208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0069 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0069  Galactose-6-phosphate isomerase  100 
 
 
150 aa  301  1e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  1.7744e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1795  galactose-6-phosphate isomerase subunit LacA  46.67 
 
 
142 aa  130  6e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D06  galactose-6-phosphate isomerase subunit LacA  48.53 
 
 
124 aa  128  3e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.230058  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2226  galactose-6-phosphate isomerase subunit LacA  46 
 
 
142 aa  127  8e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2265  galactose-6-phosphate isomerase subunit LacA  46 
 
 
142 aa  127  8e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1931  galactose-6-phosphate isomerase subunit LacA  42.28 
 
 
141 aa  122  1e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  4.61871e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0492  galactose-6-phosphate isomerase subunit LacA  46.36 
 
 
142 aa  115  1e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3455  Ribose/galactose isomerase  39.6 
 
 
140 aa  107  7e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2092  Ribose/galactose isomerase  36.91 
 
 
140 aa  101  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0852  ribose 5-phosphate isomerase B  32.45 
 
 
150 aa  88.2  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00452736  normal  0.320057 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0632  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  33.33 
 
 
148 aa  80.9  5e-15  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2173  ribose-5-phosphate isomerase B  34.21 
 
 
149 aa  78.2  4e-14  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0388966  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2463  ribose-5-phosphate isomerase B  34.21 
 
 
149 aa  78.2  4e-14  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0682  ribose 5-phosphate isomerase B  30.34 
 
 
145 aa  76.3  1e-13  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1933  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  33.55 
 
 
149 aa  75.5  3e-13  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  6.91154e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1116  ribose-5-phosphate isomerase B  30.82 
 
 
145 aa  74.7  4e-13  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.177801  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2859  ribose-5-phosphate isomerase  31.08 
 
 
162 aa  74.3  6e-13  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000346833 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0559  ribose 5-phosphate isomerase B  31.03 
 
 
150 aa  73.6  8e-13  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1553  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  29.53 
 
 
147 aa  72.8  1e-12  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0889  ribose 5-phosphate isomerase B  29.73 
 
 
145 aa  73.2  1e-12  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1664  ribose 5-phosphate isomerase B  30.92 
 
 
143 aa  72.8  2e-12  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1737  ribose 5-phosphate isomerase B  30.92 
 
 
143 aa  72.8  2e-12  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1446  ribose 5-phosphate isomerase B  29.66 
 
 
144 aa  71.2  4e-12  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.396381  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1441  ribose 5-phosphate isomerase B  33.1 
 
 
151 aa  69.3  1e-11  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2239  ribose-5-phosphate isomerase  34.23 
 
 
145 aa  70.1  1e-11  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3315  ribose-5-phosphate isomerase B  29.14 
 
 
148 aa  69.7  1e-11  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.16807  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0932  ribose 5-phosphate isomerase B  29.05 
 
 
145 aa  69.7  1e-11  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.17917  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0070  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  32.03 
 
 
149 aa  69.3  2e-11  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.212167  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0809  ribose 5-phosphate isomerase B  32.47 
 
 
148 aa  69.3  2e-11  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2120  ribose-5-phosphate isomerase  31.13 
 
 
146 aa  69.3  2e-11  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00298451  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0792  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  31.29 
 
 
150 aa  68.6  3e-11  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0447104  normal  0.0700549 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0098  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  31.97 
 
 
148 aa  68.6  3e-11  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5073  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  32.19 
 
 
148 aa  68.6  3e-11  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1880  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  31.25 
 
 
149 aa  68.2  3e-11  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1003  ribose 5-phosphate isomerase B  28.38 
 
 
145 aa  67.4  6e-11  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.152735  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2385  ribose 5-phosphate isomerase B  28.95 
 
 
149 aa  67.4  6e-11  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  9.41182e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0481  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  30.87 
 
 
150 aa  67.4  7e-11  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00576444 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1638  ribose-5-phosphate isomerase B  28.95 
 
 
149 aa  65.9  2e-10  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4178  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  30.26 
 
 
149 aa  65.9  2e-10  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  8.11694e-09  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3431  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  29.61 
 
 
147 aa  65.1  3e-10  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  2.80792e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5648  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  32.24 
 
 
160 aa  65.1  3e-10  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.609634  normal  0.681058 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3427  ribose-5-phosphate isomerase B  32.21 
 
 
149 aa  65.1  3e-10  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1182  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  30.2 
 
 
145 aa  65.1  3e-10  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0790  ribose 5-phosphate isomerase B  30.26 
 
 
145 aa  65.1  4e-10  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5440  ribose-5-phosphate isomerase B  31.29 
 
 
147 aa  64.3  5e-10  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  9.1391e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl105  ribose 5-phosphate isomerase  31.51 
 
 
146 aa  64.3  5e-10  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2314  ribose-5-phosphate isomerase  29.8 
 
 
149 aa  64.3  5e-10  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1864  ribose 5-phosphate isomerase B  29.45 
 
 
149 aa  64.3  6e-10  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5511  ribose-5-phosphate isomerase B  31.29 
 
 
147 aa  64.3  6e-10  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  3.0835e-10  unclonable  3.67009e-26 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1747  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  32.65 
 
