More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1304 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_1304  ATP synthase F0, A subunit  100 
 
 
266 aa  536  1e-151  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  6.5102e-05  normal  0.293813 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1039  ATP synthase F0, A subunit  40.6 
 
 
261 aa  207  2e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0480809 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21460  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  36.33 
 
 
267 aa  171  1e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12110  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  36.33 
 
 
263 aa  160  3e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2709  F0F1 ATP synthase subunit A  35.02 
 
 
342 aa  132  8e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.018476  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1973  ATP synthase F0, A subunit  33.85 
 
 
303 aa  121  1e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000495974  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2098  F0F1 ATP synthase subunit A  36.32 
 
 
341 aa  120  3e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0064  F0F1 ATP synthase subunit A  33.73 
 
 
345 aa  117  2e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5025  ATP synthase F0, A subunit  35.1 
 
 
364 aa  116  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436472  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2885  F0F1 ATP synthase subunit A  34.53 
 
 
340 aa  116  4e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  6.77372e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2502  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 
338 aa  114  2e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1780  ATP synthase F0, A subunit  35.94 
 
 
281 aa  112  5e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3216  ATP synthase F0, A subunit  32.1 
 
 
373 aa  112  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.100229 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1515  ATP synthase F0, A subunit  31.68 
 
 
248 aa  110  3e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  1.05454e-10 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2247  F0F1 ATP synthase subunit A  32.68 
 
 
324 aa  103  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.608191  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1644  ATP synthase F0, A subunit  32.47 
 
 
258 aa  102  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283093  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0394  F0F1 ATP synthase subunit A  33.76 
 
 
249 aa  102  7e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0382  F0F1 ATP synthase subunit A  33.76 
 
 
249 aa  102  7e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09970  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  35.85 
 
 
294 aa  100  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0311  ATP synthase F0, A subunit  31.8 
 
 
400 aa  100  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00150281  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3713  F0F1 ATP synthase subunit A  31.78 
 
 
284 aa  99  7e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3674  F0F1 ATP synthase subunit A  31.44 
 
 
268 aa  98.6  9e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787111  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1979  F0F1 ATP synthase subunit A  32.91 
 
 
250 aa  98.6  9e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0398518 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6142  ATP synthase F0, A subunit  34.73 
 
 
283 aa  98.6  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0846  F0F1 ATP synthase subunit A  35.02 
 
 
247 aa  97.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0376  F0F1 ATP synthase subunit A  31.52 
 
 
252 aa  97.8  2e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1310  ATP synthase F0 subunit A  32.2 
 
 
265 aa  96.3  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1066  ATP synthase F0, A subunit  32.57 
 
 
261 aa  96.3  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2454  ATP synthase F0, A subunit  32.68 
 
 
272 aa  95.9  6e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0500  F0F1 ATP synthase subunit A  32.37 
 
 
249 aa  95.9  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215569  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4816  F0F1 ATP synthase subunit A  34.45 
 
 
249 aa  95.1  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.635732  normal  0.84617 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0743  F0F1 ATP synthase subunit A  32.35 
 
 
253 aa  95.1  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230064  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1316  F0F1 ATP synthase subunit A  31.27 
 
 
260 aa  94  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18260  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  31.96 
 
 
261 aa  93.2  4e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.469356  normal  0.320479 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1801  ATP synthase F0, A subunit  34.39 
 
 
257 aa  92.4  6e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.339672  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1212  F0F1 ATP synthase subunit A  30.04 
 
 
283 aa  91.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2413  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  30.99 
 
 
285 aa  92  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19190  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  33.08 
 
 
247 aa  91.3  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1018  F0F1 ATP synthase subunit A  33.49 
 
 
295 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.147129  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3175  F0F1 ATP synthase subunit A  31.78 
 
 
251 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3499  F0F1 ATP synthase subunit A  31.78 
 
 
251 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0269  F0F1 ATP synthase subunit A  31.65 
 
 
247 aa  90.1  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1264  ATP synthase F0, A subunit  29.8 
 
 
262 aa  89.7  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0705285 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0392  ATP synthase F0, A subunit  30.84 
 
 
373 aa  89.4  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.726287 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0061  ATP synthase F0 subunit A  31.65 
 
 
339 aa  88.2  1e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0427  F0F1 ATP synthase subunit A  32.05 
 
 
241 aa  88.2  1e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0574735  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0330  ATP synthase F0, A subunit  32.59 
 
 
280 aa  88.6  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.169685 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0714  F0F1 ATP synthase subunit A  30.38 
 
 
251 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211309  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3370  F0F1 ATP synthase subunit A  31.36 
 
 
251 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0220561  normal  0.798518 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4624  ATP synthase F0, A subunit  27.8 
 
 
312 aa  86.7  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0830  F0F1 ATP synthase subunit A  31.84 
 
 
250 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.109906 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0872  F0F1 ATP synthase subunit A  27.07 
 
 
243 aa  86.7  4e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.397381  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0894  ATP synthase F0 subunit A  33.03 
 
 
263 aa  86.3  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0970  ATP synthase F0, A subunit  31.3 
 
 
207 aa  85.9  7e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  1.17673e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0238  F0F1 ATP synthase subunit A  31.09 
 
