More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0093 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0093  fumarate lyase  100 
 
 
454 aa  929  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0337943  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0424  fumarate hydratase  56.86 
 
 
463 aa  523  1e-147  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1366  fumarate hydratase  55.56 
 
 
463 aa  516  1e-145  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.862526  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1556  fumarate hydratase  55.34 
 
 
463 aa  515  1e-145  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.433937  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0285  fumarate hydratase  55.34 
 
 
463 aa  516  1e-145  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1120  fumarate hydratase  51.97 
 
 
456 aa  486  1e-136  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1627  fumarate hydratase  51.97 
 
 
468 aa  481  1e-134  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2918  fumarate hydratase, class II  51.87 
 
 
464 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3201  fumarate hydratase, class II  52.09 
 
 
464 aa  477  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1007  fumarate hydratase  50 
 
 
463 aa  475  1e-133  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0281395  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1449  fumarate hydratase  50.22 
 
 
513 aa  473  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.352432 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1387  fumarate hydratase  50 
 
 
461 aa  474  1e-132  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.987993  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  50.22 
 
 
459 aa  473  1e-132  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3561  fumarate hydratase  50.22 
 
 
462 aa  468  1e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  50.88 
 
 
471 aa  470  1e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1724  fumarate hydratase  49.89 
 
 
513 aa  469  1e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.90897  decreased coverage  0.00664146 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  50.22 
 
 
459 aa  471  1e-131  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1637  fumarate hydratase  50.44 
 
 
462 aa  465  1e-130  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.156374  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1415  fumarate hydratase  50.44 
 
 
462 aa  467  1e-130  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.566531  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1841  fumarate hydratase  50.44 
 
 
462 aa  466  1e-130  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194885  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1767  fumarate hydratase  50.44 
 
 
462 aa  465  1e-130  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1587  fumarate hydratase  50.22 
 
 
462 aa  465  1e-130  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1174  fumarate hydratase  51.1 
 
 
462 aa  465  1e-130  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.715277  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0494  fumarate hydratase, class II  53.49 
 
 
464 aa  467  1e-130  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.172647  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2882  fumarate hydratase  50.22 
 
 
463 aa  465  1e-130  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.405622  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1895  fumarate hydratase  50.44 
 
 
462 aa  466  1e-130  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0261938  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1783  fumarate hydratase  50 
 
 
462 aa  462  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1939  fumarate hydratase  49.34 
 
 
461 aa  463  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1905  fumarate hydratase  49.34 
 
 
461 aa  463  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0427155  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1819  fumarate hydratase  50.22 
 
 
462 aa  464  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1328  fumarate hydratase  51.21 
 
 
469 aa  464  1e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal  0.832729 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3664  fumarate hydratase  50.43 
 
 
462 aa  462  1e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1452  fumarate hydratase  50.22 
 
 
465 aa  462  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1617  fumarate hydratase  50.22 
 
 
462 aa  464  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  49.89 
 
 
461 aa  462  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  50.55 
 
 
465 aa  459  1e-128  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  49.24 
 
 
461 aa  459  1e-128  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1636  fumarate hydratase  50 
 
 
462 aa  459  1e-128  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0545327  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  49.24 
 
 
461 aa  459  1e-128  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1975  fumarate hydratase  49.67 
 
 
462 aa  459  1e-128  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00792207  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04621  fumarate hydratase  49.01 
 
 
465 aa  457  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6106  fumarate hydratase  49.89 
 
 
474 aa  456  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2866  fumarate hydratase  50.44 
 
 
463 aa  457  1e-127  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1795  fumarate hydratase, class II  50.65 
 
 
465 aa  458  1e-127  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1491  fumarate hydratase  50.11 
 
 
461 aa  457  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0535004  normal  0.876261 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3005  fumarate hydratase  50.22 
 
 
464 aa  455  1e-127  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16461  fumarate hydratase  49.56 
 
 
461 aa  455  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3661  fumarate hydratase  50.44 
 
 
464 aa  452  1e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.42486 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0965  fumarate hydratase, class II  49.57 
 
 
465 aa  454  1e-126  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0975  fumarate hydratase  50.88 
 
 
463 aa  452  1e-126  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.526915  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1057  fumarate hydratase  51.52 
 
