125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0043 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0043  inner-membrane translocator  100 
 
 
289 aa  557  1e-158  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.963469  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2861  inner-membrane translocator  38.46 
 
 
313 aa  203  2e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0658  inner-membrane translocator  40.39 
 
 
325 aa  203  3e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.812733  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19980  inner-membrane translocator  44.19 
 
 
306 aa  202  5e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.56701e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03820  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  40.84 
 
 
329 aa  198  1e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0324  hypothetical protein  40.21 
 
 
304 aa  196  5e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  7.06535e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6160  ABC transporter, inner membrane subunit  41.64 
 
 
298 aa  195  7e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2841  inner-membrane translocator  40.57 
 
 
298 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2830  inner-membrane translocator  40.57 
 
 
298 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2217  inner-membrane translocator  40.57 
 
 
298 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224996  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1474  inner-membrane translocator  41.08 
 
 
330 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2829  inner-membrane translocator  41.18 
 
 
309 aa  187  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.127019  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0473  inner-membrane translocator  40.57 
 
 
298 aa  186  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.994417 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1314  inner-membrane translocator  38.43 
 
 
298 aa  185  8e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.506841  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3142  inner-membrane translocator  39.86 
 
 
293 aa  183  2e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.407597  normal  0.74462 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1276  ABC transporter permease  40.73 
 
 
296 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2855  inner-membrane translocator  39.22 
 
 
330 aa  183  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1210  inner-membrane translocator  38.77 
 
 
298 aa  182  4e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2039  inner-membrane translocator  40.15 
 
 
313 aa  182  6e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0264556 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14380  ABC transporter permease  40.73 
 
 
296 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.515362  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4552  inner-membrane translocator  38.52 
 
 
305 aa  180  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.131035  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1462  inner-membrane translocator  39.5 
 
 
302 aa  180  3e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  hitchhiker  7.33363e-07 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1503  inner-membrane translocator  39.15 
 
 
302 aa  179  3e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.26589  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0441  ABC transporter, permease protein  40.94 
 
 
339 aa  180  3e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0285978  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0523  ABC transporter, permease protein  40.94 
 
 
298 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0110  ABC transporter, permease protein  40.94 
 
 
298 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0688  branched chain amino acid ABC transporter permease  40.94 
 
 
336 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.489758  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0506  ABC transporter, permease protein  40.94 
 
 
298 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.973872  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2906  ABC transporter, permease protein  40.94 
 
 
298 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1478  ABC transporter, permease protein  40.94 
 
 
298 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3141  ABC transporter, permease protein  40.94 
 
 
298 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1948  inner-membrane translocator  39.49 
 
 
295 aa  178  8e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418082  normal  0.372623 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1749  inner-membrane translocator  39.49 
 
 
295 aa  178  9e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2226  inner-membrane translocator  37.59 
 
 
293 aa  176  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0342549  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0631  inner-membrane translocator  37.87 
 
 
315 aa  174  2e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0289508  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4312  inner-membrane translocator  38.04 
 
 
294 aa  173  4e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.953267  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1950  inner-membrane translocator  38.17 
 
 
296 aa  172  7e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.202411  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1739  putative transmembrane ABC transporter protein  37.37 
 
 
303 aa  170  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.210687  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0822  ABC transporter inner-membrane translocator  35.29 
 
 
299 aa  170  3e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0113178 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2162  inner-membrane translocator  37.68 
 
 
295 aa  168  9e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.596984 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0211  ABC transporter, permease protein, putative  36.73 
 
 
303 aa  167  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.193865  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1119  ABC transporter, inner membrane subunit  35.11 
 
 
305 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1110  ABC transporter, inner membrane subunit  35.5 
 
 
305 aa  167  3e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1570  inner-membrane translocator  38.01 
 
 
307 aa  166  5e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0268  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  34.74 
 
 
297 aa  166  6e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.603653  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2363  inner-membrane translocator  33.06 
 
 
365 aa  164  2e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  2.40422e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2105  inner-membrane translocator  37.18 
 
 
312 aa  164  2e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0076  inner-membrane translocator  33.97 
 
 
306 aa  163  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1088  inner-membrane translocator  36.43 
 
