More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0098 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0098  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  100 
 
 
291 aa  590  1e-168  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000117533  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1058  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  48.36 
 
 
292 aa  254  1e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1759  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  51.23 
 
 
291 aa  249  4e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1246  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  49.28 
 
 
292 aa  247  2e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0490782  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2643  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  48.03 
 
 
293 aa  238  6e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2960  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  47.67 
 
 
293 aa  238  1e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1421  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  44.68 
 
 
297 aa  223  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316402  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1076  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  41.32 
 
 
297 aa  211  8e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.036098  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1966  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  40.56 
 
 
294 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2094  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  41.11 
 
 
299 aa  204  1e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3307  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent subunit alpha  39.37 
 
 
296 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.340076  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3067  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent subunit alpha  39.37 
 
 
296 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.589265  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1459  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  40.96 
 
 
292 aa  199  3e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  1.85683e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1253  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  40.91 
 
 
294 aa  198  8e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1474  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  38.87 
 
 
290 aa  198  1e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2554  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  40.42 
 
 
299 aa  197  2e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2606  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  40.42 
 
 
299 aa  197  2e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4208  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  41.46 
 
 
292 aa  195  8e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4271  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  41.46 
 
 
292 aa  195  8e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2854  L-serine ammonia-lyase  38.95 
 
 
304 aa  194  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0174652 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10070  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit/L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  43.28 
 
 
541 aa  193  2e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000332749  hitchhiker  4.58611e-08 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4247  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  41.11 
 
 
292 aa  193  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3892  L-serine dehydratase, alpha subunit  41.11 
 
 
292 aa  193  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4161  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  41.11 
 
 
292 aa  193  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3884  L-serine dehydratase, alpha subunit  41.11 
 
 
292 aa  193  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4046  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent subunit alpha  41.11 
 
 
292 aa  193  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4360  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent subunit alpha  41.11 
 
 
292 aa  193  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3970  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  40.77 
 
 
292 aa  192  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1073  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  43.07 
 
 
293 aa  192  4e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  2.30696e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0989  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  41.11 
 
 
292 aa  192  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0888  L-serine ammonia-lyase / 2-hydroxymethylglutarate dehydratase  42.05 
 
 
287 aa  192  5e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00304555  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3835  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  42.22 
 
 
287 aa  192  5e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.338413  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2834  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  39.79 
 
 
290 aa  192  6e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2483  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  40.42 
 
 
296 aa  192  7e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16320  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit/L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  43.22 
 
 
552 aa  191  2e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280056  hitchhiker  0.00195001 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1506  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  39.5 
 
 
296 aa  190  3e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0178055  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3287  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  39.72 
 
 
296 aa  188  8e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0952  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  47.7 
 
 
536 aa  188  1e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  2.35834e-06 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2146  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  40.34 
 
 
290 aa  186  3e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.284202  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0198  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  42.39 
 
 
283 aa  186  4e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  1.57551e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1946  L-serine ammonia-lyase  46.43 
 
 
313 aa  182  5e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.426247  hitchhiker  2.56832e-07 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1283  L-serine dehydratase alpha subunit  42.55 
 
 
289 aa  179  3e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.199144  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5570  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  42.01 
 
 
295 aa  178  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.260199 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0337  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  40.38 
 
 
286 aa  177  2e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.794758  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0267  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  40.28 
 
 
290 aa  176  3e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0503  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  38.77 
 
 
549 aa  175  1e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.742023 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1331  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  40.75 
 
 
296 aa  170  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.742186  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16330  L-serine ammonia-lyase, alpha subunit  37.27 
 
 
288 aa  168  9e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.59813e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2065  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  34.84 
 
 
293 aa  157  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.67711e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3112  serine dehydratase alpha chain  36.65 
 
 
410 aa  150  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0667312  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2251  serine dehydratase alpha chain  35.94 
 
 
454 aa  147  1e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.472865  normal  0.778553 
 
 
-
 
NC_002950  PG0084  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, single chain form  33.45 
 
 
399 aa  143  3e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.644978 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0917  serine dehydratase alpha chain  37.32 
 
 
406 aa  142  5e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1086  serine dehydratase alpha chain  35.56 
 