 
463 aa  454  1e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1731  fumarate hydratase, class II  50.22 
 
 
464 aa  451  1e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31099  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2334  fumarate hydratase  50.66 
 
 
465 aa  453  1e-126  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00667023  normal  0.148736 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3215  fumarate hydratase, class II  49.12 
 
 
468 aa  453  1e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587959  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2138  fumarate hydratase  49.56 
 
 
464 aa  452  1e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1657  fumarate hydratase  49.78 
 
 
467 aa  452  1e-126  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000112707  normal  0.675256 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1894  fumarate hydratase  49.56 
 
 
467 aa  451  1e-126  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0017878  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0997  fumarate hydratase  48.58 
 
 
464 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0355  fumarate hydratase  49.78 
 
 
463 aa  449  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0771995  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0721  fumarate hydratase  49.34 
 
 
464 aa  451  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.764225 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1102  fumarate hydratase  50 
 
 
464 aa  451  1e-125  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0376  fumarate hydratase  50.87 
 
 
461 aa  448  1e-125  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85745  fumarase  50.76 
 
 
463 aa  450  1e-125  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2891  fumarate hydratase, class II  47.49 
 
 
472 aa  451  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16681  fumarate hydratase  49.12 
 
 
461 aa  450  1e-125  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.120243  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0174  fumarate hydratase  49.34 
 
 
478 aa  448  1e-125  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000137978  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2664  fumarate hydratase, class II  47.28 
 
 
472 aa  449  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613599  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1049  fumarate hydratase  49.24 
 
 
463 aa  451  1e-125  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.62891  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1559  fumarate hydratase  49.12 
 
 
461 aa  451  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4521  fumarate hydratase, class II  48.03 
 
 
469 aa  450  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0192  fumarate hydratase  49.56 
 
 
463 aa  450  1e-125  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1696  fumarate hydratase  50.55 
 
 
458 aa  450  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397787  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1667  fumarate hydratase  47.28 
 
 
462 aa  449  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2040  fumarate hydratase  49.12 
 
 
465 aa  446  1e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  48.9 
 
 
474 aa  446  1e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2694  fumarate hydratase, class II  48.7 
 
 
466 aa  446  1e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.650126  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3242  fumarate hydratase, class II  50.22 
 
 
465 aa  447  1e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0083  fumarate hydratase  49.45 
 
 
466 aa  447  1e-124  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0238  fumarate hydratase, class II  49.13 
 
 
466 aa  447  1e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3022  fumarate hydratase  48.68 
 
 
463 aa  446  1e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2471  fumarate hydratase  48.58 
 
 
462 aa  446  1e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1686  fumarate hydratase  49.12 
 
 
467 aa  446  1e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.569967  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2137  fumarate hydratase  48.47 
 
 
465 aa  448  1e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16561  fumarate hydratase  48.68 
 
 
461 aa  447  1e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1901  fumarate hydratase  48.03 
 
 
470 aa  447  1e-124  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687119  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1908  fumarate hydratase  50.43 
 
 
465 aa  445  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.856676  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4795  fumarate hydratase, class II  49.45 
 
 
464 aa  442  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  48.46 
 
 
463 aa  444  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2341  fumarate hydratase  48.68 
 
 
465 aa  442  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2054  fumarate hydratase  49.89 
 
 
465 aa  443  1e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2881  fumarate hydratase  48.35 
 
 
468 aa  444  1e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2816  fumarate hydratase, class II  48.48 
 
 
467 aa  443  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2270  fumarate hydratase  49.34 
 
 
465 aa  442  1e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0420  fumarate hydratase  49.34 
 
 
463 aa  441  1e-123  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.425613  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2786  fumarate hydratase, class II  47.71 
 
 
472 aa  444  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.347801 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1568  fumarate hydratase  48.9 
 
 
467 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366448  normal  0.0865298 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1705  fumarate hydratase  48.9 
 
 
467 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0627343  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1189  fumarate hydratase, class II  48.7 
 
 
466 aa  444  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0920131 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1578  fumarate hydratase  48.9 
 
 
467 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.952 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34880  fumarate hydratase  50.66 
 
 
464 aa  443  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143963  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>