More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1348 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_1348  histidine kinase  100 
 
 
501 aa  1018  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.515384 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11680  signal transduction histidine kinase  43.78 
 
 
496 aa  399  1e-110  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.889149  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  44.66 
 
 
518 aa  379  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00340  signal transduction histidine kinase  40.04 
 
 
500 aa  338  1e-91  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00418447  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1713  histidine kinase  31.36 
 
 
464 aa  214  3e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.529234  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  36.01 
 
 
463 aa  206  6e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  30.54 
 
 
473 aa  206  1e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1846  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 
463 aa  202  1e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  8.87504e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  36.82 
 
 
470 aa  196  7e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0938  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
473 aa  195  2e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.06 
 
 
438 aa  195  2e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.63 
 
 
723 aa  194  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2122  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 
464 aa  193  8e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 
451 aa  192  9e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00188627  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  33.66 
 
 
310 aa  192  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8765  Histidine kinase  37.59 
 
 
593 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 
487 aa  192  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  8.76727e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  36.82 
 
 
473 aa  191  2e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.76 
 
 
483 aa  191  3e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 
451 aa  191  3e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.57 
 
 
452 aa  188  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0392  histidine kinase  34.7 
 
 
449 aa  185  1e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
358 aa  185  2e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  35.22 
 
 
423 aa  185  2e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  38.19 
 
 
364 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  38.19 
 
 
364 aa  184  4e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 
483 aa  183  5e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.293022  normal  0.360603 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3303  histidine kinase  33.86 
 
 
356 aa  181  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000380955 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 
471 aa  180  5e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1945  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 
371 aa  180  5e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 
471 aa  178  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 
383 aa  178  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 
463 aa  177  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000121964  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0244  histidine kinase  34.15 
 
 
391 aa  177  5e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.300489  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  31.49 
 
 
508 aa  176  8e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 
459 aa  176  9e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.08 
 
 
359 aa  176  1e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.81 
 
 
466 aa  174  4e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.1534e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0303  histidine kinase  36.75 
 
 
360 aa  174  5e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  32.67 
 
 
463 aa  173  5e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4320  histidine kinase  32.04 
 
 
518 aa  173  7e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0320579 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4210  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 
518 aa  173  7e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4804  sensor histidine kinase  33.56 
 
 
484 aa  172  9e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4418  sensor histidine kinase  33.56 
 
 
484 aa  172  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 
470 aa  172  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.45863e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4401  sensor histidine kinase  33.56 
 
 
484 aa  172  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4787  sensor histidine kinase  33.56 
 
 
484 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1674  histidine kinase  35.22 
 
 
352 aa  172  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4566  sensor histidine kinase  33.56 
 
 
484 aa  172  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.784652  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  28.72 
 
 
466 aa  172  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  28.72 
 
 
466 aa  172  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1414  sensor histidine kinase  28.72 
 
 
466 aa  171  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4921  sensor histidine kinase  33.56 
 
 
484 aa  172  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.348457  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  28.72 
 
 
466 aa  172  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  28.72 
 
 
466 aa  172  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 
364 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1308  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  31.93 
 
 
457 aa  170  4e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  28.51 
 
 
466 aa  171  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1454  sensor histidine kinase  28.72 
 
 
466 aa  171  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4782  sensor histidine kinase  33.22 
 
 
484 aa  170  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 
473 aa  170  5e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1115  sensor histidine kinase  37.28 
 
 
446 aa  170  6e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2971  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  31.53 
 
 
455 aa  169  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1216  histidine kinase  33.75 
 
 
466 aa  169  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3099  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  30.38 
 
 
461 aa  169  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  4.30471e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  30.38 
 
 
461 aa  168  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.0096e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1328  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  30.38 
 
 
461 aa  169  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1287  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 
504 aa  168  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  5.12156e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0113  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 
382 aa  168  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.741915  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4068  histidine kinase  36.63 
 
 
594 aa  168  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.379101  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2706  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.77 
 
 
453 aa  167  3e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46719  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 
425 aa  167  3e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.69 
 
 
1162 aa  167  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 
458 aa  167  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.837767  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 
470 aa  167  5e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0457  sensor histidine kinase  32.18 
 
 
484 aa  166  7e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00889324 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1182  histidine kinase  34.29 
 
 
354 aa  166  7e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360625 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1103  histidine kinase  30.28 
 
 
360 aa  166  8e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0952  histidine kinase  32.44 
 
 
482 aa  166  9e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.483334 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.08 
 
 
597 aa  166  9e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  32.06 
 
 
496 aa  166  1e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  3.09277e-05  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.81 
 
 
456 aa  165  1e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0917  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 
494 aa  165  2e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000856467  hitchhiker  9.75464e-20 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 
639 aa  165  2e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2307  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 
666 aa  164  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18370  signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 
389 aa  164  3e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 
639 aa  164  3e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.68 
 
 
639 aa  164  5e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.6 
 
 
597 aa  164  5e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
467 aa  163  7e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1202  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.47 
 
 
452 aa  162  9e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1352  sensor histidine kinase  32.92 
 
 
466 aa  162  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0106  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 
633 aa  162  1e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.99 
 
 
539 aa  162  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.259668  normal  0.0337983 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  34.62 
 
 
469 aa  162  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5346  histidine kinase  33.68 
 
 
558 aa  162  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  0.150364 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2144  sensor histidine kinase  27.92 
 
 
429 aa  162  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0968  ATPase domain-containing protein  33.33 
 
 
557 aa  162  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193416  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 
457 aa  162  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3992  sensor histidine kinase  32.6 
 
 
466 aa  161  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>