More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0086 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0086  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 
223 aa  442  1e-123  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  4.30601e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0776  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.92 
 
 
224 aa  221  5e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0107208  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.08 
 
 
226 aa  219  4e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0196  two component transcriptional regulator  48.17 
 
 
226 aa  214  9e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  42.66 
 
 
223 aa  180  2e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.11 
 
 
224 aa  177  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  41.36 
 
 
235 aa  173  1e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2625  two component transcriptional regulator  40.72 
 
 
231 aa  174  1e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.983258  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02297  response regulator in two-component regulatory system with PhoQ  43.64 
 
 
224 aa  174  1e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  45 
 
 
222 aa  172  3e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1026  two component transcriptional regulator  40.37 
 
 
224 aa  171  8e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000442073 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  40.45 
 
 
283 aa  170  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  39.09 
 
 
220 aa  168  7e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0535  two component transcriptional regulator  42.66 
 
 
223 aa  167  8e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.660155  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1694  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.82 
 
 
217 aa  167  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00296965  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3061  two component transcriptional regulator  42.08 
 
 
229 aa  167  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296421  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3379  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.01 
 
 
223 aa  166  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1581  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  40.45 
 
 
223 aa  166  3e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.304003  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1332  response regulator receiver  37.84 
 
 
224 aa  166  3e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  40.54 
 
 
223 aa  166  4e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  4.06961e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1620  two component transcriptional regulator  40.71 
 
 
228 aa  165  5e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1416  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.84 
 
 
225 aa  165  6e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1445  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.84 
 
 
225 aa  165  6e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8629  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.09 
 
 
218 aa  165  6e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0375098  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.09 
 
 
220 aa  164  8e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2474  heavy metal response regulator  41.1 
 
 
223 aa  164  9e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  41.26 
 
 
240 aa  164  1e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  1.11909e-05  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2298  winged helix family two component transcriptional regulator  43.44 
 
 
217 aa  164  1e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.359979 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0440  two component transcriptional regulator  38.12 
 
 
225 aa  163  2e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.747409  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0800  response regulator receiver  39.82 
 
 
224 aa  163  2e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.271408  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.46 
 
 
224 aa  163  2e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0451  two component heavy metal response transcriptional regulator  39.82 
 
 
230 aa  163  2e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.91 
 
 
225 aa  163  2e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0003  response regulator receiver  41.96 
 
 
235 aa  163  2e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1185  response regulator receiver  41.33 
 
 
225 aa  162  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1941  response regulator receiver  42.27 
 
 
217 aa  162  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.46 
 
 
224 aa  162  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2259  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.18 
 
 
225 aa  162  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2714  DNA-binding response regulator  41.1 
 
 
228 aa  162  4e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.462686  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  39.46 
 
 
224 aa  162  4e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1294  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.73 
 
 
218 aa  162  5e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476117  hitchhiker  0.00354598 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1236  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.18 
 
 
219 aa  161  6e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4171  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.82 
 
 
225 aa  162  6e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3931  two component transcriptional regulator  38.18 
 
 
221 aa  161  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4436  two component transcriptional regulator  42.27 
 
 
227 aa  161  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.177006  normal  0.889846 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2454  transcriptional regulator domain protein  37.84 
 
 
224 aa  161  7e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.02572  normal  0.811367 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 
224 aa  161  9e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  9.34276e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0936  two component transcriptional regulator  39.55 
 
 
225 aa  161  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.966492  normal  0.099028 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0799  two component transcriptional regulator  41.26 
 
 
225 aa  160  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3444  two component transcriptional regulator  40.45 
 
 
220 aa  160  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112849  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5325  two component transcriptional regulator  37.27 
 
 
221 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.36 
 
 
231 aa  160  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1171  transcriptional regulatory protein YedW  40.91 
 
 
226 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5097  two component transcriptional regulator  37.73 
 
 
221 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.361428  normal  0.112132 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3495  two component transcriptional regulator  37.27 
 
 
221 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.972301  normal  0.0200045 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.56 
 
 
224 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3423  response regulator receiver protein  38.18 
 
 
224 aa  159  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.699539  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1476  two component transcriptional regulator  41.82 
 
 
219 aa  159  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1505  response regulator receiver  41.82 
 
 
219 aa  159  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.404603  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3985  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  40.37 
 
 
226 aa  159  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1244  DNA-binding response regulator  38.01 
 
 
219 aa  159  4e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  5.51267e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  39.09 
 
 
220 aa  159  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1407  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.36 
 
 
225 aa  159  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.440596  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1160  transcriptional regulatory protein YedW  40.91 
 
 
226 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.728212 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1055  transcriptional regulatory protein YedW  40.91 
 
 
226 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  39.19 
 
 
223 aa  159  4e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2526  two component transcriptional regulator  37.73 
 
 
221 aa  159  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3067  two component transcriptional regulator  40.37 
 
 
224 aa  159  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43316  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1685  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.36 
 
 
225 aa  158  5e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00118059  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1411  response regulator receiver  41.36 
 
 
225 aa  158  5e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.110033 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2840  two component transcriptional regulator  41.82 
 
 
226 aa  158  6e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6946  two component transcriptional regulator  39.09 
 
 
219 aa  158  6e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.383627 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5939  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.09 
 
 
218 aa  158  6e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1358  two component response regulator  41.36 
 
 
224 aa  158  6e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0354  putative two-component response regulator  41.1 
 
 
228 aa  158  6e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0481985  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3589  two component transcriptional regulator  37.73 
 
 
221 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106176  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4055  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  39.91 
 
 
226 aa  158  6e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1631  two component transcriptional regulator  38.94 
 
 
227 aa  158  6e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0039171  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2126  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.37 
 
 
224 aa  158  7e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.245988  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2337  two component heavy metal response transcriptional regulator  39.37 
 
 
227 aa  158  7e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0655  two component response regulator transcription regulator protein  40.18 
 
 
228 aa  158  7e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.81937 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1841  two component transcriptional regulator  41.36 
 
 
216 aa  158  7e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0207334  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4465  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  42.29 
 
 
206 aa  158  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0436659 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0604  two component transcriptional regulator  35.71 
 
 
227 aa  158  8e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00704602  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5130  OmpR/winged helix family two component transcriptional regulator  39.55 
 
 
223 aa  158  8e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.76336  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27810  putative two-component response regulator  37.95 
 
 
226 aa  157  8e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0632  two component transcriptional regulator  35.71 
 
 
227 aa  158  8e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157641  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2348  putative two-component response regulator  38.39 
 
 
228 aa  157  9e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2946  DNA-binding heavy metal response regulator  39.46 
 
 
223 aa  157  9e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001641  putative two component response regulator transcription regulator protein  38.33 
 
 
230 aa  157  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.170142  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02658  hypothetical protein  38.64 
 
 
219 aa  157  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2927  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.22 
 
 
224 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2122  DNA-binding response regulator  40.72 
 
 
223 aa  157  2e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0019  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.64 
 
 
225 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593373  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.64 
 
 
225 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0468746 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1496  response regulator receiver  36.77 
 
 
222 aa  156  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.23196  normal  0.62159 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2674  two component transcriptional regulator  39.09 
 
 
230 aa  156  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238816  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1307  DNA-binding heavy metal response regulator  41.74 
 
 
225 aa  156  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150056  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  38.12 
 
 
224 aa  157  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0428  transcriptional regulator FeuP  40.45 
 
 
221 aa  156  2e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.461578  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>