86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1316 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1316  PTS system sorbose subfamily IIB component  100 
 
 		 164 aa  338  2.9999999999999998e-92  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.482248  normal  0.251904 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1272  phosphotransferase system, mannose/fructose/N-acetylgalactosamine-specific component IIB  69.94 
 
 		 164 aa  237  5e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00454576  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3428  PTS system sorbose subfamily IIB component  68.71 
 
 		 164 aa  236  1e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000324846  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3254  PTS system sorbose subfamily IIB component  46.01 
 
 		 167 aa  153  8e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4280  PTS system sorbose subfamily IIB component  39.26 
 
 		 164 aa  128  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3008  PTS system sorbose subfamily IIB component  43.83 
 
 		 161 aa  116  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.143042  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0348  PTS system, IIB component  31.58 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.270874  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1486  PTS system mannose-specific transporter subunit IIAB  27.81 
 
 		 322 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1969  PTS system mannose-specific transporter subunit IIAB  27.81 
 
 		 322 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000485794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2030  PTS system mannose-specific IIAB component  27.81 
 
 		 322 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0638718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1973  PTS system, mannose-specific IIAB component  27.81 
 
 		 322 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00730165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1302  PTS system, mannose-specific IIAB component  27.81 
 
 		 322 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000497751  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01775  hypothetical protein  27.81 
 
 		 323 aa  61.6  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0856085  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2083  PTS system, mannose-specific IIAB component  27.81 
 
 		 323 aa  61.6  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000444348  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1371  PTS system, mannose-specific IIAB component  27.81 
 
 		 323 aa  61.6  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000647863  normal  0.0229749 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2546  PTS system, mannose-specific IIAB component  27.81 
 
 		 323 aa  61.6  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000579402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2045  PTS system, mannose-specific IIAB component  27.81 
 
 		 323 aa  61.6  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000183907  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1907  PTS system, mannose-specific IIAB component  27.81 
 
 		 323 aa  61.6  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000431359  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01787  fused mannose-specific PTS enzymes: IIA component/IIB component  27.81 
 
 		 323 aa  61.6  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0965607  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1826  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIA subunit  27.81 
 
 		 323 aa  61.6  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000156617  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1097  PTS system sorbose subfamily IIB component  29.86 
 
 		 167 aa  61.2  0.000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00631969  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3951  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  29.3 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2386  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIA subunit  28 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2097  PTS system sorbose subfamily IIB component  30.5 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1983  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  32.19 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1926  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  30.2 
 
 		 322 aa  60.5  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.684419  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2219  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  30.46 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.854974  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3025  PTS system sorbose subfamily IIB component  33.71 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2968  PTS system, IIB component  29.45 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2021  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  30 
 
 		 313 aa  58.9  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.511847  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2813  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  27.63 
 
 		 323 aa  58.5  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.047129 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1651  PTS system mannose/fructose/sorbose family transporter subunit IIB  30.14 
 
 		 324 aa  58.5  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.133869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2464  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  30.14 
 
 		 324 aa  58.5  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.134183  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2368  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  30.14 
 
 		 324 aa  58.5  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.15235  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1675  protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  26.45 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3206  PTS system sorbose subfamily IIB component  30.46 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1716  PTS system, IIB component  35.79 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0609  protein-N(pi)-phosphohistidine-sugar phosphotransferase (phosphotransferase system mannose/fructose-specific IIA component)  29.7 
 
 		 323 aa  53.9  0.0000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000226836  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1950  PTS system, IIB component  27.01 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0451  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIAB subunit  31.43 
 
 		 322 aa  51.2  0.000006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.178007  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4891  PTS system transporter subunit IIB  22.45 
 
 		 153 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4944  PTS system IIB component  22.45 
 
 		 153 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4950  PTS system transporter subunit IIB  22.45 
 
 		 153 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.315233  normal  0.320869 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4790  PTS system, IIB component  22.45 
 
 		 153 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.674783 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4479  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  25.73 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.705114 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0135  PTS system sorbose subfamily IIB component  38 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1993  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  26.62 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.396142  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0818  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  28.57 
 
 		 326 aa  48.9  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3475  PTS system sorbose subfamily IIB component  22.22 
 
 		 156 aa  48.5  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.255875  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0951  PTS system sorbose subfamily IIB component  38 
 
 		 161 aa  48.5  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0985047  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0804  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIAB subunit  28.57 
 
 		 326 aa  48.5  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0200  protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  25.53 
 
 		 329 aa  47.8  0.00007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000259121  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4447  PTS system N-acetylgalactosamine-specific transporter subunit IIB  26.81 
 
 		 157 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.887549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02949  hypothetical protein  26.81 
 
 		 157 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02998  N-acetylgalactosamine-specific enzyme IIB component of PTS  26.81 
 
 		 157 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0572  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  26.81 
 
 		 157 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3323  PTS system N-acetylgalactosamine-specific transporter subunit IIB  26.81 
 
 		 157 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3430  PTS system N-acetylgalactosamine-specific transporter subunit IIB  26.81 
 
 		 157 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0567  PTS system N-acetylgalactosamine-specific transporter subunit IIB  26.81 
 
 		 157 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3613  PTS system N-acetylgalactosamine-specific transporter subunit IIB  26.81 
 
 		 157 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.903374  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3978  PTS system sorbose subfamily IIB component  40 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1066  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  26.35 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4164  PTS system sorbose subfamily transporter subunit IIB  40 
 
 		 161 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.328304 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3863  PTS system sorbose subfamily IIB component  38 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3276  PTS system sorbose subfamily IIB component  40 
 
 		 161 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3996  PTS system sorbose subfamily IIB component  40 
 
 		 161 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4050  PTS system sorbose subfamily transporter subunit IIB  40 
 
 		 161 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0918048 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4101  PTS system sorbose subfamily IIB component  40 
 
 		 161 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0629  PTS system sorbose-specific transporter subunit IIB  26.09 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0688  PTS system sorbose subfamily IIB component  26.09 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.122681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0464  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  25.36 
 
 		 332 aa  45.8  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000027828  normal  0.826743 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1768  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  39.22 
 
 		 314 aa  45.1  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000481917  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3399  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  30.21 
 
 		 155 aa  44.7  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00196922  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1863  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  25.9 
 
 		 329 aa  43.9  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00596376  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3573  PTS system N-acetylgalactosamine-specific transporter subunit IIB  23.91 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.562122 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0372  mannose PTS system component IIAB  39.22 
 
 		 330 aa  42.7  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000136714  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0401  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  23.61 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0464  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  26.47 
 
 		 331 aa  42.7  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000451703  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0397  PTS system, IIB component  23.61 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3847  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  21.71 
 
 		 158 aa  41.6  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.9499 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3699  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  25.16 
 
 		 159 aa  41.6  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000890287  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0117  phosphotransferase system, mannose/fructose/N-acetylgalactosamine-specific component IIB  36.96 
 
 		 162 aa  41.6  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000562176  unclonable  1.30149e-28 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0153  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  22.79 
 
 		 157 aa  41.6  0.005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1795  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  37.5 
 
 		 332 aa  41.2  0.006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.172068  hitchhiker  1.3720900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1596  PTS system sorbose subfamily IIB component  21.23 
 
 		 160 aa  40.8  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1500  PTS system sorbose subfamily IIB component  22.3 
 
 		 153 aa  40.4  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.219995  hitchhiker  0.00883957 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>