More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0005 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0006  DNA gyrase subunit B  54.89 
 
 
695 aa  687  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  6.1906e-14 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0005  DNA gyrase subunit B  57.7 
 
 
640 aa  714  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00230725  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0087  DNA gyrase subunit B  53.56 
 
 
650 aa  689  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  54.33 
 
 
649 aa  698  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  53.93 
 
 
644 aa  708  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  unclonable  1.55334e-06 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf800  DNA gyrase subunit B  53.29 
 
 
647 aa  667  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  53.79 
 
 
644 aa  700  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1109  hypothetical protein  52.56 
 
 
651 aa  676  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432981 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1432  DNA gyrase subunit B  52.85 
 
 
696 aa  661  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0004  DNA gyrase, B subunit  58.63 
 
 
802 aa  657  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  54.56 
 
 
643 aa  695  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  59.37 
 
 
640 aa  783  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3624  DNA topoisomerase IV subunit B  54.75 
 
 
654 aa  681  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  4.39989e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  57.89 
 
 
635 aa  712  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0005  DNA gyrase subunit B  58.18 
 
 
640 aa  715  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204678  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2993  DNA gyrase subunit B  57.14 
 
 
645 aa  667  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1048  DNA gyrase, B subunit  53.24 
 
 
665 aa  704  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.903378  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3685  DNA gyrase, B subunit  53.17 
 
 
636 aa  676  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.50658  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  60.28 
 
 
644 aa  768  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3608  DNA topoisomerase IV subunit B  54.75 
 
 
654 aa  681  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.88333e-33 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0005  DNA gyrase subunit B  57.7 
 
 
640 aa  714  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5315  DNA gyrase subunit B  57.55 
 
 
640 aa  706  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.021698  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1609  DNA topoisomerase IV subunit B  54.43 
 
 
654 aa  675  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  9.67673e-06  decreased coverage  6.94445e-13 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0442  DNA gyrase, B subunit  52.68 
 
 
634 aa  639  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1282  DNA gyrase subunit B  55.17 
 
 
641 aa  661  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3706  DNA topoisomerase IV subunit B  54.59 
 
 
654 aa  678  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  54.16 
 
 
636 aa  714  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  56.56 
 
 
635 aa  718  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  54.6 
 
 
627 aa  689  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10005  DNA gyrase subunit B  51.79 
 
 
714 aa  657  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0047  DNA gyrase, B subunit  52.43 
 
 
645 aa  679  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0782  DNA topoisomerase IV subunit B  52.44 
 
 
674 aa  642  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  1.86449e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0005  DNA gyrase subunit B  56.83 
 
 
649 aa  685  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0005  DNA gyrase, B subunit  59.78 
 
 
640 aa  724  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  53.85 
 
 
636 aa  709  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  3.63706e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0004  DNA gyrase, B subunit  59.31 
 
 
794 aa  648  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0004  DNA gyrase subunit B  56.12 
 
 
642 aa  709  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2254  DNA gyrase, B subunit  51.47 
 
 
646 aa  650  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0008  DNA gyrase, B subunit  53.5 
 
 
719 aa  655  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107754  hitchhiker  0.00597045 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0005  DNA gyrase, B subunit  59.78 
 
 
640 aa  724  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0006  DNA gyrase, B subunit  54.03 
 
 
686 aa  644  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629788 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0005  DNA gyrase subunit B  57.7 
 
 
640 aa  711  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  63.29 
 
 
633 aa  784  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  6.95632e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3285  DNA topoisomerase IV subunit B  54.11 
 
 
654 aa  672  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014971  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0005  DNA gyrase subunit B  57.55 
 
 
640 aa  704  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0177  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  51.01 
 
 
641 aa  673  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.724108  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0005  DNA gyrase, B subunit  58.37 
 
 
642 aa  719  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17611  DNA gyrase subunit B  53.06 
 
 
658 aa  657  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.616229  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0007  DNA gyrase, B subunit  53.5 
 
 
648 aa  652  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  6.47413e-07 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2816  DNA gyrase subunit B  54.68 
 
 
645 aa  654  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0322238  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4195  DNA gyrase, B subunit  52.37 
 
 
653 aa  673  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00698411 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0966  DNA gyrase, B subunit  53 
 
