259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0070 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0070  galactose-6-phosphate isomerase subunit LacB  100 
 
 
176 aa  358  3e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  1.49222e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2264  galactose-6-phosphate isomerase subunit LacB  67.05 
 
 
171 aa  235  3e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2225  galactose-6-phosphate isomerase subunit LacB  67.05 
 
 
171 aa  235  3e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1794  galactose-6-phosphate isomerase subunit LacB  64.2 
 
 
171 aa  233  7e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.623849  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D05  galactose-6-phosphate isomerase subunit LacB  62.5 
 
 
171 aa  223  1e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.305214  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1930  galactose-6-phosphate isomerase subunit LacB  61.36 
 
 
171 aa  214  7e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00064088  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0493  galactose-6-phosphate isomerase subunit LacB  56.32 
 
 
193 aa  206  1e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3456  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  53.98 
 
 
171 aa  186  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2093  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  52.84 
 
 
171 aa  185  3e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2597  ribose-5-phosphate isomerase  42.67 
 
 
149 aa  125  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0696545  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3431  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  45.74 
 
 
147 aa  125  4e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  2.80792e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1638  ribose-5-phosphate isomerase B  43.62 
 
 
149 aa  121  5e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2463  ribose-5-phosphate isomerase B  43.33 
 
 
149 aa  120  7e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2173  ribose-5-phosphate isomerase B  43.33 
 
 
149 aa  120  7e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0388966  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2385  ribose 5-phosphate isomerase B  44.14 
 
 
149 aa  120  7e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  9.41182e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2692  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  39.49 
 
 
157 aa  119  2e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0651624  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4556  ribose-5-phosphate isomerase B  39.73 
 
 
149 aa  115  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03962  ribose-5-phosphate isomerase B  39.73 
 
 
149 aa  114  6e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3901  ribose 5-phosphate isomerase B  39.73 
 
 
149 aa  114  6e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3936  ribose-5-phosphate isomerase B  39.73 
 
 
149 aa  114  6e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03922  hypothetical protein  39.73 
 
 
149 aa  114  6e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2239  ribose-5-phosphate isomerase  41.84 
 
 
145 aa  114  8e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2859  ribose-5-phosphate isomerase  35.62 
 
 
162 aa  112  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000346833 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4828  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  44.53 
 
 
149 aa  111  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  3.05549e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0757  ribose-5-phosphate isomerase B  40 
 
 
148 aa  111  6e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2392  ribose-5-phosphate isomerase  36.84 
 
 
181 aa  109  2e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.73759  normal  0.0712618 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2209  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  40.31 
 
 
143 aa  107  6e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.922372  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1922  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  37.58 
 
 
153 aa  107  6e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2515  ribose-5-phosphate isomerase B  37.59 
 
 
148 aa  107  7e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.499695  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0792  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  38.3 
 
 
150 aa  107  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0447104  normal  0.0700549 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  36.25 
 
 
370 aa  106  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3131  ribose-5-phosphate isomerase B  37.24 
 
 
148 aa  107  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00448812 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2065  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  37.32 
 
 
149 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2314  ribose-5-phosphate isomerase  36.03 
 
 
149 aa  105  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3746  ribose-5-phosphate isomerase B  37.41 
 
 
148 aa  105  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3745  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  39.57 
 
 
142 aa  105  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0446576  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3163  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  38.51 
 
 
152 aa  105  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000204659  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17930  ribose-5-phosphate isomerase  39.04 
 
 
322 aa  104  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2148  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  37.16 
 
 
152 aa  103  9e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0790  ribose 5-phosphate isomerase B  36.99 
 
 
145 aa  103  9e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0357  ribose-5-phosphate isomerase  32.68 
 
 
166 aa  103  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2042  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  33.33 
 
 
159 aa  103  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1307  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  38.73 
 
 
154 aa  103  2e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.833866  normal  0.257706 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5073  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  37.59 
 
 
148 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0259  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  39.73 
 
 
149 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  1.29497e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0410  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  33.77 
 
 
149 aa  102  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.52921 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0632  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  38.93 
 
 
148 aa  102  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0809  ribose 5-phosphate isomerase B  39.73 
 
 
148 aa  102  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0488  ribose-5-phosphate isomerase B  36.05 
 
 
149 aa  101  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.136003  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1376  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  34.72 
 
 
146 aa  101  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0621  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  35.76 
 