 
502 aa  142  9e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.787533 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3319  L-serine ammonia-lyase  41.24 
 
 
557 aa  137  3e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4393  L-serine ammonia-lyase  34.05 
 
 
458 aa  132  7e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2892  L-serine dehydratase 1  33.93 
 
 
458 aa  131  1e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.14665  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33030  L-serine dehydratase  32.75 
 
 
458 aa  131  1e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.518916  hitchhiker  0.000319155 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3620  L-serine dehydratase 1  34.08 
 
 
467 aa  130  2e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.294532  normal  0.0574017 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0987  L-serine dehydratase 1  33.33 
 
 
458 aa  130  2e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0992  L-serine dehydratase 1  40.44 
 
 
458 aa  130  2e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0569  L-serine ammonia-lyase  40.98 
 
 
525 aa  130  2e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0531592 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3034  L-serine ammonia-lyase  32.86 
 
 
410 aa  130  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1024  L-serine dehydratase 1  33.33 
 
 
458 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.846352 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1149  L-serine dehydratase 1  32.76 
 
 
499 aa  130  3e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4231  L-serine dehydratase 1  40.44 
 
 
458 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2808  L-serine dehydratase  39.34 
 
 
469 aa  129  5e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.255142  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6183  L-serine dehydratase 1  32.86 
 
 
457 aa  129  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01946  L-serine dehydratase 1  32.03 
 
 
457 aa  129  7e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0568801  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3700  L-serine ammonia-lyase  33.57 
 
 
457 aa  129  7e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26040  L-serine dehydratase  32.54 
 
 
458 aa  129  8e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1304  L-serine dehydratase 1  33.96 
 
 
476 aa  128  1e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00039374  normal  0.309635 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6246  L-serine dehydratase 1  40.76 
 
 
455 aa  128  1e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.187309  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4709  L-serine dehydratase 1  32.04 
 
 
475 aa  128  1e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3111  L-serine ammonia-lyase  35.66 
 
 
404 aa  127  2e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2874  L-serine dehydratase 1  39.89 
 
 
457 aa  127  2e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.30844  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000749  L-serine dehydratase  33.33 
 
 
456 aa  127  2e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.360037  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1754  L-serine ammonia-lyase  36.04 
 
 
458 aa  127  2e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120711  normal  0.244789 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4265  L-serine ammonia-lyase  35.63 
 
 
460 aa  127  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1625  L-serine dehydratase 1  32.97 
 
 
457 aa  126  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.701794  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04899  L-serine dehydratase  32.6 
 
 
456 aa  126  4e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0011  serine dehydratase alpha chain  32.37 
 
 
459 aa  126  5e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0204845 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2109  L-serine dehydratase 1  31.25 
 
 
472 aa  125  6e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1538  L-serine dehydratase 1  34.05 
 
 
458 aa  125  6e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00324731  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2070  serine dehydratase alpha chain  35.42 
 
 
403 aa  125  7e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2603  L-serine dehydratase 1  35.06 
 
 
473 aa  125  9e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02760  L-serine ammonia-lyase  33.1 
 
 
472 aa  125  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04817  L-serine deaminase  39.34 
 
 
456 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3591  L-serine dehydratase 1  40.72 
 
 
475 aa  125  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3038  L-serine ammonia-lyase  35.66 
 
 
459 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.883779 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3617  L-serine ammonia-lyase  36.25 
 
 
458 aa  125  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0736152  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0329  L-serine dehydratase 1  39.56 
 
 
463 aa  124  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3256  L-serine dehydratase 1  34.65 
 
 
456 aa  124  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2900  L-serine dehydratase 1  34.18 
 
 
458 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12590  L-serine ammonia-lyase  40.76 
 
 
464 aa  123  4e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.82368  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1625  L-serine dehydratase 1  33.45 
 
 
458 aa  123  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0594859  normal  0.120267 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1077  L-serine dehydratase  38.8 
 
 
458 aa  123  4e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6540  L-serine dehydratase 1  31.8 
 
 
459 aa  122  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00743621  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1429  L-serine ammonia-lyase  33.33 
 
 
463 aa  122  7e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2740  serine dehydratase alpha chain  30.11 
 
 
460 aa  122  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  1.27179e-05  hitchhiker  4.03127e-07 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>