More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0044 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0044  ABC transporter related  100 
 
 
251 aa  498  1e-140  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2586  ABC transporter related protein  47.79 
 
 
262 aa  231  7e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.99395e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19970  ABC transporter related  45.28 
 
 
265 aa  223  3e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0719287  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1819  ABC transporter related  46.59 
 
 
254 aa  221  6e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  1.82766e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0251  ABC transporter ATP-binding protein  45.74 
 
 
267 aa  221  1e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  2.73e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0323  hypothetical protein  43.08 
 
 
264 aa  217  1e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0704987  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2076  ABC transporter, ATP-binding protein  44.19 
 
 
267 aa  217  2e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000172805  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1475  ABC transporter related protein  42.52 
 
 
265 aa  216  3e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2225  ABC transporter related  46.52 
 
 
257 aa  215  5e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0489859  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0659  ABC transporter related  42.8 
 
 
264 aa  213  2e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.548438  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1714  ABC transporter related  42.13 
 
 
264 aa  213  2e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0481461  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2362  ABC transporter related protein  43.03 
 
 
261 aa  213  3e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  5.88091e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2862  ABC transporter related protein  41.6 
 
 
270 aa  212  5e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1153  ABC transporter ATP-binding protein  44.9 
 
 
252 aa  212  5e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0266393  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2163  ABC transporter related  42.46 
 
 
264 aa  211  8e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.573773 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4551  ABC transporter related  40.71 
 
 
264 aa  209  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000329769  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1111  ABC transporter, ATPase subunit  41.04 
 
 
260 aa  208  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1118  ABC transporter, ATPase subunit  41.43 
 
 
270 aa  207  9e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.505252  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2854  ABC transporter related protein  40.94 
 
 
264 aa  207  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3142  ABC transporter, ATP-binding protein  43.78 
 
 
264 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1477  ABC transporter, ATP-binding protein  43.78 
 
 
264 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0442  ABC transporter, ATP-binding protein  43.78 
 
 
264 aa  206  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0762699  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2905  ABC transporter, ATP-binding protein  43.78 
 
 
264 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0524  ABC transporter, ATP-binding protein  43.78 
 
 
264 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0111  ABC transporter, ATP-binding protein  43.78 
 
 
264 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0690  ABC transport system ATP-binding protein  43.78 
 
 
264 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.553471  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1209  ABC transporter-related protein  40.4 
 
 
264 aa  206  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0725  ABC transporter related protein  42.23 
 
 
265 aa  206  4e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.129055  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0507  ABC transporter, ATP-binding protein  43.78 
 
 
264 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1601  ABC transporter related  40.16 
 
 
264 aa  206  4e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.81737 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  44.59 
 
 
263 aa  205  7e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2830  ABC transporter related  45.06 
 
 
267 aa  204  8e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0260  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  44 
 
 
254 aa  204  8e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0269  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  45.45 
 
 
256 aa  204  9e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0630  ABC transporter related  40.64 
 
 
263 aa  204  1e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.764744  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1945  ABC transporter related  42.63 
 
 
264 aa  204  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.446826  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1087  ABC transporter related  41.7 
 
 
264 aa  204  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0738  ABC transporter related  42 
 
 
265 aa  204  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.24437e-07 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1437  ABC transporter, ATPase subunit  39.76 
 
 
264 aa  204  2e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.432186 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0212  ABC transporter, ATP-binding protein  43.48 
 
 
265 aa  203  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272765  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0474  ABC transporter related  41.99 
 
 
264 aa  203  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.753612  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1571  ABC transporter related  42.69 
 
 
265 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4044  ABC transporter related  39.76 
 
 
264 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6159  ABC transporter, ATPase subunit  41.13 
 
 
264 aa  202  5e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1187  ABC transporter, ATP-binding protein  46.32 
 
 
253 aa  202  5e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.708158  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3143  ABC transporter-related protein  39.76 
 
 
264 aa  201  7e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.288919  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2829  ABC transporter related  41.13 
 
 
264 aa  201  9e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0235677  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2840  ABC transporter related  41.13 
 
 
264 aa  201  9e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2216  ABC transporter related  41.13 
 
