More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0096 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0096  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 
408 aa  810  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  4.35647e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1461  sodium:dicarboxylate symporter  52.87 
 
 
404 aa  432  1e-120  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  6.02347e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2814  sodium:dicarboxylate symporter  50.5 
 
 
400 aa  416  1e-115  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.31541e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0890  sodium:dicarboxylate symporter  53.52 
 
 
412 aa  371  1e-101  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.98283e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1599  sodium:dicarboxylate symporter  43.43 
 
 
393 aa  331  1e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0908  sodium:dicarboxylate symporter  44.36 
 
 
399 aa  322  7e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.015304  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1064  sodium:dicarboxylate symporter  48.19 
 
 
401 aa  317  3e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  1.88211e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0322  serine/threonine transporter  42.6 
 
 
392 aa  302  9e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.671125 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0914  sodium:dicarboxylate symporter  39.25 
 
 
400 aa  297  2e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.525524  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1370  sodium:dicarboxylate symporter family protein  41.44 
 
 
406 aa  281  2e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  5.79538e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2680  sodium:dicarboxylate symporter  39.75 
 
 
400 aa  280  4e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.132785  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2814  sodium:dicarboxylate symporter  38.9 
 
 
413 aa  279  7e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15760  Na+/H+ dicarboxylate symporter  38.29 
 
 
433 aa  257  3e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1183  sodium:dicarboxylate symporter family protein  40.83 
 
 
367 aa  254  1e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  8.17553e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  37.12 
 
 
432 aa  251  2e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0808  serine/threonine sodium symporter  35.71 
 
 
409 aa  224  3e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2156  sodium:dicarboxylate symporter  35.44 
 
 
401 aa  220  4e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1230  sodium:dicarboxylate symporter  31.61 
 
 
397 aa  196  8e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  1.70025e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1201  sodium:dicarboxylate symporter  33.67 
 
 
391 aa  193  5e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1223  sodium:dicarboxylate symporter family protein  34.88 
 
 
387 aa  189  6e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00163296  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1036  sodium:dicarboxylate symporter family protein  35.28 
 
 
387 aa  176  8e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  8.29053e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  28.13 
 
 
442 aa  104  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  1.32104e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  27.42 
 
 
436 aa  98.2  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  6.93951e-06  decreased coverage  2.85663e-09 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  29.29 
 
 
434 aa  95.5  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  28.64 
 
 
434 aa  94.7  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0344  serine/threonine transporter SstT  27.36 
 
 
402 aa  95.1  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000116285  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  26.24 
 
 
445 aa  94.7  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  26.32 
 
 
439 aa  93.2  8e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  26.57 
 
 
436 aa  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  2.53529e-06 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  26.7 
 
 
436 aa  89.4  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  27.53 
 
 
409 aa  89  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2655  serine/threonine transporter SstT  26.35 
 
 
406 aa  88.6  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  4.98681e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0633  Sodium:dicarboxylate symporter  31.74 
 
 
422 aa  88.6  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  27.23 
 
 
437 aa  87.8  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2015  serine/threonine transporter SstT  25.65 
 
 
408 aa  87.4  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41854  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11810  Na+/H+ dicarboxylate symporter  26.68 
 
 
440 aa  85.9  1e-15  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0215347 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0041  serine/threonine transporter SstT  25.19 
 
 
400 aa  84.7  2e-15  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0606583  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  26 
 
 
433 aa  85.1  2e-15  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0049  serine/threonine transporter SstT  25.62 
 
 
400 aa  84.3  4e-15  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.528625 
 
 
-
 
NC_002978  WD0211  hypothetical protein  26.06 
 
 
381 aa  84  4e-15  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.451987  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  25.45 
 
 
437 aa  84  5e-15  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  25 
 
 
437 aa  82.8  1e-14  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  25.6 
 
 
437 aa  82.8  1e-14  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  25.22 
 
 
437 aa  82.8  1e-14  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  26.04 
 
 
440 aa  82.4  1e-14  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  26.13 
 
 
447 aa  82.4  1e-14  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  25.52 
 
 
440 aa  81.3  3e-14  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1033  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  25.23 
 
 
430 aa  81.3  3e-14  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  3.52201e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1770  Sodium/dicarboxylate symporter  25.83 
 
 
405 aa  80.5  5e-14  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.352949  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  27.55 
 
 
449 aa  80.5  5e-14  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0209  sodium:dicarboxylate symporter  26.26 
 
 
419 aa  80.1  7e-14  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0330286  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0051  serine/threonine transporter SstT  26.11 
 
 
406 aa  79.7  8e-14  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.337249  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  25.81 
 
 
440 aa  79.7  9e-14  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  25.81 
 
