248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0038 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0038  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  100 
 
 
400 aa  772  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  9.07116e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2071  Na+ dependent nucleoside transporter  60.5 
 
 
400 aa  466  1e-130  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.626229  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000803  nucleoside permease NupC  39.51 
 
 
402 aa  293  5e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  1.13486e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2819  NupC family nucleoside transporter  40.25 
 
 
408 aa  285  7e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2505  NupC family protein  40.49 
 
 
408 aa  285  1e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.542894  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3706  NupC family protein  37.38 
 
 
422 aa  280  3e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0616  putative sodium-dependent nucleoside transporter protein  38.97 
 
 
427 aa  280  4e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.552208  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0111  nucleoside transporter  37.08 
 
 
420 aa  278  1e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3546  nucleoside transporter  38.97 
 
 
408 aa  277  2e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2817  nucleoside transporter  38.33 
 
 
419 aa  277  2e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  6.83947e-06  hitchhiker  4.93259e-05 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1000  nucleoside transporter  39.19 
 
 
420 aa  275  8e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  1.84803e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5354  NupC family nucleoside transporter  38.27 
 
 
403 aa  275  1e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  1.34447e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5028  nucleoside transporter  37.53 
 
 
403 aa  273  4e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  6.45183e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3851  nucleoside transporter  36.67 
 
 
422 aa  272  7e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0289  transport system permease  37.82 
 
 
419 aa  272  7e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1587  sodium-dependent nucleoside transporter  35.29 
 
 
406 aa  272  8e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0436928  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1098  NupC family protein  37.04 
 
 
402 aa  271  2e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3769  nucleoside transporter  37.78 
 
 
403 aa  270  3e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  2.31054e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5407  nucleoside transporter, NupC family  37.78 
 
 
403 aa  270  3e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.23055e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1023  nucleoside transporter  37.77 
 
 
420 aa  270  5e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  2.39256e-10  n/a   
 
 
 
NC_011312  VSAL_I2501  nucleoside transport protein (nucleoside permease NupC)  37.04 
 
 
404 aa  269  7e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3189  nucleoside transporter  38.08 
 
 
402 aa  268  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.549787 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1487  putative NupC family protein (permease)  38.27 
 
 
403 aa  266  3e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0971  nucleoside transporter  38.33 
 
 
419 aa  266  4e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  5.46598e-08  decreased coverage  0.000216747 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0740  concentrative nucleoside/H+ symporter  37.05 
 
 
425 aa  264  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0887086  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0296  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  36.63 
 
 
413 aa  264  3e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0763703  normal  0.616931 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2861  nucleoside transporter  37.38 
 
 
417 aa  263  5e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01390  hypothetical protein  36 
 
 
399 aa  262  6e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3050  nucleoside transporter  37.14 
 
 
419 aa  261  1e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  1.62905e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1100  nucleoside transporter  37.14 
 
 
419 aa  261  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  1.01153e-05  unclonable  2.54337e-05 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1973  NupC family nucleoside transporter  37.78 
 
 
414 aa  261  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.826575  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4915  nucleoside transporter  37.38 
 
 
422 aa  260  3e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.105963 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1717  nucleoside transporter  36.54 
 
 
420 aa  260  3e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4420  nucleoside transporter  36.08 
 
 
425 aa  259  4e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2763  nucleoside transporter  37.53 
 
 
402 aa  259  4e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1039  Na+ dependent nucleoside transporter  37.14 
 
 
419 aa  259  5e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  8.52943e-08  unclonable  1.04739e-10 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1035  nucleoside transporter  37.14 
 
 
419 aa  259  5e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  5.65727e-08  hitchhiker  5.17288e-10 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2824  nucleoside transporter  36.67 
 
 
419 aa  259  6e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  9.7854e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3551  nucleoside transporter  36.67 
 
 
419 aa  259  6e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000301741  unclonable  4.73709e-08 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2461  NupC family nucleoside transporter  35.11 
 
 
416 aa  258  1e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.766388  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5601  nucleoside transporter, NupC family  36.79 
 
 
403 aa  258  1e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  7.40053e-08  hitchhiker  6.13455e-18 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1270  nucleoside transporter  36.73 
 
 
424 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4916  Na+ dependent nucleoside transporter  37.04 
 
 
403 aa  257  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.08996e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2812  Na+ dependent nucleoside transporter family protein  36.73 
 
 
424 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5475  NupC family nucleoside transporter  37.04 
 
 
403 aa  257  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  8.07855e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0109  nucleoside transporter  36.73 
 
 
424 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5085  NupC family nucleoside transporter  37.04 
 
 
403 aa  257  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  5.01622e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1069  nucleoside transporter  36.73 
 
 
424 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4931  Na+ dependent nucleoside transporter  37.04 
 