 
264 aa  201  9e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315955  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1313  ABC transporter related  40 
 
 
264 aa  201  1e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1463  ABC transporter related  40.68 
 
 
264 aa  200  2e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.466344  hitchhiker  5.93097e-07 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1738  ABC transporter ATP-binding protein  38.58 
 
 
264 aa  200  2e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.924585  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1504  ABC transporter related  40.25 
 
 
264 aa  199  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3721  ABC transporter related  39.76 
 
 
264 aa  199  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0207  ABC transporter related protein  44.05 
 
 
262 aa  198  7e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1947  ABC transporter related  40 
 
 
264 aa  198  8e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.349831 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1748  ABC transporter related  40 
 
 
264 aa  198  8e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0075  ABC transporter related  41.13 
 
 
282 aa  197  1e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002972  ABC transporter ATP-binding protein  40.86 
 
 
264 aa  196  3e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1951  ABC transporter related  40.85 
 
 
264 aa  196  4e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168978  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3065  ABC transporter related  38.98 
 
 
264 aa  194  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2869  ABC transporter related  39.92 
 
 
265 aa  193  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0621  ABC transporter, ATP-binding protein  42.24 
 
 
245 aa  193  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183641  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1976  ABC transporter, ATP-binding protein  38.19 
 
 
264 aa  192  3e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2056  ABC transporter, ATP-binding protein  38.19 
 
 
264 aa  192  4e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0865  ABC transporter related  37.4 
 
 
264 aa  191  6e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14370  putative ABC-transporter ATP-binding component  40.55 
 
 
264 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1275  ABC transporter ATP-binding protein  40.55 
 
 
264 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2040  ABC transporter-related protein  38.04 
 
 
264 aa  188  6e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4313  ABC transporter related  38.19 
 
 
264 aa  188  8e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0049  ABC transporter, ATP-binding protein  39.57 
 
 
264 aa  184  8e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0077  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  47.89 
 
 
251 aa  184  1e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02938  hypothetical protein  38.58 
 
 
264 aa  184  1e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2104  ABC transporter component  37.97 
 
 
264 aa  182  6e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1504  ABC transporter related  37.6 
 
 
296 aa  181  8e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0823  ABC transporter ATP-binding protein  38.98 
 
 
267 aa  177  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0106274 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1100  ABC transporter related  40.69 
 
 
242 aa  175  5e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24380  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  35.37 
 
 
275 aa  134  1e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.446861  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000665  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  36.12 
 
 
339 aa  133  2e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.518175  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0730  ABC transporter related  34.36 
 
 
330 aa  131  8e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0385  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.78 
 
 
367 aa  130  3e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1031  ABC transport system, ATP-binding protein  37.74 
 
 
339 aa  129  5e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0750  ABC transporter related  33.92 
 
 
330 aa  128  8e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1540  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  34.89 
 
 
562 aa  128  9e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1157  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  32.92 
 
 
372 aa  124  2e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.602801  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0979  ABC transporter related  33.07 
 
 
265 aa  123  3e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1187  ABC transporter related  35.4 
 
 
256 aa  123  4e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.2493  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1314  ABC transporter related  34.91 
 
 
329 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159195  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1271  ABC transporter related  36.19 
 
 
329 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0543066 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1602  ABC transporter  33.04 
 
 
329 aa  121  9e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0412984 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1682  ABC transporter-like  34.76 
 
 
329 aa  121  1e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2596  ABC transporter related protein  33.76 
 
 
260 aa  121  1e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.256414  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  32.65 
 
 
257 aa  121  1e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1755  ABC transporter related  36.64 
 
 
224 aa  120  2e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0195851  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2120  ABC transporter related protein  35.5 
 
 
243 aa  120  2e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0503  sulphate transport system permease protein 1  32.02 
 
 
360 aa  119  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4861  ABC transporter related  33.92 
 
 
241 aa  119  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.62154 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2329  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  34.51 
 
 
326 aa  120  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000238837  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1328  ABC transporter related  30.84 
 
 
328 aa  120  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207377  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3882  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.17 
 
 
329 aa  119  4e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>