More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0100 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0100  MATE efflux family protein  100 
 
 
454 aa  900  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0456451  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  39.87 
 
 
463 aa  320  3e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0828  MATE efflux family protein  33.86 
 
 
438 aa  236  7e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.478729  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0835  MATE efflux family protein  33.63 
 
 
438 aa  233  4e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0636  MATE efflux family protein  34.54 
 
 
454 aa  231  2e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.237827 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1922  MATE efflux family protein  32.89 
 
 
456 aa  223  5e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0534  MATE efflux family protein  33.19 
 
 
451 aa  215  1e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  28.92 
 
 
460 aa  169  7e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  27.14 
 
 
485 aa  160  4e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  27.05 
 
 
464 aa  154  3e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  27.05 
 
 
464 aa  154  3e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  28.57 
 
 
460 aa  151  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  27.15 
 
 
486 aa  141  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  26.61 
 
 
499 aa  138  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  25.65 
 
 
445 aa  137  4e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  27.71 
 
 
455 aa  135  1e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  24.84 
 
 
500 aa  135  2e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  27.35 
 
 
481 aa  133  5e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16054  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  26.33 
 
 
443 aa  133  6e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0679405  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  27.69 
 
 
458 aa  130  4e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  27.38 
 
 
462 aa  130  4e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  3.46552e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  26.48 
 
 
518 aa  130  7e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  27.98 
 
 
468 aa  130  7e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.02645e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  25.23 
 
 
500 aa  129  8e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  25.28 
 
 
500 aa  129  8e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  27.71 
 
 
525 aa  129  9e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  27.88 
 
 
453 aa  129  1e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  6.32854e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  26.37 
 
 
467 aa  128  2e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  27.1 
 
 
475 aa  127  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  25.92 
 
 
456 aa  127  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  2.2927e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  26.8 
 
 
470 aa  126  7e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  27.47 
 
 
454 aa  126  8e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  27.08 
 
 
466 aa  125  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  27.8 
 
 
454 aa  125  2e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  27.17 
 
 
498 aa  125  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  25.21 
 
 
490 aa  124  3e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  26.55 
 
 
462 aa  124  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  27.62 
 
 
457 aa  124  4e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  3.81455e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  25.45 
 
 
458 aa  123  6e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.8929e-07 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  28.17 
 
 
453 aa  123  8e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  24.08 
 
 
453 aa  121  2e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  26.99 
 
 
469 aa  121  2e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  24.83 
 
 
458 aa  120  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  26.2 
 
 
451 aa  120  5e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  26.11 
 
 
455 aa  120  5e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  26.72 
 
 
452 aa  120  5e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  26.67 
 
 
475 aa  119  1e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  1.56724e-11  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  27.68 
 
 
459 aa  118  2e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  3.35028e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  26.74 
 
 
446 aa  118  2e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0420  MATE efflux family protein  25.17 
 
 
459 aa  117  4e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  7.68677e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  27.59 
 
 
453 aa  117  4e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  27.57 
 
 
453 aa  117  4e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  26.2 
 
 
454 aa  117  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  26.14 
 
 
463 aa  116  7e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  26.24 
 
 
467 aa  116  1e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  27.58 
 
 
461 aa  113  6e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  25 
 
 
461 aa  113  8e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  28.1 
 
 
438 aa  113  8e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  24.62 
 
 
455 aa  112  1e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  25.6 
 
 
453 aa  112  1e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  27.02 
 
 
448 aa  111  2e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  25.23 
 
 
468 aa  111  2e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0723  multidrug resistance protein  23.63 
 
 
454 aa  112  2e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  25.22 
 
 
460 aa  111  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  25.28 
 
 
492 aa  111  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  25.65 
 
 
455 aa  110  4e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  25.65 
 
 
455 aa  110  4e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  25.65 
 
 
455 aa  110  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2533  multi anti extrusion protein MatE  26.38 
 
 
447 aa  110  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  1.03349e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  25.65 
 
 
455 aa  110  6e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  26.71 
 
 
453 aa  109  8e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  24.56 
 
 
455 aa  109  8e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  24.56 
 
 
455 aa  109  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  23.01 
 
 
554 aa  108  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  22.61 
 
 
453 aa  108  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  1.54468e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  23.57 
 
 
454 aa  108  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  25.43 
 
 
483 aa  107  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3662  MATE efflux family protein  24.95 
 
 
476 aa  107  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  3.89251e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0553  MATE efflux family protein  24.94 
 
 
452 aa  107  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  24.89 
 
 
453 aa  107  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  4.76954e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  24.62 
 
 
452 aa  107  5e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  26.22 
 
 
477 aa  106  7e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3399  MATE efflux family protein  24.72 
 
 
452 aa  106  7e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00107141 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  25 
 
 
484 aa  106  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1055  MATE efflux family protein  25.36 
 
 
449 aa  105  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  4.67502e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1497  MATE efflux family protein  25.12 
 
 
460 aa  106  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00584213  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1593  MATE efflux family protein  22.8 
 
 
460 aa  105  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  1.99125e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0618  MATE efflux family protein  23.57 
 
 
505 aa  105  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.316241  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3569  MATE efflux family protein  25.27 
 
 
452 aa  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0796958  normal  0.0492062 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2244  hypothetical protein  30.28 
 
 
460 aa  105  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  25.44 
 
 
448 aa  105  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  1.70892e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  24.83 
 
 
496 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2343  MATE efflux family protein  25.78 
 
 
483 aa  105  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  25.06 
 
 
448 aa  105  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  7.66798e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  24.48 
 
 
485 aa  104  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  28.38 
 
 
454 aa  104  3e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  1.93663e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  25.68 
 
 
451 aa  104  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  1.72656e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  25.32 
 
 
456 aa  103  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00144  multidrug efflux pump  29.87 
 
 
456 aa  103  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  24.78 
 
 
439 aa  103  5e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>