42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0026 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0026  hypothetical protein  100 
 
 
367 aa  745  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4880  hypothetical protein  49.58 
 
 
362 aa  360  3e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1451  hypothetical protein  44.62 
 
 
372 aa  323  3e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.553711  normal  0.492787 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05900  hypothetical protein  45.21 
 
 
363 aa  322  5e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.598804 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0048  hypothetical protein  41.3 
 
 
365 aa  285  1e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1885  hypothetical protein  40.87 
 
 
369 aa  281  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0121  hypothetical protein  37.75 
 
 
420 aa  279  6e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0554  hypothetical protein  39.73 
 
 
380 aa  276  4e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2488  hypothetical protein  38.95 
 
 
363 aa  275  1e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.492113  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2325  hypothetical protein  41.59 
 
 
369 aa  273  5e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2787  hypothetical protein  41.55 
 
 
364 aa  271  9e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0025  hypothetical protein  38.95 
 
 
392 aa  228  2e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2463  hypothetical protein  41.06 
 
 
431 aa  206  4e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0533  LOR/SDH bifunctional protein  32.84 
 
 
415 aa  160  5e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.990735  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0465  LOR/SDH bifunctional protein  32.55 
 
 
415 aa  155  8e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0372  LOR/SDH bifunctional protein  32.55 
 
 
415 aa  155  1e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.216176  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1454  LOR/SDH bifunctional protein  32.26 
 
 
415 aa  155  1e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0845  LOR/SDH bifunctional protein  28.86 
 
 
417 aa  140  3e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3854  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  28.15 
 
 
704 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2742  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  27.86 
 
 
705 aa  135  1e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2149  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  28.08 
 
 
440 aa  135  2e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.951911  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3360  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  27.86 
 
 
705 aa  135  2e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0297131  normal  0.880976 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2273  hypothetical protein  28.08 
 
 
703 aa  134  2e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503133  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1445  LOR/SDH bifunctional protein  27.92 
 
 
409 aa  134  2e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4659  hypothetical protein  28.9 
 
 
703 aa  134  2e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0175942 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0686  hypothetical protein  29.24 
 
 
409 aa  131  1e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0938  hypothetical protein  27.35 
 
 
409 aa  130  5e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.182607  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4047  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain-containing protein  27.68 
 
 
703 aa  129  7e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3232  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  27.35 
 
 
705 aa  129  7e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0636  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  26.22 
 
 
450 aa  127  4e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1005  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  28.21 
 
 
419 aa  124  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.538878  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2692  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  28.03 
 
 
410 aa  122  7e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0863  LOR/SDH bifunctional protein  29.5 
 
 
407 aa  122  1e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00957303 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1342  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  27.3 
 
 
408 aa  120  3e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0795325  normal  0.948696 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0299  LOR/SDH bifunctional protein  26.52 
 
 
410 aa  120  6e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4864  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain-containing protein  25 
 
 
412 aa  119  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0701737 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3107  LOR/SDH bifunctional protein  25.66 
 
 
435 aa  119  9e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2163  hypothetical protein  25.79 
 
 
405 aa  117  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.06153e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1408  LOR/SDH bifunctional protein  27.96 
 
 
411 aa  115  9e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  5.43179e-05  normal  0.449844 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1684  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  26.96 
 
 
429 aa  109  7e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0305327  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1826  LOR/SDH bifunctional protein  25.14 
 
 
411 aa  107  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.263588  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3091  LOR/SDH bifunctional enzyme region  22.13 
 
 
414 aa  89.4  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>