177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0037 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0037  phosphopentomutase  100 
 
 
391 aa  800  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  7.00156e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3719  phosphopentomutase  61.86 
 
 
390 aa  501  1e-141  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0140  phosphopentomutase  57.11 
 
 
396 aa  461  1e-129  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0677  phosphopentomutase  56.81 
 
 
388 aa  456  1e-127  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0408  phosphopentomutase  55.32 
 
 
389 aa  449  1e-125  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1100  phosphopentomutase  55.17 
 
 
397 aa  444  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3205  phosphopentomutase  54.34 
 
 
392 aa  439  1e-122  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1472  phosphopentomutase  54.12 
 
 
394 aa  434  1e-120  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215441  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3449  phosphopentomutase  54.45 
 
 
388 aa  431  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1773  phosphopentomutase  54.66 
 
 
390 aa  431  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1500  phosphopentomutase  52.63 
 
 
389 aa  427  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2256  phosphopentomutase  52.32 
 
 
393 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2786  phosphopentomutase  51.78 
 
 
395 aa  415  1e-115  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000455105  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2053  phosphopentomutase  51.8 
 
 
397 aa  417  1e-115  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1319  phosphopentomutase  50.92 
 
 
396 aa  416  1e-115  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3918  phosphopentomutase  50.76 
 
 
394 aa  412  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000783591  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0781  phosphopentomutase  55.09 
 
 
390 aa  414  1e-114  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0758  phosphopentomutase  54.83 
 
 
390 aa  414  1e-114  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4197  phosphopentomutase  50.51 
 
 
394 aa  411  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00100464  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1040  phosphopentomutase  50.51 
 
 
394 aa  410  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000119876  hitchhiker  0.000224801 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0368  phosphopentomutase  51.96 
 
 
393 aa  411  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3844  phosphopentomutase  50.25 
 
 
394 aa  407  1e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.512526  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3828  phosphopentomutase  50.25 
 
 
394 aa  406  1e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0706266  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4309  phosphopentomutase  50.25 
 
 
394 aa  406  1e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0282781  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4156  phosphopentomutase  50.25 
 
 
394 aa  407  1e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0317626  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4111  phosphopentomutase  50.25 
 
 
394 aa  406  1e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.25334e-34 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1667  phosphopentomutase  48.84 
 
 
392 aa  405  1e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.104924  normal  0.0318533 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4220  phosphopentomutase  50.25 
 
 
394 aa  407  1e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.3434e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3997  phosphopentomutase  50.25 
 
 
394 aa  406  1e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1743  phosphopentomutase  50 
 
 
396 aa  402  1e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1281  phosphopentomutase  49.23 
 
 
397 aa  403  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.477667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0130  phosphopentomutase  49.22 
 
 
392 aa  397  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0608  phosphopentomutase  48.07 
 
 
390 aa  397  1e-109  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6094  phosphopentomutase  48.47 
 
 
420 aa  397  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.11773  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0125  phosphopentomutase  49.22 
 
 
392 aa  397  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2847  phosphopentomutase  49.36 
 
 
391 aa  394  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0376  phosphopentomutase  50.63 
 
 
396 aa  390  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0371  phosphopentomutase  50.38 
 
 
396 aa  390  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1791  phosphopentomutase  50.4 
 
 
392 aa  390  1e-107  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0112  phosphopentomutase  49.11 
 
 
397 aa  374  1e-102  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  7.0678e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1749  phosphopentomutase  48.33 
 
 
390 aa  366  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06950  phosphopentomutase  48.67 
 
 
349 aa  362  6e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.56293  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2320  phosphopentomutase  46.04 
 
 
392 aa  361  1e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.29879e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2314  phosphopentomutase  46.61 
 
 
385 aa  358  9e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.932975  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2846  phosphopentomutase  48.3 
 
 
386 aa  352  7e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0905  phosphopentomutase  45.52 
 
 
391 aa  350  3e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0150  phosphopentomutase  47.91 
 
 
381 aa  348  1e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.51514  normal  0.178171 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0586  phosphopentomutase  45.76 
 
 
392 aa  345  1e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.036632  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0954  phosphopentomutase  44.99 
 
 
388 aa  342  7e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1001  phosphopentomutase  48.16 
 
 
411 aa  340  2e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0956  phosphopentomutase  44.87 
 
