263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0097 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0097  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  100 
 
 
220 aa  451  1e-126  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  5.99373e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1760  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  55.3 
 
 
229 aa  250  1e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.178826  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2642  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  44.33 
 
 
226 aa  186  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2959  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  44.33 
 
 
226 aa  186  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1057  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  41.55 
 
 
226 aa  177  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1332  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  40 
 
 
221 aa  176  3e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.385667  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1245  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  41.06 
 
 
226 aa  174  7e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0325404  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1420  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  41.46 
 
 
222 aa  173  2e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00485508  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1460  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  42.72 
 
 
222 aa  172  3e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  7.17015e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2064  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  41.36 
 
 
224 aa  170  1e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.93764e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16340  L-serine ammonia-lyase, beta subunit  41.59 
 
 
218 aa  170  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.48669e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2835  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  40.98 
 
 
220 aa  168  6e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0503  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  38.01 
 
 
549 aa  166  2e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.742023 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1507  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  42.44 
 
 
220 aa  165  4e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  2.96361e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0988  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  41.67 
 
 
220 aa  165  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4248  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  41.67 
 
 
220 aa  164  1e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4272  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  41.18 
 
 
220 aa  162  4e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4162  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  41.18 
 
 
219 aa  162  4e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3885  L-serine dehydratase subunit beta  41.18 
 
 
219 aa  162  4e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3893  L-serine dehydratase, beta subunit  41.18 
 
 
219 aa  162  4e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4209  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  41.18 
 
 
219 aa  162  4e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3971  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  41.38 
 
 
220 aa  160  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4361  l-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent subunit beta  39.15 
 
 
219 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4047  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent subunit beta  39.15 
 
 
219 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1965  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  40.39 
 
 
220 aa  156  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2145  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  42.93 
 
 
222 aa  154  9e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1947  L-serine ammonia-lyase  40.59 
 
 
218 aa  152  3e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.376252  hitchhiker  2.22078e-07 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0199  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  40.39 
 
 
216 aa  151  7e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  4.76395e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16320  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit/L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  44.69 
 
 
552 aa  149  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280056  hitchhiker  0.00195001 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1075  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  38.92 
 
 
220 aa  149  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.102707  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0887  L-serine ammonia-lyase  41.26 
 
 
223 aa  148  8e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0556305  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10070  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit/L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  42.62 
 
 
541 aa  147  1e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000332749  hitchhiker  4.58611e-08 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0336  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  41.54 
 
 
216 aa  146  2e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.866527  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1252  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  39.02 
 
 
221 aa  146  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.809325  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1282  L-serine dehydratase beta subunit  43.3 
 
 
223 aa  145  3e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.38968  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2853  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  33.94 
 
 
221 aa  145  4e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0221158 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0266  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  36.82 
 
 
224 aa  145  7e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1475  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  38.61 
 
 
220 aa  142  3e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0952  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  43.02 
 
 
536 aa  139  3e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  2.35834e-06 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3836  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  42.23 
 
 
223 aa  139  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0141316  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1074  L-serine ammonia-lyase  36 
 
 
220 aa  115  6e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  1.07918e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3308  l-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent subunit beta  33.84 
 
 
232 aa  108  8e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.826727  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3068  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent subunit beta  33.84 
 
 
232 aa  108  8e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.65769  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3288  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  33.84 
 
 
232 aa  108  8e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5571  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  32.65 
 
 
232 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.244703 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2482  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  31.4 
 
 
232 aa  104  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2095  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  34.1 
 
 
227 aa  94  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2607  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  44.86 
 
 
226 aa  91.7  9e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2555  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  44.86 
 
 
226 aa  91.7  9e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1902  L-serine dehydratase  34.27 
 
 
455 aa  68.9  5e-11  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.457679  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0288  L-serine ammonia-lyase  34.27 
 
 
455 aa  68.9  5e-11  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1548  serine dehydratase alpha chain  29.32 
 
 
519 aa  63.9  2e-09  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  1.53411e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2740  serine dehydratase alpha chain  29.63 
 
 
460 aa  63.2  3e-09  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  1.27179e-05  hitchhiker  4.03127e-07 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3319  L-serine ammonia-lyase  29.23 
 
 
557 aa  57.8  1e-07  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0982  L-serine ammonia-lyase  33.11 
 
 
459 aa  57.8  1e-07  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1961  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  23.37 
 
 
532 aa  56.6  3e-07  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.829673  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2256  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  23.37 
 
