213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0055 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0055  glycerate kinase  100 
 
 
367 aa  742  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1860  Glycerate kinase  32.18 
 
 
388 aa  158  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.817432  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0793  glycerate kinase 2  28.53 
 
 
380 aa  155  1e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.109169  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06863  glycerate kinase  32.35 
 
 
377 aa  153  4e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1142  glycerate kinase  29.72 
 
 
382 aa  147  2e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.45984  unclonable  3.52544e-08 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2012  glycerate kinase 2  33.05 
 
 
383 aa  147  2e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.197664  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2458  glycerate kinase  32.76 
 
 
380 aa  147  2e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0612  glycerate kinase 1  32.52 
 
 
377 aa  147  2e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2507  glycerate kinase  32.76 
 
 
380 aa  147  2e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.724279  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3398  glycerate kinase  31.7 
 
 
380 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13407  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0201  glycerate kinase  30.81 
 
 
394 aa  147  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2908  glycerate kinase  29.71 
 
 
379 aa  145  7e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3115  glycerate kinase  32.27 
 
 
379 aa  145  9e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.630245  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2915  glycerate kinase  31.1 
 
 
383 aa  145  9e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4081  glycerate kinase  30.08 
 
 
378 aa  145  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.063717 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000882  glycerate kinase  32.06 
 
 
378 aa  145  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1637  glycerate kinase 1  30.27 
 
 
388 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0173  glycerate kinase  30.27 
 
 
388 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4052  glycerate kinase  29.81 
 
 
378 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0262  glycerate kinase 2  30.27 
 
 
388 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0559  glycerate kinase II  30.38 
 
 
381 aa  144  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0111  glycerate kinase  29.81 
 
 
378 aa  143  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3280  glycerate kinase  31.18 
 
 
379 aa  142  1e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345259  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4326  hypothetical protein  30.56 
 
 
381 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0260902  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3109  glycerate kinase II  30.11 
 
 
381 aa  140  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.574239 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0587  glycerate kinase II  30.11 
 
 
381 aa  140  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2690  glycerate kinase  29.39 
 
 
379 aa  140  5e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0551  glycerate kinase II  30.11 
 
 
381 aa  139  8e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2952  glycerate kinase  31.65 
 
 
386 aa  139  8e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00469  hypothetical protein  30.11 
 
 
381 aa  139  8e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3529  glycerate kinase  32.29 
 
 
384 aa  139  8e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00464  glycerate kinase II  30.11 
 
 
381 aa  139  8e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1372  glycerate kinase  37.34 
 
 
397 aa  138  1e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0125606 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2253  glycerate kinase  29.52 
 
 
380 aa  139  1e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.453069  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3313  glycerate kinase I  31.66 
 
 
381 aa  137  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22950  Glycerate kinase  33.55 
 
 
380 aa  138  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1135  glycerate kinase  32.99 
 
 
374 aa  138  2e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0576  glycerate kinase I  31.66 
 
 
381 aa  137  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1896  glycerate kinase  32.92 
 
 
384 aa  137  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02940  hypothetical protein  31.66 
 
 
408 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4436  glycerate kinase I  31.66 
 
 
381 aa  138  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.109938 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02989  glycerate kinase I  31.66 
 
 
408 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0581  Glycerate kinase  31.66 
 
 
381 aa  137  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3099  Glycerate kinase  29.84 
 
 
381 aa  137  3e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0615  glycerate kinase II  29.57 
 
 
381 aa  137  3e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3566  glycerate kinase I  29.78 
 
 
381 aa  137  3e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.816007 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3602  glycerate kinase I  31.66 
 
 
381 aa  137  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0846  glycerate kinase  31.66 
 
 
380 aa  137  4e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3234  glycerate kinase I  31.35 
 
 
381 aa  136  5e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3419  glycerate kinase I  31.35 
 
 
381 aa  136  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0871  glycerate 2-kinase  31.53 
 
 
380 aa  136  5e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2685  glycerate kinase  30.48 
 
