2353  alpha amylase domain-containing protein  24.55 
 
 		 1110 aa  53.9  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.544253  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4096  trehalose synthase  23.83 
 
 		 1139 aa  53.9  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.981031  normal  0.0225037 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>