120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0045 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0045  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
142 aa  286  6e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4756  transcriptional regulator, ArsR family  39.57 
 
 
150 aa  103  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00171627  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2973  putative transcriptional regulator  46.74 
 
 
207 aa  95.5  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0226444  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3269  ArsR family transcriptional regulator  44.57 
 
 
207 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.574198  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3245  transcriptional regulator, ArsR family  45.65 
 
 
208 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3009  ArsR family transcriptional regulator  45.65 
 
 
207 aa  90.5  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3024  ArsR family transcriptional regulator  45.65 
 
 
207 aa  90.5  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2946  ArsR family transcriptional regulator  45.65 
 
 
207 aa  90.5  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.958799  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3255  transcriptional regulator, ArsR family  45.65 
 
 
207 aa  90.5  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3257  ArsR family transcriptional regulator  45.65 
 
 
207 aa  90.5  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3275  transcriptional regulator, ArsR family  49.28 
 
 
184 aa  76.6  1e-13  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.42483  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0109  ArsR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
197 aa  72.4  2e-12  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1887  putative transcriptional regulatory protein  43.68 
 
 
188 aa  69.7  1e-11  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.471019  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1606  transcriptional regulatory protein, putative  43.68 
 
 
188 aa  68.9  2e-11  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00436475  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1838  transcriptional regulator, ArsR family  36.47 
 
 
472 aa  62.8  1e-09  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.240001  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0328  putative transcriptional regulator  31.4 
 
 
201 aa  62.4  2e-09  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0496107 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2853  putative transcriptional regulator  22.39 
 
 
193 aa  60.5  8e-09  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.76719  decreased coverage  0.00327558 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2809  hypothetical protein  30.23 
 
 
249 aa  58.9  2e-08  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4095  putative transcriptional regulator  30.43 
 
 
196 aa  55.1  3e-07  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.475604  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2299  regulatory protein, ArsR  30.23 
 
 
196 aa  54.7  4e-07  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.718193  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4536  ArsR family transcriptional regulator  29.07 
 
 
224 aa  54.3  6e-07  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.482904  normal  0.619073 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0618  regulatory protein, ArsR  36.23 
 
 
210 aa  53.9  7e-07  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8127  transcriptional regulator, ArsR family  32.5 
 
 
209 aa  53.9  7e-07  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1111  putative transcriptional regulator  39.13 
 
 
223 aa  53.5  9e-07  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0673626  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1399  hypothetical protein  29.41 
 
 
192 aa  52.4  2e-06  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.104773  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1739  hypothetical protein  33.33 
 
 
149 aa  51.2  5e-06  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0385114  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1101  ArsR family transcriptional regulator  41.07 
 
 
105 aa  50.8  5e-06  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00196595  hitchhiker  0.000145009 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0259  transcriptional regulator, ArsR family  29.41 
 
 
171 aa  51.2  5e-06  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.792172  normal  0.339898 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  37.1 
 
 
109 aa  50.1  9e-06  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1537  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
149 aa  50.4  9e-06  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.238883  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1796  hypothetical protein  32 
 
 
149 aa  49.7  1e-05  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1532  hypothetical protein  32 
 
 
149 aa  50.1  1e-05  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1651  hypothetical protein  32 
 
 
149 aa  50.1  1e-05  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1718  hypothetical protein  32 
 
 
149 aa  49.7  1e-05  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0746  transcriptional regulator, ArsR family  36.23 
 
 
210 aa  50.1  1e-05  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1905  putative transcriptional regulator  27.84 
 
 
176 aa  49.3  2e-05  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0592557  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0383  hypothetical protein  28.99 
 
 
197 aa  48.5  3e-05  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0395  hypothetical protein  28.99 
 
 
197 aa  48.5  3e-05  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0870  transcriptional regulator, ArsR family  29.17 
 
 
171 aa  48.5  3e-05  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0404  hypothetical protein  28.99 
 
 
197 aa  48.5  3e-05  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.748136 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1497  transcriptional regulator  30.67 
 
