More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1310 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1310  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 355 aa  732    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.123154 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1891  peptide chain release factor 1  67.89 
 
 		 352 aa  495  1e-139  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.871693  hitchhiker  0.000000000024235 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14260  peptide chain release factor 1  67.89 
 
 		 352 aa  487  1e-136  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.210236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08900  peptide chain release factor 1  65.55 
 
 		 357 aa  480  1e-134  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000087001  normal  0.899711 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  52.71 
 
 		 356 aa  382  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  53.11 
 
 		 360 aa  376  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  51.85 
 
 		 359 aa  372  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  51.56 
 
 		 358 aa  370  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  52.72 
 
 		 357 aa  369  1e-101  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0599  peptide chain release factor 1  54.37 
 
 		 360 aa  368  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  51.98 
 
 		 357 aa  369  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  49.72 
 
 		 356 aa  366  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3706  peptide chain release factor 1  49.44 
 
 		 359 aa  367  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0488544 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0702  peptide chain release factor 1  49.72 
 
 		 355 aa  365  1e-100  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.759041 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  52.96 
 
 		 356 aa  363  2e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  51.7 
 
 		 355 aa  362  5.0000000000000005e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4104  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 		 357 aa  361  1e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2192  peptide chain release factor 1  50.42 
 
 		 358 aa  360  2e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.267751  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2154  peptide chain release factor 1  50.42 
 
 		 358 aa  360  2e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.659693  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1248  peptide chain release factor 1  47.88 
 
 		 362 aa  355  6.999999999999999e-97  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2309  peptide chain release factor 1  47.74 
 
 		 358 aa  354  1e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.321803  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2489  peptide chain release factor 1  48.59 
 
 		 361 aa  353  2e-96  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  50.71 
 
 		 356 aa  353  2e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  48.71 
 
 		 360 aa  354  2e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  48.71 
 
 		 360 aa  354  2e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0094  peptide chain release factor 1  54.13 
 
 		 356 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.494548  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  52.54 
 
 		 355 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  49.58 
 
 		 355 aa  352  5.9999999999999994e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0083  peptide chain release factor 1  48.3 
 
 		 357 aa  351  1e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4995  peptide chain release factor 1  47.67 
 
 		 357 aa  350  1e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.706833  normal  0.116267 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  48.31 
 
 		 355 aa  351  1e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 		 359 aa  350  2e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0144  peptide chain release factor 1  50.43 
 
 		 363 aa  347  1e-94  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.372762  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  47.18 
 
 		 355 aa  347  2e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  47.18 
 
 		 355 aa  347  2e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13608  peptide chain release factor 1  47.19 
 
 		 358 aa  346  3e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  50.42 
 
 		 355 aa  346  3e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3322  peptide chain release factor 1  49.15 
 
 		 358 aa  347  3e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000442042  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  47.44 
 
 		 358 aa  346  3e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  47.16 
 
 		 358 aa  346  4e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  47.16 
 
 		 358 aa  346  4e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  47.16 
 
 		 358 aa  346  4e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  47.16 
 
 		 358 aa  346  4e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  47.16 
 
 		 358 aa  346  4e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 		 355 aa  345  5e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1652  peptide chain release factor 1  51.71 
 
 		 364 aa  345  7e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.534857  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  47.73 
 
 		 362 aa  345  7e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  47.18 
 
 		 355 aa  345  8.999999999999999e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0394  peptide chain release factor 1  49.72 
 
 		 370 aa  344  1e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.462298  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  48.86 
 
 		 355 aa  344  1e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0396  peptide chain release factor 1  49.72 
 
 		 370 aa  344  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3178  peptide chain release factor 1  51.41 
 
 		 361 aa  343  2e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000107568  normal  0.412764 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  51.65 
 
 		 359 aa  343  2e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0366  peptide chain release factor 1  49.72 
 
 		 370 aa  343  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.200814  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  46.88 
 
