42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0011 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0011  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 
99 aa  199  1e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  1.57017e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2854  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase ATPase subunit  36.89 
 
 
109 aa  55.8  2e-07  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0273  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.91 
 
 
90 aa  53.5  1e-06  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0676  hypothetical protein  33 
 
 
111 aa  49.3  2e-05  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2130  cupin 2, barrel  29.59 
 
 
106 aa  49.3  2e-05  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.416896  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6918  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.37 
 
 
119 aa  48.9  2e-05  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2629  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.7 
 
 
116 aa  48.5  3e-05  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.525951 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1446  hypothetical protein  28.26 
 
 
111 aa  48.1  4e-05  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.48833  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1476  cupin family protein  32.04 
 
 
117 aa  47.8  5e-05  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  2.41751e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0589  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.68 
 
 
120 aa  46.2  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.524808  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3547  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.82 
 
 
107 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2487  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31 
 
 
122 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.450378  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2566  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.82 
 
 
107 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45610  hypothetical protein  29.13 
 
 
114 aa  46.2  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2292  hypothetical protein  31 
 
 
113 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1004  hypothetical protein  30 
 
 
117 aa  45.4  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.193395  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1589  hypothetical protein  30 
 
 
103 aa  45.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.106863  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2341  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase ATPase subunit  30.1 
 
 
110 aa  45.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.443612  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0837  cupin 2 domain-containing protein  32 
 
 
105 aa  44.7  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.665857  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1847  hypothetical protein  28.16 
 
 
105 aa  44.7  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06907  hypothetical protein  30 
 
 
103 aa  44.3  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0817  cupin 2 domain-containing protein  33.01 
 
 
105 aa  43.9  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0804  cupin 2 domain-containing protein  32.95 
 
 
107 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0832  cupin 2 domain-containing protein  31.46 
 
 
109 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1497  hypothetical protein  27.72 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.389737  normal  0.287846 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1490  hypothetical protein  28.71 
 
 
113 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805046  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1304  hypothetical protein  31.58 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4261  cupin 2 domain-containing protein  28.85 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.143664 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000905  lipid A 3-O-deacylase  28.43 
 
 
103 aa  42  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4627  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.85 
 
 
108 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.227246  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1597  cupin 2, barrel-containing protein  28.42 
 
 
115 aa  41.6  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00444258  normal  0.952557 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1869  hypothetical protein  31 
 
 
119 aa  42  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3968  cupin 2, barrel  25.96 
 
 
108 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3135  cupin 2 domain-containing protein  30.34 
 
 
109 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4122  hypothetical protein  25.96 
 
 
121 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0578  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase ATPase subunit  28.71 
 
 
109 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27 
 
 
127 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0389028  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03110  hypothetical protein  38.03 
 
 
133 aa  40.8  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.050196  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1816  cupin 2 domain-containing protein  34.72 
 
 
123 aa  40.8  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.337557  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3702  cupin 2 domain-containing protein  31 
 
 
105 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5251  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.09 
 
 
110 aa  40.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3511  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.95 
 
 
105 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.86943 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>