 
388 aa  339  4e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1077  phosphopentomutase  45.66 
 
 
403 aa  338  1e-91  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0951  phosphopentomutase  44.94 
 
 
389 aa  335  8e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2069  phosphopentomutase  45.32 
 
 
403 aa  333  2e-90  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0253086  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1182  phosphopentomutase  45.32 
 
 
403 aa  333  2e-90  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0280  phosphopentomutase  43.72 
 
 
397 aa  308  7e-83  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.240489  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0610  phosphopentomutase  42.12 
 
 
392 aa  305  9e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3091  phosphopentomutase  38.6 
 
 
384 aa  300  3e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0618419  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3450  phosphopentomutase  43.32 
 
 
407 aa  298  1e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2446  phosphopentomutase  43.04 
 
 
401 aa  298  1e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.892487  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3625  phosphopentomutase  42.29 
 
 
407 aa  297  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.871395  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0829  phosphopentomutase  42.29 
 
 
407 aa  298  2e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3496  phosphopentomutase  42.29 
 
 
407 aa  297  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0662  phosphopentomutase  41.36 
 
 
407 aa  296  3e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4099  phosphopentomutase  42.89 
 
 
409 aa  293  3e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0693  phosphopentomutase  41.35 
 
 
407 aa  292  7e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3331  phosphopentomutase  42.22 
 
 
407 aa  292  8e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00236172  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0601  phosphopentomutase  42.23 
 
 
407 aa  292  9e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0676  phosphopentomutase  40.6 
 
 
407 aa  290  3e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4618  phosphopentomutase  42.29 
 
 
407 aa  290  4e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4982  phosphopentomutase  42.29 
 
 
407 aa  290  4e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0621  phosphopentomutase  42.75 
 
 
406 aa  290  4e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.482863  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4932  phosphopentomutase  42.29 
 
 
407 aa  290  4e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.912083  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5898  phosphopentomutase  42.29 
 
 
407 aa  290  4e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3615  phosphopentomutase  42.29 
 
 
407 aa  290  4e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3673  phosphopentomutase  42.29 
 
 
407 aa  290  4e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.863426  normal  0.273161 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4930  phosphopentomutase  42.29 
 
 
407 aa  290  4e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4181  phosphopentomutase  42.16 
 
 
406 aa  289  5e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0823  phosphopentomutase  41.65 
 
 
407 aa  289  5e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2985  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4925  phosphopentomutase  42.93 
 
 
407 aa  289  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.141985  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4823  phosphopentomutase  42.93 
 
 
407 aa  289  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4891  phosphopentomutase  42.93 
 
 
407 aa  289  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0858658  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4977  phosphopentomutase  42.93 
 
 
407 aa  289  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04259  phosphopentomutase  42.29 
 
 
407 aa  289  7e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04225  hypothetical protein  42.29 
 
 
407 aa  289  7e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.836281  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4984  phosphopentomutase  42.93 
 
 
407 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2820  phosphopentomutase  42.57 
 
 
404 aa  288  1e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.776511  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1927  phosphopentomutase  41.81 
 
 
406 aa  288  2e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1004  phosphopentomutase  41.34 
 
 
405 aa  286  5e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.490105  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4469  phosphopentomutase  41.42 
 
 
406 aa  285  9e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614507  normal  0.393425 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1976  phosphopentomutase  40.2 
 
 
404 aa  285  9e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0351038  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3225  phosphopentomutase  42.33 
 
 
404 aa  285  1e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0229  phosphopentomutase  42.4 
 
 
406 aa  285  1e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44638  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3364  phosphopentomutase  42.33 
 
 
404 aa  285  1e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.438117  hitchhiker  0.00673377 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3228  phosphopentomutase  42.33 
 
 
404 aa  284  2e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1142  phosphopentomutase  42.08 
 
 
404 aa  283  3e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  6.56152e-07 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002631  phosphopentomutase  41.13 
 
 
406 aa  282  6e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03375  phosphopentomutase  40.49 
 
 
406 aa  281  1e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3376  phosphopentomutase  39.95 
 
 
405 aa  279  5e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.301348  normal  0.0494326 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0975  phosphopentomutase  41.91 
 
 
407 aa  279  6e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.515828  hitchhiker  0.00460474 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>