 
532 aa  56.2  4e-07  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3038  L-serine ammonia-lyase  45.95 
 
 
459 aa  56.2  4e-07  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.883779 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3256  L-serine dehydratase 1  28.38 
 
 
456 aa  55.8  5e-07  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1236  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  26.24 
 
 
531 aa  55.1  9e-07  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.276789 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1198  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  23.66 
 
 
542 aa  54.7  1e-06  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0190635  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2402  L-serine dehydratase 1  44.16 
 
 
458 aa  54.3  2e-06  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000825911  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0239  L-serine dehydratase 1  29.65 
 
 
475 aa  53.1  3e-06  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.180472  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5758  L-serine dehydratase 1  43.42 
 
 
475 aa  52.4  5e-06  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.302413 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2251  serine dehydratase alpha chain  28.81 
 
 
454 aa  52  8e-06  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.472865  normal  0.778553 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1325  L-serine ammonia-lyase  42.86 
 
 
458 aa  51.6  1e-05  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.138393 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0527  L-serine dehydratase 1  41.03 
 
 
459 aa  51.2  1e-05  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2295  L-serine ammonia-lyase  42.86 
 
 
458 aa  51.2  1e-05  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04817  L-serine deaminase  39.33 
 
 
456 aa  50.8  1e-05  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2248  L-serine dehydratase 1  42.86 
 
 
458 aa  51.2  1e-05  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1804  L-serine ammonia-lyase  42.86 
 
 
458 aa  51.2  1e-05  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1725  L-serine ammonia-lyase  42.86 
 
 
458 aa  51.2  1e-05  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0395889 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3115  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  25.27 
 
 
535 aa  51.6  1e-05  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00187643  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1625  L-serine dehydratase 1  28.78 
 
 
457 aa  51.2  1e-05  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.701794  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12590  L-serine ammonia-lyase  45.57 
 
 
464 aa  50.8  2e-05  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.82368  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1126  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  26.32 
 
 
531 aa  50.4  2e-05  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6242  L-serine dehydratase 1  32.05 
 
 
482 aa  50.4  2e-05  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.679058  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1946  L-serine dehydratase 1  39.78 
 
 
458 aa  50.4  2e-05  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0116  L-serine dehydratase 1  44.59 
 
 
460 aa  50.1  2e-05  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.117006  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2197  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  24.48 
 
 
525 aa  50.1  3e-05  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  3.67655e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2856  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  23.94 
 
 
528 aa  49.7  3e-05  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3225  L-serine dehydratase 1  32.05 
 
 
475 aa  49.7  3e-05  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.319975 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0871  L-serine dehydratase 1  35.51 
 
 
448 aa  50.1  3e-05  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10069  L-serine dehydratase sdaA  27.62 
 
 
461 aa  49.7  3e-05  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.203084 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4132  L-serine dehydratase 1  39.5 
 
 
460 aa  50.1  3e-05  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.465086  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0423  L-serine dehydratase 1  44.87 
 
 
470 aa  50.1  3e-05  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.149927  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3483  L-serine ammonia-lyase  27.23 
 
 
458 aa  50.1  3e-05  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2171  L-serine dehydratase 1  41.56 
 
 
458 aa  49.7  4e-05  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.633035  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003155  L-serine dehydratase  30.05 
 
 
453 aa  49.7  4e-05  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.225865  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2417  L-serine dehydratase 1  41.56 
 
 
458 aa  48.9  5e-05  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2524  L-serine dehydratase 1  41.56 
 
 
458 aa  48.9  5e-05  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.418304  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2406  L-serine dehydratase 1  41.56 
 
 
458 aa  48.9  5e-05  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1942  L-serine dehydratase 1  41.56 
 
 
458 aa  48.9  5e-05  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0383387  normal  0.499337 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0329  L-serine dehydratase 1  41.03 
 
 
463 aa  48.9  6e-05  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1429  L-serine ammonia-lyase  40.26 
 
 
463 aa  48.5  7e-05  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2087  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  23.57 
 
 
535 aa  48.5  7e-05  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0521319  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0920  L-serine ammonia-lyase  40 
 
 
458 aa  48.5  8e-05  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8589  L-serine dehydratase 1  45.24 
 
 
458 aa  48.5  8e-05  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1754  L-serine ammonia-lyase  43.04 
 
 
458 aa  48.1  9e-05  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120711  normal  0.244789 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3112  serine dehydratase alpha chain  33.06 
 
 
410 aa  47.8  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0667312  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>