More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0001 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  100 
 
 
459 aa  934  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0161542  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.3 
 
 
463 aa  352  9e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.89 
 
 
453 aa  352  1e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  2.08022e-10  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  44.49 
 
 
450 aa  351  1e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  44.3 
 
 
450 aa  351  2e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  4.47845e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  46.35 
 
 
446 aa  350  4e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  3.25337e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  49.49 
 
 
451 aa  347  3e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  46.35 
 
 
446 aa  346  6e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  4.59109e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  46.35 
 
 
446 aa  346  6e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  2.44098e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  46.35 
 
 
446 aa  346  6e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  4.25777e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  46.35 
 
 
446 aa  346  6e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.63866e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  46.35 
 
 
446 aa  346  6e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  46.35 
 
 
446 aa  345  1e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  46.35 
 
 
446 aa  345  1e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  1.84902e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.07 
 
 
444 aa  343  4e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  52.75 
 
 
453 aa  343  5e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  7.95473e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  52.75 
 
 
453 aa  343  5e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  45.77 
 
 
446 aa  340  2e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  45.68 
 
 
446 aa  340  4e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  44.94 
 
 
457 aa  339  5e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  5.97417e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.79 
 
 
446 aa  339  6e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  2.08181e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  44.94 
 
 
457 aa  339  7e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  44.77 
 
 
446 aa  336  6e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  48.75 
 
 
454 aa  335  9e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  43.21 
 
 
442 aa  333  3e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  1.01386e-05 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  41.99 
 
 
443 aa  333  3e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.48 
 
 
447 aa  330  4e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  43.52 
 
 
441 aa  326  6e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0001  chromosomal replication initiation protein  49.85 
 
 
472 aa  324  2e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  3.68077e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  42.31 
 
 
445 aa  323  3e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.25 
 
 
453 aa  322  7e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.79 
 
 
454 aa  322  8e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  3.31762e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0001  chromosomal replication initiation protein  47.16 
 
 
478 aa  322  1e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  3.39822e-05  hitchhiker  3.14878e-05 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  44.24 
 
 
443 aa  320  4e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.54 
 
 
461 aa  319  7e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  7.04659e-08  normal  0.0525005 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.9 
 
 
439 aa  317  3e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00780596  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  48.55 
 
 
436 aa  317  3e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  41.19 
 
 
440 aa  315  8e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  1.18947e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  41.27 
 
 
450 aa  315  1e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0001  chromosomal replication initiation protein  45.73 
 
 
524 aa  315  2e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0237228  normal  0.131634 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  41.59 
 
 
449 aa  315  2e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  40.6 
 
 
458 aa  312  7e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  3.04436e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3033  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.08 
 
 
442 aa  312  7e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.949168  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.49 
 
 
443 aa  311  1e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.05 
 
 
449 aa  310  4e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.41272e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.11 
 
 
439 aa  309  7e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  1.09214e-07  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  40.21 
 
 
460 aa  308  1e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0001  chromosomal replication initiation protein  38.39 
 
 
492 aa  308  1e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.943807  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.82 
 
 
456 aa  307  2e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0001  chromosomal replication initiation protein  42.01 
 
 
440 aa  308  2e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.203604  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  39.5 
 
 
445 aa  306  3e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.36 
 
 
480 aa  305  1e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0206444  normal  0.0774659 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.48 
 
 
474 aa  304  2e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00208216  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0001  chromosomal replication initiation protein  47.43 
 
 
481 aa  303  3e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  5.6365e-07  unclonable  1.12062e-05 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  48.57 
 
 
469 aa  303  3e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000259143  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0136  chromosomal replication initiation protein  45.93 
 
 
452 aa  303  4e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  5.82235e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0001  chromosomal replication initiation protein  37.52 
 
 
495 aa  303  4e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  39.78 
 
 
452 aa  303  5e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0009  chromosomal replication initiation protein  43.29 
 
 
468 aa  301  1e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00184157  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.36 
 
