More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0039 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0039  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  100 
 
 
433 aa  874  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0183104  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1756  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  56.13 
 
 
433 aa  469  1e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.212389  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1705  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  56.13 
 
 
433 aa  469  1e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324396  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1894  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  56.13 
 
 
433 aa  469  1e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  4.30221e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1977  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  56.13 
 
 
433 aa  469  1e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0131887  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1929  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  56.13 
 
 
433 aa  469  1e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03249e-46 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3449  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  56.13 
 
 
433 aa  469  1e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0452293  hitchhiker  9.91695e-16 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1734  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  55.9 
 
 
433 aa  468  1e-130  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.58964e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2004  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  55.9 
 
 
433 aa  465  1e-130  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441016  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1754  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  56.13 
 
 
433 aa  467  1e-130  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000169733  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1897  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  55.92 
 
 
431 aa  464  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000548599  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3826  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  53.7 
 
 
434 aa  461  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  9.62839e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf238  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  55.11 
 
 
431 aa  462  1e-129  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.01595  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3842  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  53.7 
 
 
434 aa  462  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00792291  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0370  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  52.31 
 
 
439 aa  464  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3916  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  54.17 
 
 
434 aa  464  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00156356  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4218  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  53.7 
 
 
434 aa  462  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.80142e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4109  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  53.7 
 
 
434 aa  462  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.99872e-53 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4154  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  53.7 
 
 
434 aa  463  1e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00147082  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3995  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  53.7 
 
 
434 aa  461  1e-128  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0822094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4307  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  53.7 
 
 
434 aa  461  1e-128  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00037416  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2254  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  54.4 
 
 
433 aa  460  1e-128  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2784  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  54.17 
 
 
434 aa  458  1e-128  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  1.52618e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2210  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  54.33 
 
 
433 aa  461  1e-128  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2172  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  54.33 
 
 
433 aa  461  1e-128  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1776  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  53.69 
 
 
433 aa  456  1e-127  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2062  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  53.9 
 
 
433 aa  456  1e-127  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4195  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  53.24 
 
 
434 aa  458  1e-127  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00109232  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1042  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  53.24 
 
 
434 aa  458  1e-127  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00204257  decreased coverage  1.53983e-05 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1744  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  51.76 
 
 
433 aa  444  1e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0147  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  53.27 
 
 
441 aa  440  1e-122  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0409  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  54.79 
 
 
431 aa  439  1e-122  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0113  thymidine phosphorylase  50.12 
 
 
432 aa  440  1e-122  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  7.87887e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1665  thymidine phosphorylase  50.93 
 
 
444 aa  432  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.477565  normal  0.134735 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2054  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  52.3 
 
 
438 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3238  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  48.62 
 
 
435 aa  426  1e-118  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3447  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  50.35 
 
 
430 aa  426  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1101  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  55.11 
 
 
438 aa  426  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0678  thymidine phosphorylase  49.54 
 
 
433 aa  424  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1471  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  50.58 
 
 
434 aa  422  1e-117  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.606282  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06970  thymidine phosphorylase  53.3 
 
 
434 aa  419  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4182  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  49.65 
 
 
434 aa  420  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1318  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  47.92 
 
 
433 aa  415  1e-115  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0609  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  48.5 
 
 
434 aa  417  1e-115  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1488  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  51.72 
 
 
434 aa  414  1e-114  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.023549  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1775  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  50.7 
 
 
441 aa  410  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1750  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  52.48 
 
 
440 aa  409  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2275  thymidine phosphorylase  46.9 
 
 
435 aa  405  1e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  1.78657e-10  hitchhiker  3.23962e-07 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0737  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  46.85 
 
 
582 aa  405  1e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2591  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  50.71 
 
 
441 aa  403  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1176  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  49.43 
 
 
434 aa  402  1e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.246422  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1280  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  48.03 
 
 
441 aa  401  1e-110  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0877  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  52.63 
 
