More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0073 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0073  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 
249 aa  494  1e-139  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1936  lactose phosphotransferase system repressor  45.24 
 
 
258 aa  207  1e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.673749  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D07  lactose transport regulator  43.25 
 
 
255 aa  203  2e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0321  transcriptional regulator, DeoR family  40.73 
 
 
252 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000571989  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3388  transcriptional regulator, DeoR family  41.45 
 
 
248 aa  181  7e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000207946  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3454  transcriptional regulator, DeoR family  41.13 
 
 
252 aa  181  1e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2227  DeoR family transcriptional regulator  42.39 
 
 
263 aa  181  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2266  lactose phosphotransferase system repressor  42.39 
 
 
263 aa  181  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1796  lactose phosphotransferase system repressor  42.04 
 
 
251 aa  175  6e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0491  lactose transport regulator  35.98 
 
 
254 aa  166  4e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0039  transcriptional regulator, DeoR family  37.92 
 
 
247 aa  156  3e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000112771  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7919  transcriptional regulator, DeoR family  29.84 
 
 
267 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  31.45 
 
 
254 aa  139  4.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1348  lactose phosphotransferase system repressor  33.47 
 
 
247 aa  137  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2107  transcriptional regulator, DeoR family  30.68 
 
 
263 aa  135  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  35.32 
 
 
274 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0444  transcriptional repressor  34.93 
 
 
248 aa  132  3.9999999999999996e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000146734  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  33.2 
 
 
250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0566  DeoR family transcriptional regulator  35.12 
 
 
248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0552  transcription repressor of fructose operon fruR  35.54 
 
 
248 aa  129  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0344  transcriptional regulator, DeoR family  33.19 
 
 
252 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273291  hitchhiker  0.00282371 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  30.08 
 
 
260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  34.71 
 
 
256 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  31.97 
 
 
258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4905  transcriptional regulator, DeoR family  28.51 
 
 
289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.23552  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  29.44 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0618  transcriptional regulator, DeoR family  30.29 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  30.08 
 
 
252 aa  126  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2651  transcriptional regulator, DeoR family  31.9 
 
 
250 aa  125  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  30.89 
 
 
255 aa  125  8.000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3746  DeoR family transcriptional regulator  31.88 
 
 
250 aa  122  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.193634  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3484  DeoR family transcriptional regulator  32.31 
 
 
250 aa  122  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3728  transcriptional regulator, DeoR family  31.88 
 
 
250 aa  122  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0938200000000001e-23 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3464  DeoR family transcriptional regulator  31.88 
 
 
250 aa  122  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.060448  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3257  transcriptional regulator, DeoR family  36.69 
 
 
251 aa  122  5e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.9425  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0995  transcriptional regulator, DeoR family  31.62 
 
 
264 aa  122  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.103879  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2396  DeoR family transcriptional regulator  32.75 
 
 
249 aa  122  7e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.71278  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5344  transcriptional regulator, DeoR family  29.84 
 
 
290 aa  122  7e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3478  DeoR family transcriptional regulator  31.88 
 
 
250 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  31.6 
 
 
264 aa  120  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1031  lactose transport regulator  36.02 
 
 
233 aa  121  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.227139  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3818  transcriptional regulator, DeoR family  31.2 
 
 
250 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00596962  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3565  DeoR family transcriptional regulator  31.88 
 
 
250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3769  transcriptional regulator, DeoR family  31.88 
 
 
250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000230388  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3848  DeoR family transcriptional regulator  31.88 
 
 
250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  31.2 
 
 
256 aa  120  3e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  27.87 
 
 
257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  34.75 
 
 
257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002674  glycerol-3-phosphate regulon repressor DeoR family  32.2 
 
 
263 aa  119  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1484  transcriptional regulator, DeoR family  31 
 
 
250 aa  118  7e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.502368  normal  0.0131376 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  28.11 
 
 
282 aa  118  7.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0635  DeoR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
247 aa  118  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000201895  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1510  transcriptional regulator, DeoR family  32.33 
 
 
250 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000196548  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3139  transcriptional regulator, DeoR family  28.57 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3032  DeoR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2873  DeoR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0977  DeoR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.96922  normal  0.682272 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  31.36 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0953  transcriptional regulator, DeoR family  29.17 
 
 
255 aa  116  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3971  transcriptional regulator, DeoR family  30.77 
 
 
262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.229273  normal  0.573727 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0011  sugar metabolism transcriptional regulator  30.61 
 
 
252 aa  115  3.9999999999999997e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2488  transcriptional regulator, DeoR family  28.38 
 
 
265 aa  115  6e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1644  DeoR family transcriptional regulator  32.79 
 
 
251 aa  115  6e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02585  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.17 
 
 
265 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02550  hypothetical protein  28.17 
 
 
265 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  31.3 
 
 
267 aa  115  7.999999999999999e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  29.92 
 
 
253 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1220  DeoR family transcriptional regulator  29.1 
 
 
252 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0722  DeoR family transcriptional regulator  34.98 
 
 
253 aa  115  8.999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0738  regulatory protein DeoR  34.98 
 
 
253 aa  115  8.999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1728  lactose transport regulator  33.19 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  29.08 
 
 
253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03314  transcriptional regulator  30.31 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0617  DeoR family transcriptional regulator  34.74 
 
 
244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0340612  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3382  DeoR family transcriptional regulator  29.53 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  29.91 
 
 
253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0357  DeoR family transcriptional regulator  32.91 
 
 
252 aa  113  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.912716  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  28.63 
 
 
254 aa  112  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3057  regulatory protein, DeoR  28.05 
 
 
278 aa  112  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111728  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0590  transcriptional regulator, DeoR family  32.11 
 
 
247 aa  112  5e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  31.38 
 
 
266 aa  112  6e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  33.33 
 
 
254 aa  112  7.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3108  DeoR family transcriptional regulator  27.92 
 
 
254 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0146  DeoR family transcriptional regulator  25.71 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3228  DeoR family transcriptional regulator  27.5 
 
 
254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  28.33 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5310  transcriptional regulator, DeoR family  29.15 
 
 
253 aa  110  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5588  DeoR family transcriptional regulator  28 
 
 
252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.677206  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3040  transcriptional regulator, DeoR family  27.5 
 
 
254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0131  DeoR family transcriptional regulator  25.71 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2761  transcriptional regulator, DeoR family  31.2 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3069  transcriptional regulator, DeoR family  27.5 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1854  regulatory protein, DeoR  28.27 
 
 
252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000517285  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3260  transcriptional regulator, DeoR family  32.81 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117274  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  28.74 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3124  DeoR family transcriptional regulator  27.5 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0605743 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3446  DeoR family transcriptional regulator  31.48 
 
 
252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  28.74 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0313  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.24 
 
 
252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  28.74 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>