 
152 aa  101  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1933  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  38.78 
 
 
149 aa  100  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  6.91154e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0652  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  34 
 
 
149 aa  100  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.867126  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1332  ribose-5-phosphate isomerase  39.53 
 
 
148 aa  99.8  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1359  ribose-5-phosphate isomerase  35.57 
 
 
158 aa  99.8  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.632474  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0098  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  37.16 
 
 
148 aa  99.4  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4584  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  38.28 
 
 
157 aa  98.6  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.782125  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4178  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  36 
 
 
149 aa  97.8  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  8.11694e-09  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1117  ribose-5-phosphate isomerase B  33.79 
 
 
150 aa  97.4  8e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3315  ribose-5-phosphate isomerase B  33.11 
 
 
148 aa  97.1  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.16807  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1322  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  35.97 
 
 
142 aa  96.7  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2572  ribose/galactose isomerase  32.88 
 
 
153 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22120  Ribose 5-phosphate isomerase B protein  31.54 
 
 
157 aa  96.7  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1664  ribose 5-phosphate isomerase B  36.88 
 
 
143 aa  96.7  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1737  ribose 5-phosphate isomerase B  36.88 
 
 
143 aa  96.7  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1334  ribose-5-phosphate isomerase  35.86 
 
 
148 aa  96.3  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.126498  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0369  ribose 5-phosphate isomerase B  34.31 
 
 
148 aa  96.7  2e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1747  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  36.3 
 
 
148 aa  96.7  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0569698  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1258  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  37.98 
 
 
144 aa  95.5  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  8.76493e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1042  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  35.46 
 
 
142 aa  95.5  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  7.15199e-06  hitchhiker  1.8847e-05 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0615  ribose-5-phosphate isomerase B  35.81 
 
 
152 aa  95.9  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl105  ribose 5-phosphate isomerase  34.56 
 
 
146 aa  95.9  3e-19  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0070  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  36.3 
 
 
149 aa  95.5  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.212167  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1441  ribose 5-phosphate isomerase B  34.48 
 
 
151 aa  95.5  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3837  ribose-5-phosphate isomerase B  35.14 
 
 
147 aa  95.1  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0352  ribose 5-phosphate isomerase B  38.93 
 
 
150 aa  95.1  4e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1182  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  36.3 
 
 
145 aa  95.5  4e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1263  ribose-5-phosphate isomerase  32.65 
 
 
152 aa  94.7  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.649363 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0972  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  33.56 
 
 
149 aa  93.6  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_583  ribose-5-phosphate isomerase-like protein  35.14 
 
 
154 aa  94  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1116  ribose-5-phosphate isomerase B  37.5 
 
 
145 aa  93.2  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.177801  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3427  ribose-5-phosphate isomerase B  33.58 
 
 
149 aa  92.8  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2581  ribose-5-phosphate isomerase B  33.56 
 
 
157 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2041  ribose 5-phosphate isomerase  34.25 
 
 
157 aa  92.4  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1159  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  34.27 
 
 
151 aa  92.4  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.832991 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2809  ribose-5-phosphate isomerase B  32.88 
 
 
149 aa  92.4  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.119147  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1460  ribose-5-phosphate isomerase  34.31 
 
 
149 aa  91.7  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0074  ribose 5-phosphate isomerase B, putative  37.01 
 
 
165 aa  91.7  5e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1313  ribose 5-phosphate isomerase B  41.86 
 
 
149 aa  91.7  5e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  1.82185e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2228  ribose 5-phosphate isomerase B  37.14 
 
 
147 aa  90.9  9e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  3.13562e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0043  ribose 5-phosphate isomerase B  35.17 
 
 
142 aa  90.1  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0934  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  31.76 
 
 
161 aa  90.5  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.759422  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0643  ribose-5-phosphate isomerase B  34.46 
 
 
152 aa  90.5  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4053  ribose-5-phosphate isomerase B  32.89 
 
 
157 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0677  ribose-5-phosphate isomerase B  34.46 
 
 
152 aa  90.5  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1401  ribose 5-phosphate isomerase  35.37 
 
 
160 aa  90.1  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.169206  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0559  ribose 5-phosphate isomerase B  37.21 
 
 
150 aa  89.4  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1359  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  32.85 
 
 
144 aa  89.4  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0901  ribose/galactose isomerase  34.75 
 
 
150 aa  89.4  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0842  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  33.1 
 
 
142 aa  89  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>