27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0003 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0003  S4 domain-containing protein  100 
 
 		 68 aa  133  7.000000000000001e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0464  S4 domain-containing protein  43.1 
 
 		 71 aa  49.7  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0103248  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0003  S4-like RNA binding protein  46.67 
 
 		 73 aa  50.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000208957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00030  RNA-binding S4 domain protein  43.33 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0173  S4 domain protein YaaA  40.35 
 
 		 72 aa  48.9  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.563705  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0003  RNA-binding S4 domain-containing protein  42.65 
 
 		 71 aa  48.5  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0003  S4 domain protein YaaA  35.82 
 
 		 76 aa  47  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0003  S4 region, YaaA  40.32 
 
 		 73 aa  47  0.00008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0098  RNA-binding S4  46.43 
 
 		 65 aa  47  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000456096  normal  0.262898 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2373  RNA-binding S4  39.71 
 
 		 68 aa  45.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0003  S4 domain-containing protein  40.98 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0003  S4 domain-containing protein  40.98 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5767  hypothetical protein  32.35 
 
 		 72 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3228  hypothetical protein  41.38 
 
 		 156 aa  44.3  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.199941  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0002  RNA-binding S4 domain protein  38.24 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000678168  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0003  RNA-binding S4 domain-containing protein  44.26 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0003  RNA-binding S4 domain protein  38.24 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.241542  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0342  RNA-binding S4 domain-containing protein  43.64 
 
 		 65 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000486446  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0003  S4-like RNA binding protein  40.62 
 
 		 148 aa  42  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf004  hypothetical protein  37.29 
 
 		 76 aa  42  0.003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2636  putative RNA-binding protein  34.78 
 
 		 69 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0140325  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0789  hypothetical protein  31.88 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0414  RNA-binding S4 domain protein  39.66 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1224  hypothetical protein  32.86 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0985687 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0618  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.06 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109181  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1607  RNA-binding S4 domain protein  35.85 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.932623 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0003  S4-like RNA binding protein  37.7 
 
 		 73 aa  40.4  0.007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>