 
440 aa  79.7  9e-14  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  4.96305e-05 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0155  sodium:dicarboxylate symporter  32.83 
 
 
412 aa  79.7  9e-14  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0510  sodium:dicarboxylate symporter  27.25 
 
 
425 aa  79.3  1e-13  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.249513  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0616  sodium:dicarboxylate symporter  24.4 
 
 
413 aa  78.6  2e-13  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2738  Sodium:dicarboxylate symporter  33.33 
 
 
413 aa  78.2  3e-13  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  26.03 
 
 
402 aa  77.8  3e-13  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  2.75384e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0366  sodium:dicarboxylate symporter  29.47 
 
 
457 aa  76.6  6e-13  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  5.38008e-08  hitchhiker  0.000704417 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  27.51 
 
 
434 aa  76.6  7e-13  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0229  sodium/glutamate symporter family protein, putative  25.53 
 
 
394 aa  76.6  7e-13  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.909208  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02764  hypothetical protein  25.18 
 
 
419 aa  75.9  1e-12  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0052  sodium/dicarboxylate symporter  25.58 
 
 
461 aa  75.9  1e-12  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0025  sodium/dicarboxylate symporter  25.58 
 
 
461 aa  75.9  1e-12  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.181863  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003079  proton/glutamate symporter  25.67 
 
 
419 aa  75.1  2e-12  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  2.89708e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1070  regulatory protein, ArsR  26.59 
 
 
535 aa  75.1  2e-12  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.802527  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0546  sodium:dicarboxylate symporter  31.44 
 
 
411 aa  74.7  2e-12  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1573  serine/threonine transporter SstT  26.09 
 
 
408 aa  75.5  2e-12  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1635  serine/threonine transporter SstT  23.67 
 
 
402 aa  75.5  2e-12  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000130557  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3835  excitatory amino acid transporter  27.16 
 
 
425 aa  74.7  3e-12  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0012663  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2874  serine/threonine transporter SstT  24.04 
 
 
426 aa  74.7  3e-12  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1836  sodium/proton:dicarboxylate (glutamate) symporter  26.5 
 
 
457 aa  73.9  5e-12  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  26.95 
 
 
438 aa  73.2  8e-12  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0027  sodium/dicarboxylate symporter  25.35 
 
 
461 aa  72.8  1e-11  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2400  sodium:dicarboxylate symporter  23.36 
 
 
439 aa  72.4  1e-11  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  6.28072e-12  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  24.83 
 
 
445 aa  72.8  1e-11  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.126443  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02547  proton/glutamate symporter  27.05 
 
 
417 aa  71.6  2e-11  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1052  serine/threonine transporter SstT  25.36 
 
 
408 aa  72  2e-11  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1020  sodium--dicarboxylate symporter  26.62 
 
 
479 aa  71.6  2e-11  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2121  sodium:dicarboxylate symporter  28.82 
 
 
457 aa  72  2e-11  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.343777  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0397  sodium:dicarboxylate symporter  26.45 
 
 
409 aa  72  2e-11  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  2.67322e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3995  sodium:dicarboxylate symporter  26.45 
 
 
434 aa  72  2e-11  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.845603  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1194  hypothetical protein  28.35 
 
 
444 aa  71.2  3e-11  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654767 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  26.43 
 
 
410 aa  71.2  3e-11  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  6.77504e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  25.3 
 
 
441 aa  71.2  3e-11  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001096  sodium/dicarboxylate symporter  25.19 
 
 
405 aa  70.9  4e-11  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1055  sodium:dicarboxylate symporter  24.57 
 
 
417 aa  70.9  4e-11  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2336  sodium/dicarboxylate symporter family protein  24.94 
 
 
423 aa  70.9  4e-11  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  2.34302e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0720  serine/threonine transporter SstT  25.83 
 
 
409 aa  70.9  4e-11  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.881577  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0230  serine/threonine transporter SstT  26.94 
 
 
413 aa  70.9  4e-11  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1993  Sodium:dicarboxylate symporter  24.32 
 
 
405 aa  70.5  5e-11  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1115  serine/threonine transporter SstT  25.91 
 
 
407 aa  70.5  5e-11  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1330  sodium:dicarboxylate symporter  26.82 
 
 
417 aa  70.5  5e-11  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1104  serine/threonine transporter SstT  24.11 
 
 
414 aa  70.5  6e-11  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.333475  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1353  excitatory amino acid transporter  28.01 
 
 
427 aa  70.1  6e-11  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  23.43 
 
 
444 aa  70.1  7e-11  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  23.19 
 
 
444 aa  70.1  8e-11  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  23.43 
 
 
444 aa  70.1  8e-11  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46672  predicted protein  30.91 
 
 
1347 aa  69.7  1e-10  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.390324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>