 
650 aa  666  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2247  DNA topoisomerase IV subunit B  54.11 
 
 
654 aa  671  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  2.27299e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0822  DNA gyrase subunit B  54.18 
 
 
675 aa  672  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.795596  normal  0.437658 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06825  DNA gyrase subunit B  51.48 
 
 
645 aa  660  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00060  DNA gyrase subunit B  54.29 
 
 
683 aa  676  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0007  DNA gyrase, B subunit  57.25 
 
 
642 aa  711  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000235506  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1260  DNA gyrase, B subunit  53.97 
 
 
660 aa  667  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0006  DNA gyrase, B subunit  56.55 
 
 
649 aa  693  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2717  DNA gyrase, B subunit  55.16 
 
 
649 aa  725  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0005  DNA gyrase, B subunit  52.62 
 
 
685 aa  659  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2558  DNA topoisomerase IV subunit B  54.99 
 
 
645 aa  671  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0005  DNA gyrase subunit B  59.46 
 
 
640 aa  732  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0005  DNA gyrase, B subunit  57.64 
 
 
636 aa  699  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0007  DNA gyrase, B subunit  52.39 
 
 
670 aa  639  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0006  DNA gyrase, B subunit  59.39 
 
 
635 aa  729  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.98095 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0130  DNA gyrase, B subunit  55.22 
 
 
636 aa  717  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.95821  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0051  DNA gyrase, B subunit  58.86 
 
 
640 aa  738  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0006  DNA gyrase, B subunit  52.44 
 
 
681 aa  665  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0006  DNA gyrase, B subunit  55.5 
 
 
645 aa  679  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0161215 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0006  DNA gyrase subunit B  55.25 
 
 
647 aa  679  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.195447  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2748  DNA gyrase, B subunit  56.78 
 
 
637 aa  761  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000339515  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0006  DNA gyrase B subunit  52.98 
 
 
656 aa  660  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.381905 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0820  DNA gyrase, B subunit  56.57 
 
 
644 aa  695  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.929877  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0306  DNA gyrase, B subunit  55.83 
 
 
643 aa  697  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.337431  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0010  DNA gyrase, B subunit  51.93 
 
 
680 aa  635  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2271  DNA gyrase, B subunit  56.37 
 
 
644 aa  709  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0041  DNA gyrase, B subunit  53.16 
 
 
691 aa  663  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0007  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  55.8 
 
 
647 aa  676  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_4  DNA gyrase, B subunit  56.28 
 
 
642 aa  712  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0005  DNA gyrase, B subunit  60 
 
 
637 aa  759  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0006  DNA gyrase, B subunit  55.35 
 
 
648 aa  701  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  4.66462e-07  hitchhiker  9.32752e-07 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0862  DNA gyrase, B subunit  53.51 
 
 
652 aa  664  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557988 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4986  DNA gyrase, B subunit  53.79 
 
 
651 aa  688  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639656  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0004  DNA gyrase, B subunit  57.73 
 
 
796 aa  637  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.783567 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00050  DNA gyrase subunit B  53.62 
 
 
720 aa  671  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1617  DNA topoisomerase IV subunit B  54.36 
 
 
656 aa  666  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  2.00667e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0005  DNA gyrase subunit B  58.9 
 
 
640 aa  724  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00215329  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0003  DNA gyrase subunit B  56.89 
 
 
772 aa  646  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  57.98 
 
 
650 aa  762  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  2.73734e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0995  DNA gyrase, B subunit  57.52 
 
 
645 aa  710  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  54.6 
 
 
637 aa  705  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  61.87 
 
 
642 aa  778  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0006  DNA gyrase, B subunit  53.96 
 
 
657 aa  679  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0640432  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0005  DNA gyrase, B subunit  53.07 
 
 
647 aa  641  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0006  DNA gyrase subunit B  54.55 
 
 
661 aa  676  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.925878  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0006  DNA gyrase, B subunit  55.64 
 
 
647 aa  706  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2729  DNA gyrase, B subunit  56.25 
 
 
641 aa  702  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.739794  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0005  DNA gyrase, B subunit  53.78 
 
 
686 aa  700  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.217672  normal  0.192252 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0005  DNA gyrase, B subunit  100 
 
 
633 aa  1297  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>