More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0028 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0028  amino acid carrier protein  100 
 
 
470 aa  932  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0910  amino acid carrier protein  43.53 
 
 
454 aa  316  5e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  6.27243e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1695  amino acid carrier protein  39.41 
 
 
458 aa  315  1e-84  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.374608  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2411  sodium/alanine symporter family protein  38.46 
 
 
455 aa  298  2e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2481  sodium/alanine symporter family protein  38.25 
 
 
455 aa  296  8e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2140  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  38.33 
 
 
455 aa  295  1e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2381  sodium/alanine symporter family protein  38.03 
 
 
455 aa  294  2e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2217  sodium/alanine symporter family protein  38.03 
 
 
455 aa  294  2e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00259878  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2346  sodium/alanine symporter family protein  38.03 
 
 
455 aa  294  3e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2399  sodium/alanine symporter family protein  38.03 
 
 
455 aa  293  5e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2187  amino acid carrier protein  37.82 
 
 
455 aa  293  6e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2156  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  37.82 
 
 
455 aa  292  9e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.185543  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2979  sodium/alanine symporter family protein  37.61 
 
 
455 aa  290  4e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.626895 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0195  amino acid carrier protein  38.12 
 
 
460 aa  280  6e-74  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1145  sodium:alanine symporter family protein  38.81 
 
 
448 aa  278  2e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00166768  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1408  sodium/alanine symporter  36.9 
 
 
462 aa  273  6e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1672  sodium:alanine symporter family protein  36.9 
 
 
462 aa  272  1e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1133  amino acid carrier protein  38.36 
 
 
456 aa  268  1e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1827  branched-chain amino acid transport protein  35.11 
 
 
472 aa  268  1e-70  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2730  amino acid carrier protein  36.06 
 
 
469 aa  267  3e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227579  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2852  amino acid carrier protein  34.69 
 
 
463 aa  266  7e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0607  amino acid carrier protein  36.55 
 
 
456 aa  265  1e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2767  amino acid carrier protein  37.39 
 
 
450 aa  265  1e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.070089  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3734  amino acid carrier protein  35.27 
 
 
459 aa  263  5e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3842  amino acid/cation symporter  35.73 
 
 
460 aa  262  1e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.489392  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2245  amino acid carrier protein  37.55 
 
 
468 aa  261  2e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1336  amino acid carrier protein  35.03 
 
 
457 aa  260  3e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.70325e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3333  amino acid carrier protein  37.03 
 
 
458 aa  259  5e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1156  amino acid carrier protein  36.09 
 
 
456 aa  259  9e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.086195 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0498  amino acid carrier protein  36.3 
 
 
458 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3952  amino acid carrier protein  36.3 
 
 
458 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3770  amino acid carrier protein  36.3 
 
 
458 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1796  sodium/alanine symporter  35.19 
 
 
460 aa  258  2e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3826  amino acid carrier protein  36.3 
 
 
458 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1973  amino acid carrier protein  35.02 
 
 
458 aa  258  2e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.123631 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3541  amino acid carrier protein  35.42 
 
 
457 aa  257  4e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1259  amino acid carrier family protein  36.6 
 
 
474 aa  256  5e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  4.59573e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0368  amino acid carrier protein  33.12 
 
 
451 aa  255  1e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000970174  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0993  Na+/alanine symporter  35.64 
 
 
447 aa  253  6e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000614522  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1032  sodium/alanine symporter  34.41 
 
 
456 aa  252  1e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.065178  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0649  amino acid carrier protein  35.65 
 
 
456 aa  252  1e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0092  amino acid carrier protein  36.12 
 
 
455 aa  251  3e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2729  amino acid carrier protein  36.42 
 
 
466 aa  249  6e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.370789  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1161  amino acid carrier protein  36.52 
 
 
453 aa  248  2e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0819225  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0573  amino acid carrier protein  35.37 
 
 
443 aa  248  2e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0685  amino acid carrier protein  35.65 
 
 
449 aa  247  3e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0152054  normal  0.458275 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0799  sodium/alanine symporter  35.47 
 
 
458 aa  247  4e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2247  amino acid carrier protein  35.87 
 
 
443 aa  246  5e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0424  amino acid carrier protein  33.98 
 
 
457 aa  246  6e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003625  sodium/alanine symporter  33.84 
 
 
458 aa  246  8e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0757  amino acid carrier protein  36.9 
 
