More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0030 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0030  ATPase AAA-2 domain protein  100 
 
 
834 aa  1650    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1508  ATP-dependent chaperone ClpB  40.47 
 
 
864 aa  642    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.280077  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1381  ATP-dependent chaperone ClpB  39.93 
 
 
857 aa  611  1e-173  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000310398  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1002  ATP-dependent chaperone ClpB  40.77 
 
 
859 aa  612  1e-173  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1959  ATPase AAA-2  39.98 
 
 
862 aa  607  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0199054  normal  0.312929 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0092  ATP-dependent chaperone protein ClpB  39.88 
 
 
864 aa  608  9.999999999999999e-173  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0030598 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1077  ATP-dependent chaperone ClpB  38.81 
 
 
871 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000152857  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1970  clpB protein  39.01 
 
 
866 aa  604  1.0000000000000001e-171  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1585  ATP-binding subunit of Clp protease  40.12 
 
 
889 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2007  ATP-dependent chaperone ClpB  38.77 
 
 
863 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.324235  normal  0.227256 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1210  ATPase AAA-2  41.01 
 
 
861 aa  605  1.0000000000000001e-171  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0522971  normal  0.881937 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0885  ATPase  39.3 
 
 
866 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1638  ATP-dependent chaperone ClpB  39.01 
 
 
866 aa  604  1.0000000000000001e-171  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000923416 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0817  ATP-dependent chaperone ClpB  38.45 
 
 
859 aa  600  1e-170  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.220377  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1335  ATP-dependent protease  38.92 
 
 
862 aa  599  1e-170  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.255547  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1980  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  39.48 
 
 
862 aa  599  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.192819  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1859  ATP-dependent chaperone ClpB  39.88 
 
 
868 aa  599  1e-170  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3422  ATPase  39.68 
 
 
867 aa  601  1e-170  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.04082  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02482  protein disaggregation chaperone  38.82 
 
 
857 aa  595  1e-169  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000328184  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1080  ATP-dependent chaperone ClpB  38.82 
 
 
857 aa  595  1e-169  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000145981  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1118  clpB protein  39.14 
 
 
863 aa  597  1e-169  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1271  ATP-dependent chaperone ClpB  39.04 
 
 
862 aa  596  1e-169  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.387931 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02446  hypothetical protein  38.82 
 
 
857 aa  595  1e-169  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000202693  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2746  protein disaggregation chaperone  38.82 
 
 
857 aa  595  1e-169  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00462147  normal  0.181562 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2750  protein disaggregation chaperone  38.82 
 
 
857 aa  595  1e-169  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000917665  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1089  protein disaggregation chaperone  38.82 
 
 
857 aa  595  1e-169  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000860565  decreased coverage  0.000000635783 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3833  protein disaggregation chaperone  38.82 
 
 
857 aa  595  1e-169  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000168048  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1223  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  38.49 
 
 
866 aa  595  1e-169  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1210  ATP-dependent chaperone ClpB  39.16 
 
 
862 aa  597  1e-169  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.890836  normal  0.0751244 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2973  protein disaggregation chaperone  38.82 
 
 
857 aa  595  1e-169  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000839096  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2878  protein disaggregation chaperone  38.82 
 
 
857 aa  595  1e-169  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000852772  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1785  ATPase  38.65 
 
 
865 aa  597  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1737  ATPase  39.05 
 
 
873 aa  596  1e-169  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1871  ATP-dependent chaperone ClpB  38.65 
 
 
865 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914514  hitchhiker  0.00068735 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1757  ATP-dependent chaperone ClpB  38.65 
 
 
865 aa  597  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.786862  normal  0.0714253 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3819  ATP-dependent chaperone ClpB  37.97 
 
 
861 aa  594  1e-168  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0624258  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2261  clpB protein  38.42 
 
 
865 aa  592  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342384  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1090  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpB  38.6 
 
 
866 aa  592  1e-168  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.930784  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2389  ClpB heat-shock protein  38.42 
 
 
865 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2223  ATPase AAA-2  38.42 
 
 
865 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.221063  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1177  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpB  38.6 
 
 
866 aa  592  1e-168  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0991  ATP-dependent chaperone ClpB  38.54 
 
 
864 aa  593  1e-168  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.462361  normal  0.380293 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2205  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  38.42 
 
 
865 aa  592  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.489947  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1456  ATP-dependent chaperone ClpB  38.17 
 
 
864 aa  592  1e-168  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.893525  normal  0.727784 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1195  chaperone  38.49 
 
 
879 aa  593  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1218  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4119  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  38.49 
 
 
866 aa  593  1e-168  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0887  ATP-dependent chaperone ClpB  46.74 
 
 
854 aa  593  1e-168  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.763856  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6232  ATPase AAA-2  38.53 
 
 
865 aa  594  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1681  clpB protein  40.91 
 
 
866 aa  595  1e-168  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0886  protein disaggregation chaperone  38.13 
 
