164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0014 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0015  extracellular solute-binding protein family 5  59.65 
 
 
728 aa  910  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  9.73096e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0014  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
714 aa  1459  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.021356  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0266  extracellular solute-binding protein family 5  26.04 
 
 
575 aa  82  4e-14  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0208  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 
575 aa  80.5  1e-13  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1071  peptide ABC transporter, peptide-binding protein OppA  25.37 
 
 
591 aa  78.6  4e-13  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  4.08917e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0219  extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 
575 aa  77  1e-12  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0218  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  24.03 
 
 
559 aa  75.9  2e-12  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0245  oligopeptide-binding protein OppA  24.93 
 
 
575 aa  75.9  2e-12  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.17 
 
 
575 aa  75.9  2e-12  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.019765  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5080  oligopeptide-binding protein OppA  24.93 
 
 
575 aa  75.9  2e-12  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0247  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein, putative  24.65 
 
 
567 aa  75.9  3e-12  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.460021  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0265  oligopeptide-binding protein OppA  24.37 
 
 
566 aa  75.5  3e-12  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0241  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.82 
 
 
575 aa  74.3  6e-12  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0231  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  23.82 
 
 
555 aa  74.3  8e-12  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0207  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 
567 aa  73.9  9e-12  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0205  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.65 
 
 
575 aa  73.6  1e-11  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0567  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.67 
 
 
592 aa  73.2  2e-11  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0248  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein, putative  23.61 
 
 
575 aa  72  4e-11  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0570  extracellular solute-binding protein  24.75 
 
 
591 aa  71.6  5e-11  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  24.51 
 
 
557 aa  68.9  3e-10  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0551  extracellular solute-binding protein  23.86 
 
 
591 aa  69.3  3e-10  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0566  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.77 
 
 
593 aa  67  1e-09  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2555  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, oligopeptide/dipeptide-binding protein  26.33 
 
 
580 aa  65.9  2e-09  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2258  solute-binding family 5 protein  26.33 
 
 
579 aa  65.9  3e-09  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0724  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.54 
 
 
593 aa  65.5  4e-09  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0713  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.54 
 
 
593 aa  64.3  7e-09  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303874 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0623  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  24.54 
 
 
593 aa  64.3  7e-09  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0656  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  24.54 
 
 
593 aa  64.3  7e-09  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0785  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.77 
 
 
593 aa  63.9  9e-09  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2857  extracellular solute-binding protein  28.09 
 
 
593 aa  61.6  4e-08  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.358002 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1768  extracellular solute-binding protein family 5  27.85 
 
 
579 aa  58.9  3e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  4.49992e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2906  extracellular solute-binding protein family 5  23.72 
 
 
574 aa  59.3  3e-07  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0785  extracellular solute-binding protein family 5  21.14 
 
 
600 aa  58.2  5e-07  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4290  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 
530 aa  57.4  1e-06  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00787986  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  34.82 
 
 
536 aa  57  1e-06  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0477  extracellular solute-binding protein family 5  33.98 
 
 
573 aa  57  1e-06  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0189  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  34.82 
 
 
536 aa  56.6  1e-06  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1009  extracellular solute-binding protein  22.81 
 
 
571 aa  57  1e-06  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0190  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  34.82 
 
 
536 aa  56.6  1e-06  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0990  extracellular solute-binding protein  22.81 
 
 
571 aa  57  1e-06  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1652  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.8 
 
 
511 aa  56.2  2e-06  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.2387  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0214  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  34.82 
 
 
536 aa  55.8  2e-06  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  34.82 
 
 
536 aa  56.6  2e-06  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1273  extracellular solute-binding protein family 5  22.49 
 
 
593 aa  56.2  2e-06  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0190  extracellular solute-binding protein  33.93 
 
 
533 aa  55.1  4e-06  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2890  extracellular solute-binding protein  30.3 
 
 
529 aa  55.1  5e-06  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271762  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2203  extracellular solute-binding protein family 5  21.13 
 
 
531 aa  52.8  2e-05  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0247328 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0233  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  33.93 
 
 
536 aa  53.1  2e-05  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0778  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  26.67 
 
 
605 aa  52.8  2e-05  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  3.35108e-05  hitchhiker  1.76984e-12 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5110  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  33.93 
 
