More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0076 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0076  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 
233 aa  476  1e-133  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  37.55 
 
 
241 aa  162  6e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  37.12 
 
 
241 aa  160  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
239 aa  153  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
239 aa  153  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  34.91 
 
 
245 aa  147  1e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0114  transcriptional regulator  36.64 
 
 
239 aa  139  4e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  1.19312e-17 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  34.63 
 
 
242 aa  128  8e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
248 aa  127  2e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  34.22 
 
 
249 aa  127  2e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  32.6 
 
 
255 aa  126  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  32.14 
 
 
269 aa  120  1e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3697  transcriptional regulator, GntR family  32.17 
 
 
246 aa  119  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  32.3 
 
 
242 aa  118  8e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 
248 aa  117  1e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  33.63 
 
 
243 aa  117  2e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  30.8 
 
 
268 aa  116  2e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 
243 aa  117  2e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 
243 aa  117  2e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 
243 aa  117  2e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 
243 aa  117  2e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  31.86 
 
 
239 aa  117  2e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  35.32 
 
 
247 aa  116  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  30.87 
 
 
244 aa  115  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3410  transcriptional regulator, GntR family  32.16 
 
 
245 aa  113  2e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  4.05117e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  32.02 
 
 
243 aa  114  2e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1330  transcriptional regulator, GntR family  31.49 
 
 
240 aa  112  4e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  31.2 
 
 
242 aa  112  7e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
225 aa  111  8e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1251  GntR family transcriptional regulator  28.69 
 
 
245 aa  110  1e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116745  normal  0.0613053 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  30.09 
 
 
252 aa  106  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1359  GntR family transcriptional regulator  31.42 
 
 
249 aa  105  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  29 
 
 
243 aa  105  6e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2009  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  29.91 
 
 
246 aa  105  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.378179  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1554  GntR family transcriptional regulator  31.17 
 
 
241 aa  103  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00139668  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0722  GntR family transcriptional regulator  28.31 
 
 
245 aa  102  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3168  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 
244 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0551  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 
244 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1450  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 
244 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0720  GntR family regulatory protein  30.84 
 
 
244 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.035737  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2878  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 
244 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0138  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 
244 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.417671  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0214  GntR family transcriptional regulator  28.45 
 
 
241 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.892015  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1800  GntR family transcriptional regulator  28.45 
 
 
241 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00723826  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1390  GntR family transcriptional regulator  28.45 
 
 
241 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1885  GntR family transcriptional regulator  28.45 
 
 
241 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0949  GntR family transcriptional regulator  28.45 
 
 
241 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0431  GntR family transcriptional regulator  28.45 
 
 
241 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5190  GntR family transcriptional regulator  29.38 
 
 
240 aa  102  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.702411  normal  0.0588532 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0349  transcriptional regulatory protein  29.58 
 
 
277 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1096  GntR family transcriptional regulator  29.58 
 
 
277 aa  101  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113015  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0478  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 
244 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0696996  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2743  GntR family transcriptional regulator  30.4 
 
 
244 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.927097  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0446  GntR family transcriptional regulator  30.4 
 
 
244 aa  101  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2450  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 
258 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  2.63261e-06 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2860  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 
249 aa  100  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0763  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 
248 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237996 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2580  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 
258 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.496201  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2634  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
245 aa  100  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.864303 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0534  GntR family transcriptional regulator  30.4 
 
 
244 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.237769  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  29.55 
 
 
244 aa  100  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6155  GntR family transcriptional regulator  29.96 
 
 
244 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.272713  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0754  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
248 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304598  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3873  transcriptional regulator, GntR family  31.49 
 
 
244 aa  99.8  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2257  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
248 aa  99.4  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2130  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
248 aa  99.4  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0949  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
248 aa  99.4  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1100  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
248 aa  99.4  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.100378  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0946  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
248 aa  99.4  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406281  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0552  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
248 aa  99.4  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689242  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2885  GntR family transcriptional regulator  30.4 
 
 
244 aa  99  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.790974  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2556  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 
248 aa  99  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000796144 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0560  transcriptional regulator, GntR family  31.28 
 
 
244 aa  99.4  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.645686  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5864  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 
248 aa  99  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1920  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 
248 aa  99  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2532  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 
248 aa  99  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00685301  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  27.72 
 
 
233 aa  99  6e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4156  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 
244 aa  98.6  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  29.39 
 
 
266 aa  98.6  8e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2212  GntR family transcriptional regulator  30.4 
 
 
244 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.189171  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2836  GntR family transcriptional regulator  30.4 
 
 
244 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2825  GntR family transcriptional regulator  30.4 
 
 
244 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.214074  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  29.65 
 
 
235 aa  97.4  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  29.33 
 
 
232 aa  97.1  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3408  GntR family transcriptional regulator  29.96 
 
 
254 aa  97.4  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  27.63 
 
 
256 aa  97.4  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  27.63 
 
 
256 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  27.63 
 
 
256 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  27.63 
 
 
258 aa  96.7  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
247 aa  95.9  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0552  GntR family transcriptional regulator  32.6 
 
 
248 aa  95.9  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0339408 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04320  transcriptional regulator GntR family  28.89 
 
 
240 aa  95.5  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0783  GntR family transcriptional regulator  32.6 
 
 
248 aa  95.1  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  27.63 
 
 
256 aa  95.1  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  28.07 
 
 
244 aa  94.7  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5635  transcriptional regulator, GntR family  26.41 
 
 
248 aa  94.7  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.613764  normal  0.0151666 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3182  transcriptional regulator, GntR family  32.16 
 
 
248 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.659988  hitchhiker  0.001615 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  27.19 
 
 
256 aa  94.4  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4125  transcriptional regulator, GntR family  28.02 
 
 
240 aa  93.6  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0292  GntR family transcriptional regulator  29.96 
 
 
244 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>