 
441 aa  397  1e-109  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0834684  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1138  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  48.74 
 
 
434 aa  398  1e-109  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000122674  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1531  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  48.8 
 
 
430 aa  394  1e-108  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.291461  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1625  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  45.56 
 
 
437 aa  387  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1840  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  48.28 
 
 
434 aa  383  1e-105  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.166082  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0757  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  46.9 
 
 
437 aa  382  1e-105  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2191  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  48.88 
 
 
443 aa  379  1e-104  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl119  thymidine phosphorylase  47.46 
 
 
434 aa  379  1e-104  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6093  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  45.37 
 
 
438 aa  377  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0759218  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1789  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  46.88 
 
 
435 aa  376  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0651  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  48.62 
 
 
435 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0651  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  49.12 
 
 
435 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2180  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  45.41 
 
 
435 aa  366  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.571226 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0617  thymidine phosphorylase  49.37 
 
 
435 aa  362  9e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.640469  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0075  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  44.11 
 
 
446 aa  358  1e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0662  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  47.38 
 
 
434 aa  355  8e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.132104  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3944  thymidine phosphorylase  41.82 
 
 
428 aa  354  2e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.102744  hitchhiker  0.00269501 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1274  Thymidine phosphorylase  46.02 
 
 
426 aa  348  9e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643295  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3535  thymidine phosphorylase  42.33 
 
 
428 aa  347  3e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00606286  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0999  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  43.83 
 
 
432 aa  346  4e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.182708  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0829  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  45.23 
 
 
431 aa  343  3e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.829074  normal  0.764393 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5934  thymidine phosphorylase  41.07 
 
 
444 aa  341  2e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0130951 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6449  thymidine phosphorylase  44.39 
 
 
424 aa  339  7e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0812  thymidine phosphorylase  42.06 
 
 
426 aa  339  7e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.376923 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0756  thymidine phosphorylase  41.59 
 
 
426 aa  338  1e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0508  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  41.57 
 
 
434 aa  337  2e-91  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1025  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  44.22 
 
 
431 aa  336  4e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1021  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  40.5 
 
 
447 aa  336  5e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.171044  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0661  thymidine phosphorylase  43.26 
 
 
440 aa  335  8e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08120  thymidine phosphorylase  44.95 
 
 
433 aa  335  1e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.80887  normal  0.487259 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25710  thymidine phosphorylase  44.47 
 
 
440 aa  334  1e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.302747 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4976  thymidine phosphorylase  44.53 
 
 
440 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.718604  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4189  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  42.33 
 
 
424 aa  334  2e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4398  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  43.22 
 
 
425 aa  333  2e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3332  thymidine phosphorylase  41.65 
 
 
444 aa  333  3e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.329046  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4822  thymidine phosphorylase  44.28 
 
 
440 aa  333  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.524384  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4890  thymidine phosphorylase  44.28 
 
 
440 aa  332  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00649353  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4981  thymidine phosphorylase  43.85 
 
 
440 aa  332  6e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4929  thymidine phosphorylase  43.85 
 
 
440 aa  332  6e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3674  thymidine phosphorylase  43.85 
 
 
440 aa  332  6e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.104507 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4983  thymidine phosphorylase  44.28 
 
 
440 aa  332  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.615857  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5897  thymidine phosphorylase  43.85 
 
 
440 aa  332  6e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04258  thymidine phosphorylase  43.85 
 
 
440 aa  332  6e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4924  thymidine phosphorylase  44.28 
 
 
440 aa  332  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.118094  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4931  thymidine phosphorylase  43.85 
 
 
440 aa  332  6e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04224  hypothetical protein  43.85 
 
 
440 aa  332  6e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.894595  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0542  thymidine phosphorylase  43.39 
 
 
440 aa  332  8e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.492482  normal  0.113052 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3616  thymidine phosphorylase  43.85 
 
 
440 aa  332  9e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>