 
379 aa  136  6e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2726  glycerate kinase  30.48 
 
 
379 aa  136  6e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2637  glycerate kinase  30.48 
 
 
379 aa  136  7e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2858  glycerate kinase  30.48 
 
 
379 aa  135  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.368112  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0334  hypothetical protein  31.47 
 
 
377 aa  135  9e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0579  glycerate kinase  31.58 
 
 
353 aa  135  1e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.513033  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3279  glycerate kinase 2  31.03 
 
 
380 aa  135  1e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.809605  normal  0.297665 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3165  glycerate kinase 2  31.03 
 
 
380 aa  134  2e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.589174  normal  0.0595423 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24350  glycerate kinase  28.53 
 
 
376 aa  134  2e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3100  glycerate kinase 2  31.03 
 
 
380 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1439  glycerate kinase  30.09 
 
 
380 aa  134  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465286  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3118  glycerate kinase 2  31.03 
 
 
380 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.855661  normal  0.775701 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3178  glycerate kinase  29.31 
 
 
379 aa  133  6e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2071  glycerate kinase  31.56 
 
 
377 aa  133  6e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  4.3752e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3181  glycerate kinase 2  30.72 
 
 
380 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.345716  normal  0.43286 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0571  glycerate kinase II  29.14 
 
 
382 aa  132  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0578  glycerate kinase II  29.14 
 
 
382 aa  132  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.837942 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3602  glycerate kinase  32.06 
 
 
381 aa  131  2e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2672  glycerate kinase  28.86 
 
 
381 aa  130  4e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.16173  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0573  glycerate kinase II  29.14 
 
 
382 aa  130  5e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2685  Glycerate kinase  30.15 
 
 
381 aa  130  5e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0632  glycerate kinase II  29.14 
 
 
382 aa  130  5e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.82847  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0151  glycerate kinase  29.43 
 
 
381 aa  129  6e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219073  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2534  glycerate kinase  29.37 
 
 
381 aa  129  6e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1478  glycerate kinase  29.71 
 
 
378 aa  129  8e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4927  glycerate kinase  28.41 
 
 
395 aa  128  1e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36164  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2538  glycerate kinase  29.31 
 
 
379 aa  128  2e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43390  Glycerate kinase  29.1 
 
 
378 aa  128  2e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00316811  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1024  glycerate kinase  32.36 
 
 
378 aa  128  2e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0812  glycerate kinase  31.03 
 
 
380 aa  126  6e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3291  Glycerate kinase  31.01 
 
 
380 aa  126  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  4.09322e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3392  glycerate kinase  30.41 
 
 
381 aa  126  8e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5030  glycerate kinase  31.18 
 
 
380 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3045  glycerate kinase  31.82 
 
 
377 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0181471 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0645  glycerate kinase  30.7 
 
 
383 aa  124  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4863  glycerate kinase GcxK  30.03 
 
 
380 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.432659  normal  0.859759 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3551  glycerate kinase  29.47 
 
 
387 aa  125  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08140  glycerate kinase  28.53 
 
 
401 aa  123  4e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1342  glycerate kinase  31.73 
 
 
378 aa  122  9e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1524  glycerate kinase  29.43 
 
 
380 aa  122  9e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2594  glycerate kinase  30.06 
 
 
379 aa  122  1e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3239  glycerate 2-kinase  29.47 
 
 
379 aa  122  1e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1982  glycerate kinase  28.79 
 
 
369 aa  121  2e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2714  glycerate kinase  29.38 
 
 
384 aa  121  2e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426289  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0404  glycerate kinase  28.67 
 
 
381 aa  121  2e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0467091  decreased coverage  0.00777473 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26280  glycerate kinase  28.83 
 
 
385 aa  120  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0355581 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0846  hypothetical protein  35.03 
 
 
373 aa  120  4e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0245025  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0854  glycerate kinase  35.03 
 
 
373 aa  120  4e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.69696  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2292  glycerate kinase  27.18 
 
 
389 aa  119  6e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>