 
247 aa  85.5  8e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4487  F0F1 ATP synthase subunit A  32.52 
 
 
406 aa  84.7  1e-15  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.553444  normal  0.0963007 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0696  F0F1 ATP synthase subunit A  31.22 
 
 
249 aa  84.7  1e-15  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0554  F0F1 ATP synthase subunit A  30.67 
 
 
250 aa  84.7  1e-15  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0397  F0F1 ATP synthase subunit A  34.35 
 
 
251 aa  84.3  2e-15  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0015  ATP synthase F0, A subunit  35.1 
 
 
234 aa  84.3  2e-15  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.26077e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29610  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  30.6 
 
 
272 aa  84.3  2e-15  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3030  F0F1 ATP synthase subunit A  34.78 
 
 
248 aa  83.6  3e-15  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.311093 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0447  F0F1 ATP synthase subunit A  29.11 
 
 
250 aa  83.6  3e-15  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726542  normal  0.18577 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4483  F0F1 ATP synthase subunit A  32.51 
 
 
261 aa  84  3e-15  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.639337 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0170  ATP synthase F0, A subunit  33.67 
 
 
339 aa  83.6  3e-15  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.222204  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03040  putative ATP synthase A chain  31.25 
 
 
361 aa  83.2  4e-15  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7657  F0F1 ATP synthase subunit A  32.35 
 
 
251 aa  83.2  4e-15  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0416353  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3822  F0F1 ATP synthase subunit A  33.97 
 
 
250 aa  83.2  4e-15  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0719416 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3636  ATP synthase F0, A subunit  28.51 
 
 
259 aa  82.4  6e-15  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.595965  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4377  F0F1 ATP synthase subunit A  32.42 
 
 
257 aa  82.4  6e-15  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1129  F0F1 ATP synthase subunit A  27.99 
 
 
270 aa  82  8e-15  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4571  F0F1 ATP synthase subunit A  30.38 
 
 
248 aa  82  8e-15  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1076  F0F1 ATP synthase subunit A  31.97 
 
 
261 aa  82  9e-15  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0512  F0F1 ATP synthase subunit A  30.29 
 
 
250 aa  81.6  1e-14  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172215  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1718  ATP synthase F0, A subunit  33.19 
 
 
355 aa  81.3  1e-14  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0314608  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0929  F0F1 ATP synthase subunit A  30.67 
 
 
250 aa  81.6  1e-14  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6944  F0F1 ATP synthase subunit A  32.35 
 
 
251 aa  81.3  2e-14  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0362387 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4495  F0F1 ATP synthase subunit A  35.89 
 
 
384 aa  80.5  2e-14  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0190  F0F1 ATP synthase subunit A  29.58 
 
 
261 aa  80.5  2e-14  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08120  F0F1 ATP synthase subunit A  30.58 
 
 
266 aa  80.9  2e-14  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.823185  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1038  F0F1 ATP synthase subunit A  28.75 
 
 
247 aa  80.1  3e-14  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2699  F0F1 ATP synthase subunit A  28.75 
 
 
261 aa  80.1  3e-14  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.911208  normal  0.0328457 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0767  F0F1 ATP synthase subunit A  33.97 
 
 
282 aa  79.7  4e-14  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0914  F0F1 ATP synthase subunit A  30.42 
 
 
248 aa  80.1  4e-14  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.323491  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1757  ATP synthase F0, A subunit  32.23 
 
 
276 aa  80.1  4e-14  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.731668  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2514  F0F1 ATP synthase subunit A  29.92 
 
 
249 aa  79.7  5e-14  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733206  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4142  ATP synthase F0, A subunit  30 
 
 
275 aa  79.3  6e-14  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1086  F0F1 ATP synthase subunit A  27.71 
 
 
243 aa  79  7e-14  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1500  ATP synthase F0, A subunit  32.37 
 
 
229 aa  78.6  1e-13  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.872932  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3922  ATP synthase F0, A subunit  30.97 
 
 
267 aa  78.2  1e-13  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1055  ATP synthase F0, A subunit  27.66 
 
 
391 aa  78.2  1e-13  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2201  F0F1 ATP synthase subunit A  30.86 
 
 
258 aa  78.6  1e-13  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.440732 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2795  ATP synthase F0, A subunit  34.16 
 
 
234 aa  78.2  1e-13  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.073854  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1657  F0F1 ATP synthase subunit A  25.98 
 
 
251 aa  78.6  1e-13  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3246  F0F1 ATP synthase subunit A  27.44 
 
 
241 aa  77.4  2e-13  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.911216  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2594  F0F1 ATP synthase subunit A  33.48 
 
 
267 aa  77.4  2e-13  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00546841 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0599  ATP synthase F0, A subunit  31.4 
 
 
229 aa  77.4  2e-13  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3359  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  30.4 
 
 
229 aa  77  3e-13  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.61102e-06  hitchhiker  0.00336377 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0142  ATP synthase F0, A subunit  27 
 
 
284 aa  77  3e-13  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0697  F0F1 ATP synthase subunit A  29.88 
 
 
260 aa  76.6  4e-13  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>