More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0236 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0236  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 273 aa  557  1e-158  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3104  AraC family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 282 aa  155  9e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0474  AraC family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 284 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23290  transcriptional regulator, AraC family  33.71 
 
 		 276 aa  144  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0353  MSM (multiple sugar metabolism) operon regulatory protein  30.4 
 
 		 301 aa  143  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1165  AraC family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 278 aa  140  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1312  AraC family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0768  AraC family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3428  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0765  AraC family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 279 aa  123  4e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.448457  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0749  lactose operon transcriptional activator  30.91 
 
 		 279 aa  123  4e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0693788  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37180  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  23.11 
 
 		 297 aa  106  5e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1378  AraC family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 293 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230612  normal  0.324624 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51400  transcriptional regulator AraC family  26.23 
 
 		 310 aa  93.6  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4772  AraC family transcriptional regulator  22.27 
 
 		 293 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54610  putative transcriptional regulator  22.5 
 
 		 303 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.53981  normal  0.0153543 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0659  AraC family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 290 aa  92  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2134  AraC protein, arabinose-binding/dimerisation  25.73 
 
 		 306 aa  89.4  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  34.55 
 
 		 519 aa  87.8  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2104  transcriptional regulator, AraC family  25.71 
 
 		 298 aa  87.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.244646 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2431  AraC protein arabinose-binding/dimerisation  23.87 
 
 		 294 aa  87.4  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.690566  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6086  transcriptional regulator, AraC family  25.62 
 
 		 288 aa  85.9  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.993456 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3869  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  24.31 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6879  transcriptional regulator, AraC family  25.61 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0489024  normal  0.393248 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3596  transcriptional regulator, AraC family  22.98 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000994716  hitchhiker  0.0000611237 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7100  transcriptional regulator, AraC family  25.91 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.723966  normal  0.268951 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  40.86 
 
 		 1400 aa  79.7  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4138  AraC family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 311 aa  79.3  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2329  transcriptional regulator, AraC family  36.09 
 
 		 773 aa  78.2  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  27.86 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3095  AraC family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 313 aa  78.6  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.570459 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0276  helix-turn-helix domain-containing protein  29.75 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1862  transcriptional regulator, AraC family  25.41 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  29 
 
 		 1366 aa  77.4  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1809  transcriptional regulator, AraC family  45.45 
 
 		 273 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000729156  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2354  transcriptional regulator, AraC family  24.49 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.227413 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1945  transcriptional regulator, AraC family  22.8 
 
 		 278 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2677  transcriptional regulator, AraC family  25.41 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5909  transcriptional regulator, AraC family  24.39 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.678896 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  23.29 
 
 		 281 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0220  two component transcriptional regulator, AraC family  34.82 
 
 		 934 aa  76.3  0.0000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497584  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  23.29 
 
 		 281 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  35.14 
 
 		 1366 aa  76.3  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2101  putative DNA-binding protein  28.57 
 
 		 286 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.326102  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4273  transcriptional regulator, AraC family  34.58 
 
 		 119 aa  76.3  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.673244 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  25.94 
 
 		 286 aa  75.9  0.0000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  22.48 
 
 		 277 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0868  AraC family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 336 aa  74.7  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  36.96 
 
 		 1343 aa  75.1  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  38.3 
 
 		 537 aa  74.3  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0937  transcriptional regulator, AraC family  19.4 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1904  transcriptional regulator, AraC family  32.74 
 
 		 127 aa  73.9  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  23.29 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0125  transcriptional regulator, AraC family  20.58 
 
 		 288 aa  73.9  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2234  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 330 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.962439 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0853  two component transcriptional regulator, AraC family  29.61 
 
 		 509 aa  73.6  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0415  AraC family transcriptional regulator  22.55 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  36.17 
 
 		 1373 aa  72.8  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0347  AraC family transcriptional regulator  22.55 
 
 		 288 aa  72.4  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3318  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 345 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1157  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 248 aa  72  0.000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  33.04 
 
 		 287 aa  72  0.000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0219  helix-turn-helix domain-containing protein  42.86 
 
 		 293 aa  72  0.000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.882333  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2388  AraC family transcriptional regulator  22.99 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.262251  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  36.96 
 
 		 1418 aa  71.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5122  transcriptional regulator AraC family  23.39 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.962416  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0572  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2291  transcriptional regulator, AraC family  23.97 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2976  AraC family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00165868  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2590  transcriptional regulator AraC family  34.48 
 
 		 337 aa  70.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3506  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.939341  normal  0.0589755 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0555  AraC family DNA-binding response regulator  39.74 
 
 		 529 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0539  AraC family DNA-binding response regulator  39.74 
 
 		 529 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  36.26 
 
 		 1370 aa  70.5  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1575  AraC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 339 aa  70.5  0.00000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6135  transcriptional regulator, AraC family  35.63 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1583  two component AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 533 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2003  AraC family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 342 aa  69.7  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1857  AraC family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 338 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.18222 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3697  two component AraC family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 517 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000611836  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2467  two component transcriptional regulator, AraC family  39.36 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3306  transcriptional regulator, AraC family  36.9 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3086  AraC family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000257264  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3030  AraC family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1984  transcriptional regulator, AraC family  35.96 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.626531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3328  AraC family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0991  transcriptional regulator, AraC family  25.53 
 
 		 276 aa  68.9  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6692  transcriptional regulator, AraC family  39.29 
 
 		 313 aa  68.9  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3298  transcriptional regulator, AraC family  36.9 
 
 		 275 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2987  transcriptional regulator fragment  38.14 
 
 		 111 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.1494  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0464  AraC family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 259 aa  68.9  0.00000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0082  transcriptional regulator, AraC family  31.03 
 
 		 292 aa  68.9  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2379  AraC family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 304 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0538221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  20.48 
 
 		 279 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4842  transcriptional regulator, AraC family  34.41 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.195064 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  34.41 
 
 		 1355 aa  68.6  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6285  transcriptional regulator, AraC family  29.82 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2542  transcriptional regulator, AraC family  23.77 
 
 		 320 aa  68.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2912  AraC family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.299019 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>