 
857 aa  593  1e-168  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000176912  normal  0.0332416 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1077  ATPase  39.02 
 
 
866 aa  595  1e-168  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1039  ATPase  38.36 
 
 
873 aa  593  1e-168  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.924654  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1847  ATPase  38.53 
 
 
865 aa  594  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2989  protein disaggregation chaperone  37.88 
 
 
857 aa  591  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0921142  normal  0.947824 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0920  ATPase  38.26 
 
 
871 aa  590  1e-167  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1287  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  38.49 
 
 
866 aa  590  1e-167  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1072  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  38.6 
 
 
866 aa  592  1e-167  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1377  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  38.3 
 
 
865 aa  591  1e-167  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1327  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  38.49 
 
 
866 aa  590  1e-167  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0938  ATP-dependent chaperone ClpB  38.88 
 
 
865 aa  592  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.651137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4026  ATPase AAA-2 domain protein  39.23 
 
 
868 aa  590  1e-167  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15159  normal  0.203961 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2856  protein disaggregation chaperone  37.88 
 
 
857 aa  591  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448929  normal  0.22616 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5148  AAA ATPase, ClpB  38.3 
 
 
865 aa  591  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.830586  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2877  protein disaggregation chaperone  37.88 
 
 
857 aa  591  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0185165  normal  0.16875 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2646  ATP-dependent chaperone ClpB  38.29 
 
 
860 aa  591  1e-167  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1138  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  38.3 
 
 
865 aa  591  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.118754  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1337  ATPase AAA-2  38.78 
 
 
858 aa  589  1e-167  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184939  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1867  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  38.3 
 
 
865 aa  591  1e-167  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.60175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1416  clpB protein  40.91 
 
 
866 aa  591  1e-167  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2875  protein disaggregation chaperone  37.88 
 
 
857 aa  591  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0261758  normal  0.114716 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1426  ATP-dependent chaperone ClpB  38.53 
 
 
865 aa  589  1e-167  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.814742  hitchhiker  0.00462707 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0030  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  38.3 
 
 
865 aa  591  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2772  protein disaggregation chaperone  37.88 
 
 
857 aa  591  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000279848  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3913  ATP-dependent chaperone protein ClpB  38.77 
 
 
861 aa  585  1e-166  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1950  ATP-dependent chaperone ClpB  37.46 
 
 
872 aa  585  1e-166  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1864  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  37.97 
 
 
874 aa  588  1e-166  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1714  endopeptidase Clp ATP-binding chain B (ClpB)  38.22 
 
 
858 aa  585  1e-166  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0200  ATPase  38.83 
 
 
867 aa  586  1e-166  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.371355  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0823  ATP-dependent chaperone ClpB  38.35 
 
 
865 aa  586  1e-166  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.457177  normal  0.714446 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2232  ATPase  37.98 
 
 
870 aa  588  1e-166  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1797  ATP-dependent chaperone ClpB  37.85 
 
 
931 aa  586  1e-166  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.287163  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0359  heat shock protein ClpB-like  37.91 
 
 
872 aa  587  1e-166  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2374  heat-shock protein, chaperone ClpB  38.26 
 
 
865 aa  587  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0849473  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4437  ATP-dependent chaperone ClpB  37.76 
 
 
876 aa  587  1e-166  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.404324  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0836  ATP-dependent chaperone ClpB  40 
 
 
860 aa  588  1e-166  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00212148  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4294  ATPase  38.42 
 
 
871 aa  586  1e-166  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2465  ATP-dependent chaperone ClpB  39.88 
 
 
880 aa  587  1e-166  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2558  ATPase  38.93 
 
 
864 aa  588  1e-166  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.111038  hitchhiker  0.00562869 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0493  ATPase  40.09 
 
 
864 aa  588  1e-166  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1714  endopeptidase Clp ATP-binding chain B (ClpB)  38.22 
 
 
858 aa  585  1.0000000000000001e-165  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2727  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  38.91 
 
 
863 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.286656  normal  0.0275782 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0447  ATPase  39.7 
 
 
867 aa  582  1.0000000000000001e-165  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.000000333741  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3141  protein disaggregation chaperone  38 
 
 
857 aa  585  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0416591  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0753  chaperone clpB  38.36 
 
 
870 aa  585  1.0000000000000001e-165  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4001  ATP-dependent chaperone ClpB  37.98 
 
 
871 aa  584  1.0000000000000001e-165  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00358215  normal  0.0224301 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1919  ATPase AAA-2  38.18 
 
 
870 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.494579  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10731  ATP-dependent Clp protease, Hsp 100, ATP-binding subunit ClpB  42.89 
 
 
863 aa  585  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.977517  normal  0.696601 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1250  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  38.6 
 
 
866 aa  585  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0287  ATP-dependent chaperone ClpB  39.1 
 
 
864 aa  584  1.0000000000000001e-165  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1004  protein disaggregation chaperone  37.62 
 
 
857 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00329839  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>