 
148 aa  63.9  7e-10  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0569698  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0901  ribose/galactose isomerase  26.17 
 
 
150 aa  63.5  9e-10  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5409  ribose-5-phosphate isomerase B  30.61 
 
 
147 aa  62.8  1e-09  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.20464e-62 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3103  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  30.34 
 
 
151 aa  63.5  1e-09  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00677478  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5017  ribose-5-phosphate isomerase B  30.61 
 
 
147 aa  62.8  1e-09  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  6.49757e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0842  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  26.71 
 
 
142 aa  63.2  1e-09  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5167  ribose-5-phosphate isomerase B  30.61 
 
 
147 aa  62.8  1e-09  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  7.05511e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5560  ribose-5-phosphate isomerase B  30.61 
 
 
147 aa  62.8  1e-09  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  2.46279e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5496  ribose-5-phosphate isomerase B  29.93 
 
 
147 aa  62.4  2e-09  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  9.08103e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5443  ribose-5-phosphate isomerase B  29.93 
 
 
147 aa  62.4  2e-09  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  3.04947e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0259  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  29.73 
 
 
149 aa  62.8  2e-09  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  1.29497e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5000  ribose-5-phosphate isomerase B  29.93 
 
 
147 aa  62.4  2e-09  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  5.86604e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3837  ribose-5-phosphate isomerase B  32 
 
 
147 aa  61.6  3e-09  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5116  ribose-5-phosphate isomerase B  30.61 
 
 
147 aa  62  3e-09  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  6.11048e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1159  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  29.66 
 
 
151 aa  61.6  3e-09  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.832991 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1606  ribose 5-phosphate isomerase B, putative  30.56 
 
 
148 aa  62  3e-09  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.350324  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2065  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  27.15 
 
 
149 aa  61.2  4e-09  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1828  ribose-5-phosphate isomerase  28.57 
 
 
162 aa  61.6  4e-09  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11660  ribose 5-phosphate isomerase  27.89 
 
 
160 aa  60.8  6e-09  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0074  ribose 5-phosphate isomerase B, putative  28.67 
 
 
165 aa  60.8  6e-09  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0170  ribose-5-phosphate isomerase  28.67 
 
 
148 aa  60.5  8e-09  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0972  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  27.15 
 
 
149 aa  60.5  8e-09  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17930  ribose-5-phosphate isomerase  28.19 
 
 
322 aa  59.7  1e-08  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03435  ribose 5-phosphate isomerase B, putative  25.5 
 
 
143 aa  58.9  2e-08  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0370371  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1130  ribose-5-phosphate isomerase  30.34 
 
 
152 aa  59.3  2e-08  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.590654  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1019  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  27.4 
 
 
153 aa  58.9  2e-08  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2581  ribose-5-phosphate isomerase B  28.67 
 
 
157 aa  58.9  2e-08  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0006  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  30.34 
 
 
153 aa  58.9  2e-08  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4828  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  28.86 
 
 
149 aa  58.9  2e-08  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  3.05549e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1604  ribose-5-phosphate isomerase  30.28 
 
 
148 aa  58.5  3e-08  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0025055  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2745  ribose-5-phosphate isomerase  27.15 
 
 
147 aa  58.5  3e-08  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1263  ribose-5-phosphate isomerase  24.34 
 
 
152 aa  58.2  4e-08  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.649363 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4874  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  25.5 
 
 
143 aa  58.2  4e-08  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.585109 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4630  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  28.86 
 
 
147 aa  58.2  4e-08  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.136383 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1460  ribose-5-phosphate isomerase  29.33 
 
 
149 aa  57.8  5e-08  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1376  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  24.67 
 
 
146 aa  57.8  5e-08  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2202  ribose-5-phosphate isomerase B  28.85 
 
 
166 aa  57.8  5e-08  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1313  ribose 5-phosphate isomerase B  27.89 
 
 
149 aa  57.8  6e-08  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  1.82185e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4556  ribose-5-phosphate isomerase B  28.03 
 
 
149 aa  57.4  6e-08  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1922  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  27.33 
 
 
153 aa  57.4  6e-08  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2148  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  28.08 
 
 
152 aa  57.4  6e-08  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2734  ribose 5-phosphate isomerase B  26.49 
 
 
147 aa  57  8e-08  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1359  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  23.49 
 
 
144 aa  57  9e-08  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2593  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  24.84 
 
 
153 aa  57  9e-08  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3631  ribose 5-phosphate isomerase B  25.17 
 
 
145 aa  57  9e-08  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3901  ribose 5-phosphate isomerase B  27.03 
 
 
149 aa  56.6  1e-07  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2837  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  25.83 
 
 
147 aa  56.6  1e-07  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0043  ribose 5-phosphate isomerase B  26.71 
 
 
142 aa  56.2  1e-07  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4584  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  29.33 
 
 
157 aa  56.6  1e-07  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.782125  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2228  ribose 5-phosphate isomerase B  26 
 
 
147 aa  56.2  1e-07  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  3.13562e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3936  ribose-5-phosphate isomerase B  27.03 
 
 
149 aa  56.6  1e-07  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>