More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1323 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1323  two component transcriptional regulator, LytTR family  100 
 
 		 237 aa  477  1e-134  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0540721  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0137  two component transcriptional regulator, LytTR family  58.65 
 
 		 237 aa  284  1.0000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01160  response regulator of the LytR/AlgR family  56.54 
 
 		 238 aa  277  1e-73  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00400  response regulator of the LytR/AlgR family  54.43 
 
 		 237 aa  272  4.0000000000000004e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.132657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2172  LytR/AlgR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 252 aa  189  5e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721488  normal  0.0255714 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0119  response regulator receiver protein  43.51 
 
 		 249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1761  two component transcriptional regulator, LytTR family  40.4 
 
 		 251 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3773  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.98 
 
 		 260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.10961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5142  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.9 
 
 		 244 aa  168  7e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0469  response regulator receiver protein  34.52 
 
 		 254 aa  161  8.000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2697  LytR/AlgR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 240 aa  160  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5008  LytTR family two component transcriptional regulator  37.92 
 
 		 250 aa  159  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.135227  hitchhiker  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4494  LytTr DNA-binding region  38.75 
 
 		 250 aa  159  5e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0706486  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4129  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.55 
 
 		 271 aa  154  8e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0898  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.51 
 
 		 265 aa  154  9e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1375  response regulator receiver protein  36.64 
 
 		 239 aa  154  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4408  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.21 
 
 		 268 aa  153  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2356  response regulator receiver protein  37.11 
 
 		 257 aa  154  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.325932  normal  0.149931 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1393  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.5 
 
 		 238 aa  153  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000160197 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0068  two component transcriptional regulator, LytTR family  38.6 
 
 		 244 aa  152  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00288448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2791  LytTR family two component transcriptional regulator  36.59 
 
 		 250 aa  152  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.073585  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0699  response regulator receiver  37.96 
 
 		 275 aa  150  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0357  response regulator receiver  38.24 
 
 		 249 aa  150  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5573  response regulator LytR  35.1 
 
 		 246 aa  149  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0374  two component transcriptional regulator, LytTR family  39.84 
 
 		 242 aa  149  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5621  response regulator LytR  35.1 
 
 		 246 aa  149  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5565  response regulator LytR  36.33 
 
 		 246 aa  148  9e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10420  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.85 
 
 		 253 aa  148  9e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460621  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5295  response regulator LytR  34.69 
 
 		 246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5122  response regulator  34.69 
 
 		 246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5536  response regulator LytR  34.69 
 
 		 246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5384  response regulator LytR  34.69 
 
 		 246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.662493  normal  0.485514 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5691  response regulator LytR  34.69 
 
 		 246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5137  response regulator  34.69 
 
 		 246 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2133  LytTR family two component transcriptional regulator  37.82 
 
 		 248 aa  146  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2957  response regulator receiver protein  36.71 
 
 		 236 aa  146  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00954821  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3544  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.8 
 
 		 251 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0394969  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5234  LytTR family two component transcriptional regulator  34.29 
 
 		 246 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1330  LytTR family two component transcriptional regulator  37.23 
 
 		 261 aa  144  8.000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.80792  hitchhiker  0.00674538 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0246  two-component response regulator  34.91 
 
 		 246 aa  144  9e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0252  two-component response regulator  34.91 
 
 		 246 aa  144  9e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3958  LytTR family two component transcriptional regulator  34.29 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3733  response regulator receiver domain-containing protein  36.22 
 
 		 249 aa  144  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.766169 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2858  response regulator receiver  36.73 
 
 		 264 aa  142  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2673  response regulator receiver protein  34.6 
 
 		 268 aa  143  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.587227  normal  0.606797 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2906  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.55 
 
 		 245 aa  142  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0055  LytTR family two component transcriptional regulator  32.52 
 
 		 243 aa  142  5e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0059  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.47 
 
 		 243 aa  142  5e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.182784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0060  LytTR family two component transcriptional regulator  33.06 
 