 
149 aa  48.1  4e-05  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7611  ArsR family transcriptional regulator  27.06 
 
 
185 aa  47.8  5e-05  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0607  hypothetical protein  26.67 
 
 
205 aa  47.4  7e-05  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1506  ArsR family transcriptional regulator  30.67 
 
 
149 aa  47.4  7e-05  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0520742  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2717  ArsR family transcriptional regulator  38 
 
 
111 aa  47.4  7e-05  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4982  putative transcriptional regulator, ArsR family  38 
 
 
111 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1931  ArsR family transcriptional regulator  27.08 
 
 
107 aa  46.2  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0246294  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  36.07 
 
 
98 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  37.1 
 
 
109 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3317  transcriptional regulator, TrmB  34.29 
 
 
108 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0866  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
104 aa  45.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.980203 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3446  ArsR family transcriptional regulator  30.86 
 
 
120 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3509  ArsR family transcriptional regulator  30.86 
 
 
120 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3457  ArsR family transcriptional regulator  30.86 
 
 
120 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446106  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0817  ArsR family transcriptional regulator  38.3 
 
 
132 aa  45.4  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0011  regulatory protein, ArsR  38.3 
 
 
120 aa  44.7  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1561  regulatory protein ArsR  37.5 
 
 
100 aa  44.7  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.442352  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0836  regulatory protein, ArsR  37.74 
 
 
101 aa  44.7  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0433  regulatory protein, ArsR  39.58 
 
 
100 aa  44.3  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  33.87 
 
 
328 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3885  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
116 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11439  normal  0.100535 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  36.21 
 
 
305 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2878  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 
112 aa  43.9  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2215  ArsR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
111 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2904  putative transcriptional regulator  40 
 
 
89 aa  43.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  36.54 
 
 
307 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  36.54 
 
 
305 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1704  transcriptional regulator, ArsR family  35.42 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809199  hitchhiker  0.000421597 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4628  hypothetical protein  24.18 
 
 
200 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0160155 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  40.82 
 
 
108 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3867  regulatory protein ArsR  38.33 
 
 
118 aa  43.5  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248206  normal  0.706318 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1953  transcriptional regulator, ArsR family  36.17 
 
 
126 aa  43.5  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0623  ArsR family transcriptional regulator  35.42 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  40 
 
 
107 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2552  ArsR family transcriptional regulator  24.71 
 
 
185 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0674571  normal  0.191331 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4571  regulatory protein ArsR  34.85 
 
 
168 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  35.94 
 
 
113 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0996  hypothetical protein  32.73 
 
 
224 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1441  transcriptional regulator, ArsR family  33.77 
 
 
192 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
107 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0111  regulatory protein ArsR  38.46 
 
 
260 aa  42.7  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0376512  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2967  transcriptional regulator, ArsR family  23.36 
 
 
183 aa  42.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.048308 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  38.89 
 
 
349 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 
117 aa  41.6  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  35.42 
 
 
112 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  31.15 
 
 
92 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2351  transcriptional regulator, ArsR family  42.55 
 
 
109 aa  42  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  2.26954e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  42.55 
 
 
111 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3509  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 
116 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5219  transcriptional regulator, ArsR family  29.79 
 
 
118 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.55 
 
 
106 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3122  regulatory protein ArsR  32.65 
 
 
113 aa  41.2  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238264  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  32 
 
 
105 aa  41.2  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4017  regulatory protein, ArsR  25 
 
 
190 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.94661  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05540  ArsR family regulatory protein  31.88 
 
 
336 aa  41.2  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3025  transcriptional regulator, ArsR family  30.36 
 
 
347 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.775096  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0013  regulatory protein, ArsR  36.17 
 
 
127 aa  40.8  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1230  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 
330 aa  40.8  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3902  regulatory protein, ArsR  31.75 
 
 
109 aa  40.8  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3142  transcriptional regulator, ArsR family  31.65 
 
 
219 aa  40.8  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>