190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0075 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0075  sugar isomerase (SIS)  100 
 
 
377 aa  763  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0115  phosphosugar isomerase  50.26 
 
 
388 aa  366  1e-100  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  4.67069e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2108  putative tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase  48.53 
 
 
388 aa  352  5e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1062  sugar isomerase (SIS)  48.39 
 
 
388 aa  330  2e-89  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.316402  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1639  tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase  39.64 
 
 
395 aa  286  4e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3328  AgaS family sugar isomerase  40.57 
 
 
384 aa  284  2e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0562  AgaS family sugar isomerase  40.57 
 
 
384 aa  284  2e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0569  sugar isomerase, AgaS family  40.57 
 
 
384 aa  284  2e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.117489  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3435  AgaS family sugar isomerase  40.83 
 
 
384 aa  283  3e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3618  AgaS family sugar isomerase  40.31 
 
 
384 aa  283  5e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02954  hypothetical protein  40.31 
 
 
384 aa  283  5e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03003  tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase  40.31 
 
 
384 aa  283  5e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2600  sugar isomerase (SIS)  39.58 
 
 
386 aa  281  9e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.792182  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1904  tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase, putative  38.86 
 
 
395 aa  281  1e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.767502  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4453  putative sugar isomerase, AgaS family  40.31 
 
 
384 aa  281  1e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.24237  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2392  sugar isomerase, AgaS family  42.36 
 
 
384 aa  281  2e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2533  sugar isomerase (SIS)  39.32 
 
 
386 aa  280  3e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3815  sugar isomerase (SIS)  39.84 
 
 
384 aa  280  3e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.994709  normal  0.536429 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2699  sugar isomerase (SIS)  39.06 
 
 
386 aa  280  3e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3577  sugar isomerase (SIS)  41.07 
 
 
380 aa  278  1e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.311129  normal  0.344534 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2758  sugar isomerase (SIS)  42.06 
 
 
376 aa  271  2e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0147  sugar isomerase (SIS)  41.07 
 
 
384 aa  269  7e-71  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0318  sugar isomerase (SIS)  40.71 
 
 
387 aa  264  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500662  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2644  sugar isomerase domain-containing protein  40.64 
 
 
390 aa  261  1e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2578  sugar isomerase AgaS  35.17 
 
 
388 aa  260  4e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.962598  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1707  sugar isomerase (SIS)  39.13 
 
 
384 aa  257  3e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2961  putative sugar isomerase  39.3 
 
 
390 aa  256  5e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1196  phosphosugar isomerase  37.2 
 
 
397 aa  252  6e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.570521 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0941  putative tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase AgaS  39.73 
 
 
388 aa  239  5e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0993  AgaS family sugar isomerase  39.73 
 
 
388 aa  239  5e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.491243  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3375  putative tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase AgaS  39.73 
 
 
388 aa  238  2e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.521298 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0665  sugar isomerase (SIS)  30.11 
 
 
400 aa  179  5e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0139  Glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  24.44 
 
 
354 aa  87.8  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0323  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.92 
 
 
586 aa  70.1  6e-11  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4761  sugar isomerase (SIS)  25.36 
 
 
317 aa  68.6  2e-10  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2822  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.22 
 
 
610 aa  64.7  2e-09  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0039  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.93 
 
 
610 aa  64.7  2e-09  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5362  sugar isomerase (SIS)  27.03 
 
 
317 aa  63.5  6e-09  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.56285 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001643  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  24.46 
 
 
610 aa  61.6  2e-08  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0244363  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00831  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.33 
 
 
610 aa  61.6  2e-08  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0113  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  25.41 
 
 
330 aa  59.7  8e-08  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0115  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  23.53 
 
 
330 aa  58.9  2e-07  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2686  Glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  25.89 
 
 
346 aa  57.4  4e-07  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0557  glutamine amidotransferase class-II  23.26 
 
 
595 aa  57  5e-07  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0217715 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0836  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  21.65 
 
 
607 aa  57  5e-07  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1481  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.37 
 
 
603 aa  56.6  8e-07  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1372  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.32 
 
 
613 aa  55.8  1e-06  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.742215  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5196  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.17 
 