 
536 aa  53.1  2e-05  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0132  extracellular solute-binding protein  30.3 
 
 
529 aa  52.4  3e-05  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229364  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1596  extracellular solute-binding protein family 5  33.94 
 
 
572 aa  52.4  3e-05  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0368881  unclonable  7.93881e-23 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1481  ABC oligopeptide transporter, perplasmic substrate-binding protein OppA  30.3 
 
 
529 aa  52  4e-05  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.869658  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0779  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  26.34 
 
 
590 aa  51.2  6e-05  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00616067  hitchhiker  1.4746e-14 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0174  extracellular solute-binding protein  28.48 
 
 
536 aa  50.8  8e-05  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1649  extracellular solute-binding protein family 5  30.66 
 
 
584 aa  50.8  9e-05  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3271  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 
571 aa  50.4  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00499057  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5193  extracellular solute-binding protein  25.14 
 
 
529 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0587295  normal  0.27415 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0406  extracellular solute-binding protein  49.06 
 
 
579 aa  50.4  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4404  extracellular solute-binding protein  31.58 
 
 
536 aa  49.3  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001004  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  32.38 
 
 
541 aa  49.3  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3270  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 
567 aa  49.3  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0963189  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3345  ABC transporter substrate-binding protein  28.31 
 
 
570 aa  48.9  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0921208  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4268  extracellular solute-binding protein family 5  25.88 
 
 
551 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3596  oligopeptide transporter, periplasmic-binding protein  28.31 
 
 
570 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.66683e-08 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3888  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  24.44 
 
 
550 aa  48.5  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.799639  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4328  extracellular solute-binding protein family 5  25.88 
 
 
551 aa  48.5  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.310509  normal  0.0771259 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0538  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  30.87 
 
 
525 aa  48.5  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.461639  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1344  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  32.28 
 
 
548 aa  48.1  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  4.29246e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1306  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  32.28 
 
 
548 aa  48.1  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0193944  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0390  extracellular solute-binding protein  47.17 
 
 
579 aa  48.1  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0468  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  31.33 
 
 
525 aa  48.1  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15570  extracellular solute-binding protein, family 5  21.74 
 
 
619 aa  47.8  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0497629  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1344  extracellular solute-binding protein  23.34 
 
 
638 aa  47.8  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.439366 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2742  extracellular solute-binding protein family 5  24.9 
 
 
541 aa  47.8  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2178  extracellular solute-binding protein  26.82 
 
 
529 aa  47.8  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.246301  normal  0.618007 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4331  putative binding protein  24.34 
 
 
535 aa  47.4  0.0009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4497  extracellular solute-binding protein family 5  25.69 
 
 
529 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.122706  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0187  extracellular solute-binding protein  22.39 
 
 
529 aa  47.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  1.20375e-06 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3603  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein, putative  27.85 
 
 
563 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.188296  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07058  hypothetical protein  24.61 
 
 
559 aa  47  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3377  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  25.5 
 
 
568 aa  47.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0900205  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3642  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  25.5 
 
 
568 aa  47.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1984  extracellular solute-binding protein family 5  29.25 
 
 
556 aa  47  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3292  ABC transporter, substrate-binding protein  27.31 
 
 
568 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000166709  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3050  extracellular solute-binding protein  29.79 
 
 
539 aa  47.4  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.423075 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0609  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  30.28 
 
 
543 aa  47.4  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3608  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.24 
 
 
568 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747033  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2999  extracellular solute-binding protein  34.33 
 
 
549 aa  47  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.305947  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3601  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein, putative  26.83 
 
 
568 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1450  peptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.55 
 
 
511 aa  46.2  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  4.30411e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1116  extracellular solute-binding protein family 5  25.78 
 
 
592 aa  46.2  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0366  extracellular solute-binding protein family 5  29.09 
 
 
607 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0359  extracellular solute-binding protein family 5  29.09 
 
 
607 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1356  extracellular solute-binding protein family 5  32.76 
 
 
596 aa  46.2  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3611  oligopeptide transporter, periplasmic-binding protein  27.02 
 
 
570 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00436293  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002959  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  28.44 
 
 
558 aa  46.6  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3293  ABC transporter substrate-binding protein  25.69 
 
 
567 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00121991  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3291  methyltransferase  26.83 
 
 
568 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.672963  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0180  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  34.86 
 
 
529 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>