 
403 aa  257  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  5.1013e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5325  nucleoside transporter, NupC family  37.04 
 
 
403 aa  257  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.42869e-44 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5359  nucleoside transporter, NupC family  37.04 
 
 
403 aa  257  3e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  5.39018e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1541  NupC family protein  36.43 
 
 
405 aa  257  3e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0424261  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0129  nucleoside transporter  36.73 
 
 
424 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0409  nucleoside transporter  36.49 
 
 
426 aa  256  4e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0659  nucleoside transporter  37.12 
 
 
425 aa  256  4e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3380  nucleoside transporter  35.56 
 
 
419 aa  256  5e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  3.93425e-05  hitchhiker  0.00583621 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2667  Na+ dependent nucleoside transporter family protein  36.49 
 
 
566 aa  255  1e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0472301  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3380  Na+ dependent nucleoside transporter  35.5 
 
 
402 aa  253  4e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2458  NupC family nucleoside transporter  35.11 
 
 
416 aa  253  5e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0532  nucleoside transporter  36.48 
 
 
402 aa  253  6e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1497  nucleoside transporter  35.11 
 
 
416 aa  252  7e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  2.93356e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0998  Na+ dependent nucleoside transporter  35.5 
 
 
402 aa  252  7e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2297  NupC family nucleoside transporter  35.11 
 
 
416 aa  252  8e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0963  Na+ dependent nucleoside transporter  35.5 
 
 
402 aa  252  8e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2308  NupC family nucleoside transporter  35.11 
 
 
416 aa  252  8e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.903484  hitchhiker  0.000933793 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0983  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  35.5 
 
 
402 aa  252  8e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3229  nucleoside transporter  36.9 
 
 
419 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  7.98644e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03378  hypothetical protein  35.36 
 
 
427 aa  251  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3297  nucleoside transporter, NupC family  34.87 
 
 
416 aa  251  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  normal  0.103773 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1214  NupC family protein  35.8 
 
 
432 aa  249  4e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002628  nucleoside permease NupC  35.13 
 
 
427 aa  249  4e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  3.61858e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1931  NupC family protein  35.46 
 
 
418 aa  249  4e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.24283e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2675  Na+ dependent nucleoside transporter  34.92 
 
 
401 aa  249  5e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0805  nucleoside transporter, NupC family  35.11 
 
 
415 aa  249  6e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2247  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  35.45 
 
 
416 aa  249  8e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00577659  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02090  predicted nucleoside transporter  35.11 
 
 
416 aa  248  1e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02049  hypothetical protein  35.11 
 
 
416 aa  248  1e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1138  nucleoside transporter  36.04 
 
 
419 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  1.31174e-08  unclonable  5.78399e-12 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3368  nucleoside transporter  36.67 
 
 
419 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  5.90778e-07  hitchhiker  0.00789316 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6659  Na+ dependent nucleoside transporter  35.78 
 
 
424 aa  248  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0207815  normal  0.0527742 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3232  nucleoside transporter  36.67 
 
 
419 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  2.94256e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1926  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  36.18 
 
 
416 aa  248  1e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.146383 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1971  Na+ dependent nucleoside transporter  35.21 
 
 
416 aa  247  3e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1592  Na+ dependent nucleoside transporter-like  36.57 
 
 
424 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6239  Na+ dependent nucleoside transporter  36.57 
 
 
424 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.320065  normal  0.255767 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1234  sodium-dependent nucleoside transport protein  34.59 
 
 
401 aa  246  4e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6715  Na+ dependent nucleoside transporter  36.57 
 
 
424 aa  246  5e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0332  Na+ dependent nucleoside transporter-like  35.44 
 
 
409 aa  245  1e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3295  Na+ dependent nucleoside transporter-like  35.65 
 
 
418 aa  245  1e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0945024  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1484  nucleoside transporter  35.35 
 
 
416 aa  244  2e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.125327  hitchhiker  0.000367127 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1494  nucleoside transporter  35.35 
 
 
416 aa  244  2e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.432303  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0801  nucleoside transporter, NupC family  35.35 
 
 
416 aa  244  2e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3499  NupC family nucleoside transporter  36.94 
 
 
423 aa  243  5e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004082  NupC family protein  37.13 
 
 
371 aa  243  5e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.117555  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3628  nucleoside transporter  36.94 
 
 
423 aa  243  5e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0832  NupC family nucleoside transporter  36.94 
 
 
423 aa  242  7e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2311  NupC family nucleoside transporter  35.11 
 
 
416 aa  242  7e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0705452  decreased coverage  0.000255025 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02052  hypothetical protein  35.11 
 
 
416 aa  241  1e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02093  predicted nucleoside transporter  35.11 
 
 
416 aa  241  1e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3056  Na+ dependent nucleoside transporter  34.54 
 
 
418 aa  240  4e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>