 
453 aa  245  1e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.537285  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1846  amino acid carrier protein  35.95 
 
 
445 aa  244  2e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.256454  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1664  seryl-tRNA synthetase, class IIA  35.04 
 
 
452 aa  243  4e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0197857  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0792  amino acid carrier protein  34.79 
 
 
443 aa  243  7e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.839726  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1814  amino acid carrier protein  36.79 
 
 
461 aa  243  7e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.135362  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4364  amino acid carrier protein  34.48 
 
 
459 aa  242  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0064  amino acid carrier protein  36.92 
 
 
435 aa  241  2e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194531  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5157  amino acid carrier protein  34.69 
 
 
458 aa  240  4e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0584  amino acid carrier protein  34.13 
 
 
459 aa  240  5e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000603825 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2703  amino acid carrier protein  34.41 
 
 
464 aa  239  7e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1578  amino acid carrier protein  34.29 
 
 
441 aa  239  8e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.152771  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31800  putative sodium:alanine symporter  33.55 
 
 
449 aa  237  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0139777  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2155  amino acid carrier protein  34.78 
 
 
464 aa  237  4e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.733934  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02469  hypothetical protein  34.06 
 
 
458 aa  236  7e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0163  amino acid carrier protein  34 
 
 
457 aa  235  1e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1513  amino acid carrier protein  34.81 
 
 
459 aa  235  1e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  7.93212e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3038  amino acid carrier protein  35.61 
 
 
470 aa  234  2e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0135  amino acid carrier protein  33.93 
 
 
480 aa  234  2e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0060  amino acid carrier protein  33.27 
 
 
503 aa  234  3e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.706762 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4884  amino acid carrier protein  34.77 
 
 
460 aa  233  5e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.182378  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00948  hypothetical protein  33.91 
 
 
494 aa  233  6e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2159  Na+/alanine symporter  35.59 
 
 
460 aa  232  8e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1608  amino acid carrier protein  35.82 
 
 
456 aa  233  8e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00276602  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06131  Na+/alanine symporter  35.59 
 
 
447 aa  232  9e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.407748  normal  0.332279 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3166  amino acid carrier protein  34.77 
 
 
459 aa  232  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21681  Sodium:alanine symporter family protein  35.63 
 
 
464 aa  232  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0888234 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3886  amino acid carrier protein  32.26 
 
 
459 aa  232  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00728667  normal  0.343174 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2252  amino acid carrier protein  31.99 
 
 
498 aa  232  1e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0078903  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28840  Sodium:alanine symporter  35.56 
 
 
447 aa  231  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2953  sodium:alanine symporter family protein  33.41 
 
 
464 aa  231  2e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2548  putative amino-acid transporter  34.22 
 
 
477 aa  230  5e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0255  amino acid carrier protein  36.48 
 
 
453 aa  229  6e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0134  amino acid carrier protein  33.33 
 
 
459 aa  229  7e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.183257 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004447  sodium/alanine symporter  34.76 
 
 
477 aa  229  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00130712  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0461  D-alanine glycine permease  36.26 
 
 
458 aa  229  1e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0104177  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0496  amino acid carrier protein  33.77 
 
 
457 aa  228  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2651  amino acid carrier protein  34.42 
 
 
475 aa  227  3e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00749872  normal  0.0440793 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5500  sodium/alanine transporter  33.48 
 
 
483 aa  226  6e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0662  amino acid carrier protein  34.15 
 
 
502 aa  226  7e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.166259  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1483  amino acid carrier protein  32.61 
 
 
445 aa  226  8e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.511941  hitchhiker  5.1081e-06 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0109  amino acid carrier protein  34.77 
 
 
505 aa  226  8e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.108225  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2492  sodium/alanine symporter  33.62 
 
 
448 aa  225  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0823  amino acid carrier protein  35.99 
 
 
424 aa  225  1e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0082  amino acid carrier protein  35.14 
 
 
468 aa  224  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3143  amino acid carrier protein  34.29 
 
 
452 aa  224  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5052  Sodium:alanine symporter  33.26 
 
 
483 aa  224  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.649994 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3148  amino acid carrier protein  30.32 
 
 
493 aa  223  4e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0259  amino acid carrier protein  32.39 
 
 
446 aa  223  6e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0916  sodium:alanine symporter family protein  34.26 
 
 
480 aa  222  1e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  2.10867e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0666  amino acid carrier protein  36.32 
 
 
487 aa  221  1e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.761891  normal  0.627654 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>