 
469 aa  301  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280164  normal  0.937405 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0009  chromosomal replication initiation protein  39.74 
 
 
460 aa  301  2e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  2.81375e-07  unclonable  6.00935e-11 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0032  chromosomal replication initiation protein  39.43 
 
 
463 aa  301  2e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  2.17775e-05  normal  0.251102 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03483  chromosomal replication initiation protein  44.15 
 
 
442 aa  301  2e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.62 
 
 
467 aa  301  2e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4153  chromosomal replication initiation protein  40.4 
 
 
462 aa  300  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.6269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4177  chromosomal replication initiation protein  40.4 
 
 
462 aa  300  3e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  5.10804e-08  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.69 
 
 
461 aa  300  3e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.926832  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0001  chromosomal replication initiation protein  46.83 
 
 
480 aa  300  3e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000170377  unclonable  6.50471e-10 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0001  chromosomal replication initiation protein  45.56 
 
 
470 aa  300  4e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000177247  normal  0.980205 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0001  chromosomal replication initiation protein  40.4 
 
 
450 aa  300  4e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  6.34969e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002009  chromosomal replication initiator protein dnaA  43.92 
 
 
468 aa  300  5e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  5.52796e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0001  chromosomal replication initiation protein  38.6 
 
 
465 aa  300  5e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00156244  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00442  chromosomal replication initiation protein  43.92 
 
 
468 aa  300  5e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0001  chromosomal replication initiation protein  39.51 
 
 
460 aa  299  6e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  7.24276e-06  unclonable  1.76e-05 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0001  chromosomal replication initiation protein  39.51 
 
 
460 aa  299  6e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  1.79736e-07  unclonable  3.13535e-11 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2507  chromosomal replication initiation protein  44.77 
 
 
472 aa  299  8e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.51721e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0001  chromosomal replication initiation protein  46.87 
 
 
512 aa  299  8e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0001  chromosomal replication initiation protein  46.87 
 
 
455 aa  298  1e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.632445  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00002  Chromosomal replication initiator protein dnaA  44.35 
 
 
533 aa  298  1e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  9.17685e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00010  chromosomal replication initiation protein  46.87 
 
 
514 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.373198  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0001  chromosomal replication initiation protein  39.34 
 
 
461 aa  298  2e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  5.1e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0001  chromosomal replication initiation protein  46.57 
 
 
507 aa  297  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00366311  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.92 
 
 
464 aa  298  2e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0001  chromosomal replication initiation protein  47.16 
 
 
494 aa  297  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.77 
 
 
462 aa  298  2e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138659  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4223  chromosomal replication initiation protein  44.77 
 
 
467 aa  297  3e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  6.6194e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4123  chromosomal replication initiation protein  44.77 
 
 
466 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00889574  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4172  chromosomal replication initiation protein  44.77 
 
 
466 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.049293  normal  0.324603 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4212  chromosomal replication initiation protein  44.77 
 
 
467 aa  297  3e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  2.01887e-08  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03585  chromosomal replication initiation protein  44.77 
 
 
467 aa  297  3e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0183504  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4066  chromosomal replication initiation protein  44.77 
 
 
466 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  8.44177e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4230  chromosomal replication initiation protein  44.77 
 
 
466 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00725647  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4050  chromosomal replication initiation protein  44.77 
 
 
466 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0553543  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5130  chromosomal replication initiation protein  44.77 
 
 
467 aa  297  3e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  5.58594e-06  normal  0.0494414 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.77 
 
 
467 aa  297  3e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  1.36922e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03529  hypothetical protein  44.77 
 
 
467 aa  297  3e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00951486  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0001  chromosomal replication initiation protein  44.77 
 
 
467 aa  297  3e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000185056  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3915  chromosomal replication initiation protein  44.77 
 
 
467 aa  297  3e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.26813e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4067  chromosomal replication initiation protein  44.77 
 
 
467 aa  297  3e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  1.02031e-05  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.57 
 
 
511 aa  297  3e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>