More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0156 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0156  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  100 
 
 
216 aa  431  1e-120  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2716  HAD family hydrolase  40.76 
 
 
218 aa  168  7e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000772309  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0414  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.45 
 
 
217 aa  127  2.0000000000000002e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0976  HAD family hydrolase  30.33 
 
 
225 aa  123  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0258  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.14 
 
 
220 aa  123  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2834  HAD family hydrolase  31.78 
 
 
224 aa  123  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.46316  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0696  phosphoglycolate phosphatase  33.49 
 
 
220 aa  122  5e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.202819  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3061  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.8 
 
 
216 aa  120  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1252  HAD family hydrolase  34.29 
 
 
220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3114  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
216 aa  119  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00150  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  34.27 
 
 
218 aa  119  4.9999999999999996e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3382  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
217 aa  119  4.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.55 
 
 
219 aa  118  6e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.87 
 
 
221 aa  118  7.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  32.2 
 
 
217 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  37.56 
 
 
223 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  36.46 
 
 
214 aa  116  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  27.83 
 
 
266 aa  115  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  28.77 
 
 
223 aa  114  8.999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1222  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.78 
 
 
220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  27.52 
 
 
272 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1237  HAD family hydrolase  30.84 
 
 
229 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1395  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  28.24 
 
 
272 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1080  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.58 
 
 
218 aa  113  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00830882  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1144  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.81 
 
 
217 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  27.52 
 
 
272 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20950  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  28.23 
 
 
216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  27.57 
 
 
272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  26.85 
 
 
226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1932  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.29 
 
 
218 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  29.95 
 
 
224 aa  107  9.000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  28.77 
 
 
272 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.66 
 
 
222 aa  107  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1646  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.78 
 
 
217 aa  107  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  27.31 
 
 
272 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  27.78 
 
 
272 aa  106  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  26.7 
 
 
234 aa  106  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  26.39 
 
 
272 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1117  phosphoglycolate phosphatase  27.14 
 
 
209 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.31485  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  29.95 
 
 
226 aa  105  5e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  26.98 
 
 
227 aa  105  7e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  26.21 
 
 
234 aa  105  8e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1177  phosphoglycolate phosphatase  27.62 
 
 
209 aa  104  8e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46650  phosphoglycolate phosphatase  26.82 
 
 
233 aa  103  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1245  phosphoglycolate phosphatase  27.14 
 
 
209 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  26.7 
 
 
232 aa  102  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00083  phosphoglycolate phosphatase  27.78 
 
 
228 aa  101  7e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3084  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.5 
 
 
218 aa  101  8e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.15 
 
 
222 aa  101  9e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.36 
 
 
233 aa  101  9e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.31745 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2880  phosphoglycolate phosphatase  27.32 
 
 
246 aa  100  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.587243  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1684  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.97 
 
 
220 aa  100  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000256212  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  27.57 
 
 
225 aa  100  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3132  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.36 
 
 
226 aa  100  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1784  HAD family hydrolase  26.39 
 
 
226 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.889068  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  26.64 
 
 
226 aa  99.8  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1278  phosphoglycolate phosphatase  28.97 
 
 
218 aa  99.8  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2937  phosphoglycolate phosphatase  28.97 
 
 
218 aa  99  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0824  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.81 
 
 
219 aa  98.6  6e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  24.76 
 
 
233 aa  97.8  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  24.66 
 
 
228 aa  97.1  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  27.6 
 
 
225 aa  97.1  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  26.73 
 
 
223 aa  96.3  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  28.43 
 
 
227 aa  95.5  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0460  phosphoglycolate phosphatase  24.65 
 
 
229 aa  95.1  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0934432  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  26.19 
 
 
225 aa  94.4  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  25.62 
 
 
227 aa  94.4  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1156  phosphoglycolate phosphatase  25.12 
 
 
209 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.53294 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2274  phosphoglycolate phosphatase  24.48 
 
 
216 aa  94.7  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0581  putative phosphoglycolate phosphatase protein  26.51 
 
 
233 aa  93.2  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  23.18 
 
 
252 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0609  HAD family hydrolase  26.42 
 
 
215 aa  93.6  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0595  HAD family hydrolase  26.42 
 
 
215 aa  93.6  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  23.18 
 
 
252 aa  93.2  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2757  phosphoglycolate phosphatase  26.83 
 
 
243 aa  93.2  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.411374  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  28.5 
 
 
218 aa  93.2  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  23.18 
 
 
252 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  23.18 
 
 
252 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  23.18 
 
 
252 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  23.18 
 
 
252 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  23.18 
 
 
252 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2708  phosphoglycolate phosphatase  29.17 
 
 
218 aa  92.8  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.900688 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  23.18 
 
 
252 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  23.18 
 
 
252 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3122  phosphoglycolate phosphatase  26.83 
 
 
248 aa  92  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.270174 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  28.23 
 
 
227 aa  92  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1367  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.05 
 
 
209 aa  92  7e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4600  phosphoglycolate phosphatase  25.24 
 
 
232 aa  91.7  8e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.383007  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3193  phosphoglycolate phosphatase  25.84 
 
 
250 aa  91.7  9e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14060  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  26.92 
 
 
217 aa  91.3  1e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1973  phosphoglycolate phosphatase  27.51 
 
 
213 aa  90.5  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.662433 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  25.35 
 
 
226 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  25.59 
 
 
225 aa  90.1  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  25.48 
 
 
231 aa  89.7  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  22.97 
 
 
252 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  22.97 
 
 
252 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  24.3 
 
 
229 aa  89.7  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  22.97 
 
 
252 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  22.97 
 
 
252 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>