49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0013 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0013  peptidoglycan hydrolase  100 
 
 
589 aa  1194    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0013556  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2088  cell wall-associated hydrolase  44.9 
 
 
355 aa  114  5e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.155991  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1259  peptidoglycan hydrolase  43.48 
 
 
228 aa  90.9  5e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00682301  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0864  peptidoglycan hydrolase  43.65 
 
 
249 aa  90.9  6e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000939547  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07880  glucan-binding domain-containing protein  26.72 
 
 
651 aa  89.4  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352799 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0606  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  27.34 
 
 
550 aa  80.9  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.907737  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0597  surface protein pspA precursor  26.64 
 
 
434 aa  77.8  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11330  putative cell wall binding protein  30.18 
 
 
502 aa  75.5  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.307599  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25520  conserved repeat protein  23.17 
 
 
613 aa  74.7  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0591  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  26.37 
 
 
573 aa  74.7  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000159659  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14530  glucan-binding domain-containing protein  26.06 
 
 
602 aa  73.2  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.259034 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0611  cell wall binding repeat-containing protein  26.07 
 
 
430 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0604  prophage LambdaSa1, lysin, putative  38.51 
 
 
239 aa  72.8  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.45234  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0607  cell wall binding repeat-containing protein  25.29 
 
 
454 aa  71.2  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0490  cell wall binding repeat-containing protein  32.33 
 
 
1557 aa  70.9  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06260  glucan-binding domain-containing protein  27.14 
 
 
324 aa  70.1  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0605  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  26.2 
 
 
807 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.187255  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0550  cell wall binding repeat-containing protein  23.63 
 
 
330 aa  68.2  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.515915  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0593  cell wall binding repeat-containing protein  28.46 
 
 
552 aa  67.4  0.0000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000201841  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0592  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  25.89 
 
 
891 aa  66.6  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0288009  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0091  hypothetical protein  24.07 
 
 
587 aa  66.6  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09550  putative cell wall binding protein  27.2 
 
 
331 aa  63.5  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0189396  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05950  glucan-binding domain-containing protein  23.55 
 
 
753 aa  62.8  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000330124  hitchhiker  0.0000000000107499 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08300  glycosyl hydrolase family 25  27.64 
 
 
592 aa  60.8  0.00000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.39526 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  24.9 
 
 
2495 aa  59.3  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06430  M6 family metalloprotease domain-containing protein  26.63 
 
 
811 aa  58.5  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0919314 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1747  YG repeat-containing glycosyl hydrolase family 70 protein  26.74 
 
 
1527 aa  57.8  0.0000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00880  putative cell wall binding protein  27.81 
 
 
478 aa  57.4  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal  0.955176 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04260  putative cell wall binding protein  29.14 
 
 
465 aa  57.4  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.878918  normal  0.401989 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00310  CHAP domain-containing protein  29.84 
 
 
302 aa  57  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14450  glucan-binding domain-containing protein  29.83 
 
 
532 aa  57  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.521361  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14470  putative cell wall binding protein  24.36 
 
 
512 aa  57  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.444931 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02530  glucan-binding domain-containing protein  22.56 
 
 
377 aa  55.1  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.459016  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11960  putative cell wall binding protein  33.59 
 
 
578 aa  55.1  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000480831  normal  0.155715 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16990  glucan-binding domain-containing protein  24.8 
 
 
342 aa  55.1  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0857  glycosyl hydrolase  30.65 
 
 
2821 aa  54.7  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16000  putative cell wall binding protein  25.68 
 
 
316 aa  54.7  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000272933 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14460  glucan-binding domain-containing protein  24.64 
 
 
757 aa  53.9  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.706218  normal  0.855897 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1837  prophage LambdaSa2, lysin, putative  32 
 
 
468 aa  52.8  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00322069  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0859  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.43 
 
 
399 aa  52.4  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000303579  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14440  subtilase family protease  25.51 
 
 
817 aa  52  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1094  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.76 
 
 
399 aa  52  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000219862  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00230  dipeptidase  26.13 
 
 
750 aa  50.8  0.00007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00762022 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05190  putative cell wall binding protein  29.92 
 
 
440 aa  49.7  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0151  S-layer domain ribonuclease  30.7 
 
 
1131 aa  47.4  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.965938  hitchhiker  0.000000320353 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0121  S-layer domain-containing ribonuclease  30.7 
 
 
1131 aa  47.4  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104142 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0891  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.29 
 
 
762 aa  47.4  0.0008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0223841  normal  0.138276 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5584  cell wall binding repeat-containing protein  25.56 
 
 
737 aa  46.6  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0077  S-layer protein  29.82 
 
 
697 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0803176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>