 		 358 aa  343  4e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  49.43 
 
 		 363 aa  342  4e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl634  peptide chain release factor 1  53.77 
 
 		 363 aa  342  5e-93  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0980  peptide chain release factor 1  51.7 
 
 		 360 aa  341  1e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572262  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2045  peptide chain release factor 1  49.42 
 
 		 355 aa  341  1e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4061  peptide chain release factor 1  50.42 
 
 		 355 aa  340  2e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.677357  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  54.93 
 
 		 359 aa  339  5e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3104  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 355 aa  338  9e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17970  peptide chain release factor 1  50.56 
 
 		 358 aa  337  9.999999999999999e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000477535  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0078  peptide chain release factor 1  47.16 
 
 		 357 aa  338  9.999999999999999e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1953  peptide chain release factor 1  46.35 
 
 		 357 aa  337  1.9999999999999998e-91  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0472  peptide chain release factor 1  47.89 
 
 		 356 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257905  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2796  peptide chain release factor 1  48.72 
 
 		 365 aa  335  5e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000135616  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2647  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 		 354 aa  335  5e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00109947  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0075  peptide chain release factor 1  46.48 
 
 		 358 aa  334  1e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0010  peptide chain release factor 1  46.02 
 
 		 357 aa  334  1e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116962  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  48.72 
 
 		 367 aa  334  1e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0074  peptide chain release factor 1  47.19 
 
 		 361 aa  334  2e-90  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2203  peptide chain release factor 1  45.45 
 
 		 368 aa  333  2e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.930883 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0063  peptide chain release factor 1  51.56 
 
 		 355 aa  334  2e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.00000000318273  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0414  peptide chain release factor 1  46.31 
 
 		 358 aa  333  4e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000401474  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0440  peptide chain release factor 1  45.3 
 
 		 354 aa  332  5e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4213  peptide chain release factor 1  47.74 
 
 		 372 aa  332  5e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.42192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0740  peptide chain release factor 1  47.31 
 
 		 355 aa  332  6e-90  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.759458  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0994  peptide chain release factor 1  46.33 
 
 		 363 aa  332  7.000000000000001e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1618  peptide chain release factor 1  46.76 
 
 		 355 aa  331  1e-89  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0753  peptide chain release factor 1  46.18 
 
 		 358 aa  330  2e-89  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000176457  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0610  peptide chain release factor 1  46.59 
 
 		 357 aa  330  2e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0746132  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  47.74 
 
 		 361 aa  330  2e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  46.44 
 
 		 355 aa  329  4e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  52.81 
 
 		 361 aa  329  5.0000000000000004e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01250  peptide chain release factor 1  48.43 
 
 		 362 aa  328  6e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1805  peptide chain release factor 1  46.74 
 
 		 355 aa  328  8e-89  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0117611  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2449  peptide chain release factor 1  51.84 
 
 		 359 aa  328  9e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3685  peptide chain release factor 1  46.86 
 
 		 361 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0369473  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0064  peptide chain release factor 1  47.01 
 
 		 355 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000729315  hitchhiker  0.00306425 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3955  peptide chain release factor 1  50.42 
 
 		 359 aa  326  3e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1457  peptide chain release factor 1  46.2 
 
 		 364 aa  327  3e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0262209  normal  0.168501 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  48.73 
 
 		 360 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  48.31 
 
 		 357 aa  325  5e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004203  peptide chain release factor 1  48.15 
 
 		 362 aa  325  6e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0254288  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2563  peptide chain release factor 1  47.01 
 
 		 362 aa  325  6e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.273749  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0721  peptide chain release factor 1  45.2 
 
 		 366 aa  325  7e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000614625  normal  0.652309 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1077  peptide chain release factor 1  45.43 
 
 		 359 aa  325  1e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.225859  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2868  peptide chain release factor 1  48.44 
 
 		 364 aa  324  1e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  46.76 
 
 		 356 aa  325  1e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>