 
611 aa  55.1  2e-06  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.118188  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0218  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.35 
 
 
603 aa  55.1  2e-06  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7717  Glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  21.64 
 
 
348 aa  54.3  3e-06  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2759  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  24.85 
 
 
673 aa  54.7  3e-06  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.202066  normal  0.017442 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03884  Glucosamine-fructose-6-phosphate aminotransferase  22.58 
 
 
610 aa  53.9  4e-06  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0832  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  23.44 
 
 
353 aa  53.9  5e-06  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0379  sugar isomerase (SIS)  26.51 
 
 
329 aa  53.9  5e-06  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0772  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  24.42 
 
 
608 aa  53.5  5e-06  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.900207  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4942  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  22.26 
 
 
610 aa  53.9  5e-06  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3881  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  23.56 
 
 
610 aa  53.9  5e-06  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2606  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.51 
 
 
608 aa  53.5  6e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.659057  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0727  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.27 
 
 
602 aa  53.5  6e-06  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0085  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  26.43 
 
 
611 aa  53.1  7e-06  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.800313  normal  0.506708 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5427  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.87 
 
 
611 aa  53.1  8e-06  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.15944  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0471  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.12 
 
 
601 aa  52.8  9e-06  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4166  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.81 
 
 
608 aa  52.8  9e-06  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0138  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  23.86 
 
 
612 aa  52.4  1e-05  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.266568  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5291  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.85 
 
 
611 aa  52.4  1e-05  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268199  normal  0.456401 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1991  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  26.25 
 
 
610 aa  51.6  2e-05  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4486  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  23.06 
 
 
607 aa  51.6  2e-05  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.503436 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2418  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  24.66 
 
 
608 aa  51.6  2e-05  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316108  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5409  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.85 
 
 
611 aa  52  2e-05  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.323982  hitchhiker  0.00848262 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0693  sugar isomerase (SIS)  25.49 
 
 
302 aa  51.6  2e-05  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0808  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.62 
 
 
609 aa  50.8  3e-05  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3302  D-fructose-6-phosphate amidotransferase  24.4 
 
 
608 aa  51.2  3e-05  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4559  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.12 
 
 
613 aa  50.8  3e-05  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.313422  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1517  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.01 
 
 
608 aa  50.8  4e-05  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0607297 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0425  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.01 
 
 
599 aa  50.4  4e-05  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4136  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.36 
 
 
609 aa  50.8  4e-05  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0361576  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0011  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.11 
 
 
609 aa  50.4  4e-05  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.855162  normal  0.0514603 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1359  putative aminotransferase  25.72 
 
 
340 aa  50.8  4e-05  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3948  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  23.84 
 
 
611 aa  50.8  4e-05  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.739647  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3511  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  24.34 
 
 
607 aa  50.4  5e-05  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.298041  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0203  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.47 
 
 
606 aa  50.4  6e-05  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1846  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.25 
 
 
612 aa  50.1  6e-05  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000269055  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0502  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  25 
 
 
593 aa  50.1  6e-05  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2057  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.55 
 
 
608 aa  49.7  8e-05  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.776595  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2618  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.3 
 
 
608 aa  49.7  9e-05  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120627 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0095  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  23.4 
 
 
620 aa  49.7  9e-05  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00607775 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0104  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.69 
 
 
609 aa  49.3  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  5.21795e-05  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0944  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  26.79 
 
 
604 aa  48.9  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00787508  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0284  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.13 
 
 
598 aa  49.3  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1558  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.13 
 
 
598 aa  49.3  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.996427  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1224  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  24.66 
 
 
596 aa  49.3  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1238  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  23.16 
 
 
613 aa  49.3  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.851914  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5899  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  24.1 
 
 
639 aa  49.3  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2934  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.62 
 
 
608 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.729718  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1706  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  25.42 
 
 
610 aa  48.5  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3839  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.12 
 
 
609 aa  48.1  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000251004 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3186  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.73 
 
 
602 aa  48.1  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2017  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.6 
 
 
603 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.851837  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1368  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.13 
 
 
598 aa  48.9  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0755  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.47 
 
 
607 aa  48.1  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.255039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>