 		 243 aa  141  7e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0478076  hitchhiker  0.000497336 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00870  response regulator of the LytR/AlgR family  34.38 
 
 		 272 aa  141  7e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4299  LytTR family two component transcriptional regulator  33.06 
 
 		 243 aa  141  7e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000001386  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1440  putative two-component response-regulatory protein YehT  36.93 
 
 		 236 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0057  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000048418  decreased coverage  0.0000000648872 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2762  response regulator receiver protein  35.93 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.330347  normal  0.784413 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0055  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000989316  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5278  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.29 
 
 		 281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0224  putative two-component response-regulatory protein YehT  34.02 
 
 		 237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01918  putative response regulator in two-component regulatory system  34.48 
 
 		 275 aa  139  3.9999999999999997e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0904  LytTR family two component transcriptional regulator  33.88 
 
 		 243 aa  139  4.999999999999999e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02291  predicted response regulator in two-component system withYpdA  32.39 
 
 		 244 aa  138  6e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1276  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.39 
 
 		 244 aa  138  6e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.435037  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2671  response regulator  32.39 
 
 		 244 aa  138  6e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2750  response regulator  32.39 
 
 		 244 aa  138  6e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1288  LytTR family two component transcriptional regulator  32.39 
 
 		 244 aa  138  6e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.524379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2518  response regulator  32.39 
 
 		 244 aa  138  6e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3613  response regulator  32.39 
 
 		 244 aa  138  6e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.560415 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2533  response regulator  31.98 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0161  LytR/AlgR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 270 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0227  LytR/AlgR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 265 aa  137  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312706  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6324  response regulator receiver protein  36.48 
 
 		 253 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.48372 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0885  response regulator  36.29 
 
 		 247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0355946  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1964  LytR/AlgR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 255 aa  135  5e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.777054 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1860  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.91 
 
 		 266 aa  135  5e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1016  response regulator  34.84 
 
 		 244 aa  135  6.0000000000000005e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4560  response regulator receiver protein  34.44 
 
 		 269 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850639 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0067  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.8 
 
 		 275 aa  134  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3487  LytR/AlgR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 253 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0715  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.74 
 
 		 245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00500528  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1542  LytTr DNA-binding region  32.53 
 
 		 245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300206 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3167  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.37 
 
 		 285 aa  132  6e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616861  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2397  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.16 
 
 		 261 aa  131  7.999999999999999e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4280  response regulator receiver protein  34.98 
 
 		 269 aa  131  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4051  response regulator receiver protein  34.16 
 
 		 269 aa  131  9e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.243327  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4126  response regulator receiver protein  34.16 
 
 		 269 aa  131  9e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.217512  normal  0.408771 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1083  putative two-component response-regulatory protein YehT  34.29 
 
 		 239 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.450563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4801  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.8 
 
 		 240 aa  130  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.154299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0231  LytR/AlgR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.740894 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3172  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.86 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00901875  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2920  LytTR family two component transcriptional regulator  31.45 
 
 		 245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.106094 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3358  putative two-component response-regulatory protein YehT  32.65 
 
 		 238 aa  129  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3485  putative two-component response-regulatory protein YehT  32.65 
 
 		 238 aa  129  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.159726 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3314  LytR/AlgR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 250 aa  129  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.742064  normal  0.13531 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3221  putative two-component response-regulatory protein YehT  32.65 
 
 		 238 aa  129  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6586  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.87 
 
 		 246 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.318104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0031  response regulator receiver protein  32.64 
 
 		 243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0826  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.67 
 
 		 235 aa  129  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.398179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1679  LytTR family two component transcriptional regulator  35.05 
 
 		 238 aa  129  6e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2357  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.2 
 
 		 244 aa  128  7.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2143  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 265 aa  128  7.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.390763  normal  0.164671 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2443  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.45 
 
 		 245 aa  128  9.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.191147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>