42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0025 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0025  hypothetical protein  100 
 
 
392 aa  801  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4880  hypothetical protein  48.28 
 
 
362 aa  322  5e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1451  hypothetical protein  44.38 
 
 
372 aa  322  7e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.553711  normal  0.492787 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0554  hypothetical protein  43.38 
 
 
380 aa  294  2e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0048  hypothetical protein  43.1 
 
 
365 aa  293  4e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05900  hypothetical protein  41.69 
 
 
363 aa  290  4e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.598804 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0121  hypothetical protein  39.85 
 
 
420 aa  284  2e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1885  hypothetical protein  40.62 
 
 
369 aa  269  6e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2325  hypothetical protein  40.9 
 
 
369 aa  266  4e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2488  hypothetical protein  39.22 
 
 
363 aa  264  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.492113  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2787  hypothetical protein  38.98 
 
 
364 aa  258  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0026  hypothetical protein  38.95 
 
 
367 aa  228  2e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2463  hypothetical protein  45.68 
 
 
431 aa  221  1e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2692  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  32.08 
 
 
410 aa  161  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0845  LOR/SDH bifunctional protein  33.24 
 
 
417 aa  158  2e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0299  LOR/SDH bifunctional protein  31.79 
 
 
410 aa  154  2e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0465  LOR/SDH bifunctional protein  34.94 
 
 
415 aa  152  9e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1005  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  31.61 
 
 
419 aa  152  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.538878  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1454  LOR/SDH bifunctional protein  34.94 
 
 
415 aa  151  1e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0372  LOR/SDH bifunctional protein  34.62 
 
 
415 aa  150  4e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.216176  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0533  LOR/SDH bifunctional protein  33.97 
 
 
415 aa  148  2e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.990735  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1445  LOR/SDH bifunctional protein  32.13 
 
 
409 aa  146  6e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2273  hypothetical protein  31.82 
 
 
703 aa  146  7e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503133  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3854  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  32.29 
 
 
704 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4864  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain-containing protein  31.27 
 
 
412 aa  144  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0701737 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2742  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  31.14 
 
 
705 aa  142  1e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1684  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  31.3 
 
 
429 aa  142  1e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0305327  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3360  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  31.14 
 
 
705 aa  141  2e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0297131  normal  0.880976 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1826  LOR/SDH bifunctional protein  31.86 
 
 
411 aa  138  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.263588  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0863  LOR/SDH bifunctional protein  29.56 
 
 
407 aa  137  4e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00957303 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4659  hypothetical protein  31.28 
 
 
703 aa  137  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0175942 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3232  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  31.34 
 
 
705 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3107  LOR/SDH bifunctional protein  29.46 
 
 
435 aa  136  6e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1342  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  27.87 
 
 
408 aa  136  7e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0795325  normal  0.948696 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0938  hypothetical protein  30.06 
 
 
409 aa  134  4e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.182607  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4047  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain-containing protein  30.59 
 
 
703 aa  131  2e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2149  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  28.86 
 
 
440 aa  127  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.951911  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0686  hypothetical protein  31.56 
 
 
409 aa  125  1e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0636  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  29.08 
 
 
450 aa  124  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2163  hypothetical protein  30.26 
 
 
405 aa  118  2e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.06153e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1408  LOR/SDH bifunctional protein  29.11 
 
 
411 aa  117  5e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  5.43179e-05  normal  0.449844 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3091  LOR/SDH bifunctional enzyme region  29.38 
 
 
414 aa  114  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>