 
300 aa  162  7e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1436  ABC transporter, inner membrane subunit  34.08 
 
 
299 aa  161  1e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.641737 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1600  inner-membrane translocator  33.71 
 
 
299 aa  160  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.852679 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1713  inner-membrane translocator  35.29 
 
 
299 aa  158  1e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.376915  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0078  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  35.04 
 
 
299 aa  157  3e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  35.53 
 
 
640 aa  155  7e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2585  inner-membrane translocator  35.57 
 
 
302 aa  155  8e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.14262e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0866  inner-membrane translocator  36.67 
 
 
294 aa  153  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0259  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  36.95 
 
 
308 aa  152  8e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0510641  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2055  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.93 
 
 
294 aa  151  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1975  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.93 
 
 
294 aa  150  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237569  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1818  inner-membrane translocator  36.14 
 
 
299 aa  149  4e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  2.19565e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2868  inner-membrane translocator  37.17 
 
 
294 aa  149  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3066  inner-membrane translocator  34.69 
 
 
292 aa  141  2e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1946  inner-membrane translocator  34.77 
 
 
299 aa  139  4e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.463281  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4045  inner-membrane translocator  35.32 
 
 
292 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02939  hypothetical protein  33.79 
 
 
317 aa  137  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0724  inner-membrane translocator  33.82 
 
 
299 aa  136  3e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0261015  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002971  ABC-type uncharacterized transport system permease component  33.1 
 
 
311 aa  136  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3722  inner-membrane translocator  33.83 
 
 
292 aa  134  2e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2077  ABC transporter, permease protein  32.6 
 
 
298 aa  133  3e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.251592  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1154  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  35.08 
 
 
289 aa  132  7e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  4.9546e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  35.43 
 
 
584 aa  131  2e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0620  putative ABC transporter, permease protein  33.68 
 
 
327 aa  128  9e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.375886  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0737  inner-membrane translocator  34.21 
 
 
300 aa  128  1e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22382e-08 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1188  ABC transporter, permease protein  34.65 
 
 
287 aa  127  2e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0048  ABC transporter, permease protein  33.68 
 
 
297 aa  125  1e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1099  inner-membrane translocator  30.22 
 
 
329 aa  116  5e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0206  inner-membrane translocator  28.87 
 
 
363 aa  110  3e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4372  inner-membrane translocator  31.58 
 
 
299 aa  95.9  7e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2839  ABC transporter permease  38.3 
 
 
120 aa  76.3  6e-13  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000198537  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2459  inner-membrane translocator  25.89 
 
 
341 aa  54.3  2e-06  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  27.64 
 
 
345 aa  52.4  9e-06  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  27.64 
 
 
345 aa  52.4  9e-06  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  27.64 
 
 
345 aa  52.4  9e-06  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5745  monosaccharide-transporting ATPase  26.11 
 
 
318 aa  49.7  5e-05  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1479  inner-membrane translocator  25.42 
 
 
302 aa  49.7  6e-05  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3229  monosaccharide-transporting ATPase  23.98 
 
 
324 aa  48.9  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1212  inner-membrane translocator  24.1 
 
 
316 aa  48.5  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.273488  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2501  inner-membrane translocator  25.11 
 
 
302 aa  48.1  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2608  inner-membrane translocator  24.69 
 
 
302 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  26.63 
 
 
345 aa  47  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1419  inner-membrane translocator  23.66 
 
 
314 aa  46.2  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0630  inner-membrane translocator  27.18 
 
 
293 aa  45.8  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0990  monosaccharide-transporting ATPase  26.63 
 
 
326 aa  45.8  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2977  putative ribose ABC transporter, permease protein  25.91 
 
 
329 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0466  inner-membrane translocator  25 
 
 
316 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0964978  normal  0.176189 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0785  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  21.62 
 
 
316 aa  45.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2265  putative ribose ABC transporter, permease protein  25.1 
 
 
329 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0836743 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  27.64 
 
 
345 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2396  inner-membrane translocator  24.69 
 
 
302 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.228148  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3645  inner-membrane translocator  23.56 
 
 
327 aa  45.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>