64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0230 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0230  putative transcriptional regulator, ModE family  100 
 
 
117 aa  234  4e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2202  putative transcriptional regulator, ModE family  37.61 
 
 
111 aa  79.7  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0066  ModE family transcriptional regulator  36.17 
 
 
108 aa  65.9  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000184024  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  33.93 
 
 
236 aa  65.1  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0057  ModE family transcriptional regulator  33.04 
 
 
137 aa  64.3  0.0000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5342  putative transcriptional regulator, ModE family  33.33 
 
 
114 aa  63.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0023  ModE family transcriptional regulator  34.58 
 
 
135 aa  61.2  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0054  ModE family transcriptional regulator  31.3 
 
 
138 aa  60.5  0.000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0286693 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01590  molybdenum-binding protein  36.19 
 
 
114 aa  60.8  0.000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.55567  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0533  putative transcriptional regulator, ModE family  44.05 
 
 
118 aa  60.5  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1100  ModE family transcriptional regulator  33.64 
 
 
145 aa  60.5  0.000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.87335  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1572  ModE family transcriptional regulator  31.53 
 
 
123 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.113677  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2877  ModE family transcriptional regulator  27.52 
 
 
125 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.795322  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3521  Fis family transcriptional regulator  33.33 
 
 
125 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1405  putative transcriptional regulator, ModE family  30.21 
 
 
126 aa  56.2  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.518534  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3515  ModE family transcriptional regulator  31.25 
 
 
112 aa  56.6  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000445767  normal  0.258614 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0212  CBS domain-containing protein  27.93 
 
 
247 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2404  putative ModE family transcriptional regulator  35.19 
 
 
115 aa  54.3  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.424301  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0566  putative transcriptional regulator, ModE family  33.33 
 
 
114 aa  53.1  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.454266  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0658  putative transcriptional regulator, ModE family  34.55 
 
 
115 aa  53.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4134  putative transcriptional regulator, ModE family  29 
 
 
121 aa  52  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0113407 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3511  Fis family transcriptional regulator  28.18 
 
 
155 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2664  ModE family transcriptional regulator  32.26 
 
 
118 aa  51.6  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.554277  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1265  putative molybdenum transport protein ModA  31.31 
 
 
195 aa  51.2  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6143  putative transcriptional regulator, ModE family  30.85 
 
 
114 aa  51.6  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.144159  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  34.48 
 
 
263 aa  51.2  0.000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0330  putative transcriptional regulator, ModE family  30.7 
 
 
116 aa  49.3  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000263512  normal  0.179413 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0974  molybdenum-binding transcriptional repressor  29.89 
 
 
132 aa  48.1  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  29.67 
 
 
268 aa  48.5  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0723  helix-turn-helix domain protein  31.11 
 
 
123 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523038  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2144  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  29.79 
 
 
195 aa  48.5  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.947345  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0871  putative transcriptional regulator, ModE family  31.11 
 
 
123 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.741628  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0650  putative transcriptional regulator, ModE family  32.58 
 
 
136 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.33047 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13050  molybdenum-binding protein  31.37 
 
 
115 aa  47.8  0.00005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.803513  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4071  putative transcriptional regulator, ModE family  29.47 
 
 
115 aa  47.8  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4205  putative transcriptional regulator, ModE family  31.76 
 
 
125 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.590179  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1394  ModE family transcriptional regulator  28.97 
 
 
171 aa  47  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2293  ModE family transcriptional regulator  23.85 
 
 
115 aa  45.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.11585  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2059  regulatory protein LysR  25.81 
 
 
245 aa  45.1  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000246336  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0173  ModE family transcriptional regulator  34.29 
 
 
109 aa  45.1  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.727956  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0033  ModE family transcriptional regulator  31.58 
 
 
155 aa  44.7  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0601173  normal  0.403792 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2794  ModE family transcriptional regulator  32.14 
 
 
107 aa  44.3  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  28.71 
 
 
272 aa  44.3  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3706  putative transcriptional regulator, ModE family  32.88 
 
 
114 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5511  putative transcriptional regulator, ModE family  32.88 
 
 
114 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4319  ModE family transcriptional regulator  30 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0494502  normal  0.0757875 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0934  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 
134 aa  42.7  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.102124  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3881  putative transcriptional regulator, ModE family  30.59 
 
 
119 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180792  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0482  putative transcriptional regulator, ModE family  33.62 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000243706  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6170  ModE family transcriptional regulator  26.17 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.350331  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4419  ModE family transcriptional regulator  27.85 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.675399  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2041  putative transcriptional regulator, ModE family  31.58 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0460  ModE family transcriptional regulator  30.34 
 
 
127 aa  41.6  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000661787  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0967  molybdate metabolism transcriptional regulator  30.85 
 
 
359 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.930984  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1779  LysR family transcriptional regulator  29.35 
 
 
95 aa  41.6  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.027196  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  27.78 
 
 
270 aa  41.2  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1642  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 
128 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.986241 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0360  putative transcriptional regulator, ModE family  26.13 
 
 
242 aa  40.8  0.006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  30.21 
 
 
276 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2496  ModE family transcriptional regulator  32.63 
 
 
115 aa  40.8  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1565  putative transcriptional regulator, ModE family  27.59 
 
 
139 aa  40.8  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3409  ModE family transcriptional regulator  29.52 
 
 
116 aa  40.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0426925  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2514  ModE family transcriptional regulator  29.13 
 
 
125 aa  40  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.217491  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3020  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  28.72 
 
 
359 aa  40  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0475131  normal  0.0124041 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>