12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0032 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0032  hypothetical protein  100 
 
 
323 aa  637  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2121  hypothetical protein  21.69 
 
 
374 aa  71.6  2e-11  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0895  hypothetical protein  43.9 
 
 
77 aa  55.8  8e-07  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1344  hypothetical protein  38.89 
 
 
402 aa  53.9  3e-06  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2111  hypothetical protein  44.83 
 
 
63 aa  53.5  5e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.92847 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3785  hypothetical protein  41.67 
 
 
570 aa  52  1e-05  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.477688 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1130  hypothetical protein  38.46 
 
 
175 aa  50.4  4e-05  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.659523  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5367  hypothetical protein  48.15 
 
 
403 aa  49.7  7e-05  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.128779  hitchhiker  0.00120871 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2573  hypothetical protein  40.3 
 
 
386 aa  48.1  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.298255  normal  0.109685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8546  hypothetical protein  46.3 
 
 
233 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000672005  hitchhiker  0.000280584 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0865  hypothetical protein  39.68 
 
 
114 aa  44.3  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1305  hypothetical protein  28.85 
 
 
413 aa  43.5  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>