More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0002 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0002  DNA polymerase III, beta subunit  100 
 
 		 370 aa  741    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0002  DNA polymerase III subunit beta  33.6 
 
 		 366 aa  206  5e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.279408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0002  DNA polymerase III subunit beta  33.6 
 
 		 366 aa  206  5e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.316057  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.82 
 
 		 370 aa  193  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2372  DNA polymerase III subunit beta  30.38 
 
 		 366 aa  179  7e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.73 
 
 		 365 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1551  DNA polymerase III, beta subunit  30.59 
 
 		 367 aa  168  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.422589  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.57 
 
 		 367 aa  168  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00020  DNA polymerase III, beta subunit  28.69 
 
 		 365 aa  169  1e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.46 
 
 		 366 aa  168  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.039801  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0002  DNA polymerase III subunit beta  31.23 
 
 		 379 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.23 
 
 		 379 aa  166  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.23 
 
 		 379 aa  166  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00656712  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0002  DNA polymerase III subunit beta  31.23 
 
 		 379 aa  167  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0872061  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.23 
 
 		 379 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.478099 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0003  DNA polymerase III, beta subunit  29.29 
 
 		 366 aa  167  4e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000553224  hitchhiker  0.000000389013 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0002  DNA polymerase III subunit beta  31.23 
 
 		 379 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.23 
 
 		 379 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132884  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.41 
 
 		 378 aa  166  8e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167002  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.77 
 
 		 380 aa  165  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.91 
 
 		 375 aa  163  6e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000418991  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5318  DNA polymerase III subunit beta  31.33 
 
 		 381 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.00172021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0002  DNA polymerase III subunit beta  31.33 
 
 		 381 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000341772  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.33 
 
 		 381 aa  162  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000678483  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00020  DNA polymerase III, beta subunit  31.55 
 
 		 367 aa  162  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.38 
 
 		 370 aa  159  7e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.07 
 
 		 381 aa  159  7e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.58 
 
 		 378 aa  159  7e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.08 
 
 		 389 aa  157  4e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.105928  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2082  DNA polymerase IF1 subunit beta  26.87 
 
 		 382 aa  154  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0161872  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0001  DNA polymerase III subunit beta  26.91 
 
 		 390 aa  153  4e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.174171  normal  0.105878 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1513  DNA polymerase III, beta subunit  25.91 
 
 		 381 aa  152  8.999999999999999e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000166783  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0535  DNA polymerase III, beta subunit  27.61 
 
 		 366 aa  151  2e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.49 
 
 		 377 aa  150  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00213885  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0340  DNA polymerase III subunit beta  28.07 
 
 		 394 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.49 
 
 		 377 aa  150  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0177596  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.53 
 
 		 387 aa  149  6e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1203  DNA polymerase III, beta subunit  28.16 
 
 		 367 aa  149  9e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0971789  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0001  DNA polymerase III subunit beta  29.72 
 
 		 385 aa  149  9e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00001  DNA polymerase III subunit beta  29.67 
 
 		 385 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.280893  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.61 
 
 		 370 aa  148  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000729086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.4 
 
 		 374 aa  148  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000025514 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.4 
 
 		 374 aa  148  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00001  DNA polymerase III subunit beta  29.16 
 
 		 385 aa  147  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2552  DNA polymerase III subunit beta  27.6 
 
 		 377 aa  145  8.000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0587336  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.94 
 
 		 376 aa  145  8.000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.35 
 
 		 372 aa  145  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000259068  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.56 
 
 		 374 aa  145  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.017071  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.03 
 
 		 367 aa  144  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.226085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0002  DNA polymerase sliding clamp subunit  28.95 
 
 		 376 aa  144  3e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000188302  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00001  DNA polymerase III subunit beta  27.62 
 
 		 388 aa  143  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00020  DNA polymerase III, beta subunit  23.42 
 
 		 374 aa  143  6e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.218776  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.11 
 
 		 378 aa  143  6e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00001  DNA polymerase III subunit beta  27.62 
 
 		 386 aa  142  8e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.31 
 
 		 374 aa  142  9.999999999999999e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000374529  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.75 
 
 		 373 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00126039  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.3 
 
 		 372 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0618208  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.46 
 
 		 367 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000146926  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0002  DNA polymerase III subunit beta  26.25 
 
 		 378 aa  140  3e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0002  DNA polymerase III, beta subunit  22.62 
 
 		 386 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0815  DNA polymerase III, beta subunit  29.41 
 
 		 375 aa  140  4.999999999999999e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  unclonable  0.000000015774  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0002  DNA-directed DNA polymerase  27.35 
 
 		 367 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.32 
 
 		 372 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000138199  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25 
 
 		 369 aa  140  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0662  DNA polymerase III, beta subunit  26.2 
 
 		 366 aa  139  7e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000326321  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0686  DNA polymerase III, beta subunit  26.2 
 
 		 366 aa  138  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0347365  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00020  DNA polymerase III, beta subunit  26.4 
 
 		 365 aa  139  1e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000592113  decreased coverage  0.0000599685 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.44 
 
 		 373 aa  138  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.394263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.77 
 
 		 378 aa  138  1e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0002  DNA polymerase III subunit beta  21.63 
 
 		 398 aa  138  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298765  normal  0.252015 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0826  DNA polymerase III subunit beta  21.28 
 
 		 398 aa  138  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1328  DNA polymerase III subunit beta  27.11 
 
 		 386 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.97 
 
 		 376 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.77 
 
 		 372 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9328  DNA-directed DNA polymerase  24.66 
 
 		 365 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0993  DNA polymerase III, beta subunit  25.07 
 
 		 376 aa  136  5e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.7 
 
 		 375 aa  136  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.39 
 
 		 375 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00020  DNA polymerase III, beta subunit  24.8 
 
 		 374 aa  135  8e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.39 
 
 		 375 aa  135  9e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.86 
 
 		 397 aa  135  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00789927  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00001  DNA polymerase III subunit beta  27.91 
 
 		 385 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.354313  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0001  DNA polymerase III subunit beta  25.32 
 
 		 385 aa  135  9.999999999999999e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.392011  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0002  DNA polymerase III subunit beta  25.86 
 
 		 397 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41342  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0001  DNA polymerase III, beta subunit  25.72 
 
 		 372 aa  134  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0872728  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4406  DNA polymerase III, beta subunit  24.47 
 
 		 377 aa  134  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.150139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0001  DNA polymerase III subunit beta  25.52 
 
 		 385 aa  134  3e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0002  DNA polymerase III subunit beta  22.31 
 
 		 378 aa  134  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.065739  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3032  DNA polymerase III, beta subunit  24.27 
 
 		 366 aa  133  5e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.27 
 
 		 367 aa  133  5e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.870835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.77 
 
 		 372 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.67 
 
 		 366 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000634429  hitchhiker  0.000143129 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.67 
 
 		 366 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103765  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.67 
 
 		 366 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000637071  unclonable  0.00000000000326658 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0004  DNA polymerase III subunit beta  26.32 
 
 		 385 aa  132  7.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.638398  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.67 
 
 		 366 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000848773  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1067  DNA polymerase III, beta subunit  29.06 
 
 		 365 aa  132  1.0000000000000001e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0458358  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0003  DNA polymerase III, beta subunit  21.83 
 
 		 396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.4 
 
 		 366 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000490932  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0003  DNA polymerase III subunit beta  26.89 
 
 		 372 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295963  hitchhiker  0.00000350231 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>