More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1332 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_1332  Glutamate--tRNA ligase  100 
 
 
311 aa  648  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  2.57577e-07  decreased coverage  0.00027046 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1586  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  54.27 
 
 
313 aa  325  8e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.384476  normal  0.0681988 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07310  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  51.33 
 
 
318 aa  313  2e-84  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13470  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  50.52 
 
 
317 aa  300  2e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.301512  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0306  Glutamate--tRNA ligase  48.32 
 
 
323 aa  276  3e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0317  Glutamate--tRNA ligase  45.91 
 
 
323 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1769  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  44.9 
 
 
331 aa  263  3e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0295  glutamate--tRNA ligase  47.65 
 
 
323 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1586  glutamyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 
369 aa  261  9e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0334  Glutamate--tRNA ligase  41.93 
 
 
373 aa  254  2e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.374336 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0319  glutamate--tRNA ligase  47.97 
 
 
337 aa  253  4e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.468556  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0867  Glutamate--tRNA ligase  43.23 
 
 
327 aa  244  1e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1396  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  45.36 
 
 
334 aa  243  3e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.535698  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0087  tRNA synthetase class I (E and Q), catalytic domain protein  42.95 
 
 
374 aa  239  6e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.62423e-07 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2004  glutamyl-tRNA synthetase  41.64 
 
 
329 aa  235  7e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.266458  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3450  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  38.82 
 
 
330 aa  229  4e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4726  Glutamate--tRNA ligase  43.06 
 
 
316 aa  226  3e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0696299  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1329  tRNA synthetase class I domain-containing protein  47.06 
 
 
314 aa  226  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2698  glutamyl- and glutaminyl- tRNA synthetase  44.83 
 
 
311 aa  226  4e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.86478e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2709  glutamyl-tRNA synthetase  42.76 
 
 
301 aa  226  5e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.63084  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3343  Glutamate--tRNA ligase  39.32 
 
 
338 aa  222  5e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2226  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  46 
 
 
311 aa  222  6e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.78146e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3764  Glutamate--tRNA ligase  44.84 
 
 
297 aa  219  7e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1188  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  43.57 
 
 
310 aa  218  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0787184 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3073  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  44.91 
 
 
310 aa  218  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0570  Glutamate--tRNA ligase  42.81 
 
 
319 aa  216  5e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1780  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  45.02 
 
 
314 aa  216  6e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.234416 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3371  glutamate--tRNA ligase  41.14 
 
 
309 aa  215  8e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3769  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  41.36 
 
 
301 aa  214  1e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0219396 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0414  Glutamate--tRNA ligase  41.1 
 
 
309 aa  213  3e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 
535 aa  213  4e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  37.16 
 
 
478 aa  211  9e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42650  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  41.69 
 
 
298 aa  211  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.404894  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  38.91 
 
 
466 aa  210  3e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  38.91 
 
 
466 aa  210  3e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  37.38 
 
 
494 aa  209  5e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2081  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  44.67 
 
 
294 aa  209  7e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178855  normal  0.145424 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0740  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  43.25 
 
 
295 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  6.57167e-09 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4692  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  44.03 
 
 
295 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  6.87127e-06 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1031  glutamate--tRNA ligase  46.69 
 
 
283 aa  207  3e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 
498 aa  206  3e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3985  glutamate--tRNA ligase  46.28 
 
 
298 aa  206  5e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1109  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  44.31 
 
 
299 aa  205  6e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4694  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  43.19 
 
 
300 aa  205  7e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  hitchhiker  0.000909372 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4558  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  43.19 
 
 
300 aa  205  9e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  5.48174e-06 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5440  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.32 
 
 
293 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0947  Glutamate--tRNA ligase  41.87 
 
 
313 aa  203  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.507725  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0834  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  43.08 
 
 
295 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00133315 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3586  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  39.42 
 
 
294 aa  203  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5575  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.6 
 
 
310 aa  203  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.861555  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0797  glutamate--tRNA ligase  42.01 
 
 
303 aa  202  4e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  3.76322e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  36.73 
 
 
477 aa  203  4e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  38.01 
 
 
466 aa  202  5e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0108  glutamyl-tRNA synthetase  38.17 
 
 
477 aa  202  6e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4805  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  43.65 
 
 
298 aa  202  6e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0167775  hitchhiker  0.00700115 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1251  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  41.39 
 
 
296 aa  202  8e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.540986  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2014  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  41.92 
 
 
311 aa  201  9e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 
492 aa  201  1e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4042  Glutamate--tRNA ligase  42.75 
 
 
285 aa  201  1e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62510  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  41.95 
 
 
293 aa  201  1e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.632499  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  37.7 
 
 
490 aa  200  2e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  34.9 
 
 
479 aa  200  2e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3294  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  41.88 
 
 
296 aa  199  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02060  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 
311 aa  200  3e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2533  glutamyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 
473 aa  199  4e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  3.8789e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1023  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  41.24 
 
 
303 aa  199  4e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.202098  hitchhiker  3.45941e-06 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1590  glutamyl-tRNA synthetase  38.06 
 
 
467 aa  198  9e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  2.81277e-07 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1233  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  44.08 
 
 
296 aa  198  9e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447568  normal  0.0288811 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2408  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  43.55 
 
 
314 aa  198  1e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5029  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  43.53 
 
 
293 aa  197  2e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  37.98 
 
 
467 aa  197  2e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  5.0225e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4941  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  43.53 
 
 
293 aa  197  2e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  37.28 
 
 
467 aa  197  2e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5322  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  44.67 
 
 
293 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  38.23 
 
 
471 aa  196  5e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0690  glutamate--tRNA ligase  38.67 
 
 
300 aa  196  5e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.858834 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1916  glutamyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 
475 aa  196  6e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0962  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  43.78 
 
 
298 aa  195  7e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.294785  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2234  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  43.78 
 
 
294 aa  195  8e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  36.77 
 
 
467 aa  195  9e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1703  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  44.8 
 
 
298 aa  195  9e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0935  glutamyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 
468 aa  195  9e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.355577  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2315  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  44.8 
 
 
298 aa  195  9e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  32.04 
 
 
485 aa  195  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.94011e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1667  glutamyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 
465 aa  195  1e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.194864  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0456  glutamyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 
466 aa  194  1e-48  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  37.12 
 
 
463 aa  194  1e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2714  glutamyl-tRNA synthetase  36.73 
 
 
469 aa  194  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  1.69422e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0531  glutamyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 
465 aa  194  1e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0244203  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1365  glutamyl-tRNA synthetase  36.39 
 
 
469 aa  194  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  1.24879e-07  normal  0.0325353 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0188  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  36.21 
 
 
881 aa  194  1e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  36.64 
 
 
465 aa  195  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  36.21 
 
 
464 aa  194  2e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0510  glutamyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 
466 aa  194  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0967  glutamyl-tRNA synthetase-related protein  40.87 
 
 
295 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1418  glutamyl-tRNA synthetase  36.39 
 
 
469 aa  194  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  1.45575e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  37.88 
 
 
472 aa  194  2e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0605  glutamate--tRNA ligase  43.2 
 
 
316 aa  194  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1430  glutamyl-tRNA synthetase  36.39 
 
 
469 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  6.1517e-06  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3027  glutamate--tRNA ligase  41.24 
 
 
278 aa  194  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal  0.390374 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>