118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1261 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1261  sortase family protein  100 
 
 		 324 aa  667    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00840  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  58.09 
 
 		 307 aa  371  1e-101  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1804  sortase family protein  40 
 
 		 266 aa  194  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5330  sortase family protein  44.2 
 
 		 272 aa  192  6e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3113  sortase family protein  40.77 
 
 		 268 aa  192  9e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0772  sortase family protein  41.26 
 
 		 279 aa  190  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00805513  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5387  sortase family protein  43.75 
 
 		 272 aa  189  5e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1858  sortase family protein  37.78 
 
 		 266 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1287  sortase  33.96 
 
 		 377 aa  181  1e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0773  sortase family protein  38.23 
 
 		 286 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00114802  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1469  sortase  39.5 
 
 		 327 aa  181  2e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05680  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  36.24 
 
 		 336 aa  181  2e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.781628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2537  sortase  40.27 
 
 		 267 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2786  sortase  40.27 
 
 		 282 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.175033  hitchhiker  0.00000000215644 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1405  sortase family protein  40.54 
 
 		 294 aa  171  2e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0647  sortase family protein  36.05 
 
 		 305 aa  169  4e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05690  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  41.56 
 
 		 270 aa  169  6e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0427  sortase family protein  41.89 
 
 		 365 aa  168  1e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000168911 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1805  sortase family protein  34.89 
 
 		 269 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1025  sortase family protein  35.27 
 
 		 337 aa  162  5.0000000000000005e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1522  sortase family protein  34.85 
 
 		 308 aa  160  4e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.301282  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1859  sortase family protein  35.07 
 
 		 265 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1214  sortase family protein  37.55 
 
 		 339 aa  159  5e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000620808 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1406  sortase family protein  36.36 
 
 		 293 aa  156  4e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1486  sortase family protein  38.14 
 
 		 316 aa  155  8e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0422  sortase family protein  35.69 
 
 		 381 aa  155  9e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.102959 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0043  sortase family protein  34.72 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0146  sortase family protein  36.71 
 
 		 273 aa  152  7e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1161  sortase family protein  34.62 
 
 		 377 aa  152  8e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000131719 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0648  sortase family protein  40.89 
 
 		 260 aa  152  1e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0148  sortase family protein  36.29 
 
 		 273 aa  152  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.886356  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24310  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  37.17 
 
 		 344 aa  151  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1533  sortase (surface protein transpeptidase)  32.51 
 
 		 395 aa  146  5e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.223047  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1485  sortase family protein  35.62 
 
 		 291 aa  145  8.000000000000001e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0124  sortase family protein  34.6 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.145453  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1532  sortase (surface protein transpeptidase)  34.68 
 
 		 384 aa  137  3.0000000000000003e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0807  sortase (surface protein transpeptidase)  45.89 
 
 		 249 aa  126  5e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.759239  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0650  sortase family protein  50 
 
 		 189 aa  122  8e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1484  sortase family protein  30 
 
 		 292 aa  104  3e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4617  LPXTG-site transpeptidase family protein  26.84 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0891302  normal  0.0210172 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2842  sortase family protein  34.78 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0719  LPXTG-site transpeptidase family protein  26.41 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0579393  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0598  sortase family protein  25.97 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000660576  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0599  sortase family protein  25.97 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0252782  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1218  sortase (surface protein transpeptidase)  28.93 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000016214  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0755  LPXTG-site transpeptidase family protein  25.97 
 
 		 210 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0817669  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0654  LPXTG-site transpeptidase family protein  25.97 
 
 		 210 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000454419  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0815  LPXTG-site transpeptidase family protein  25.97 
 
 		 210 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0400761  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0743  LPXTG-site transpeptidase family protein  25.97 
 
 		 210 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000196785 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0688  LPXTG-site transpeptidase family protein  25.63 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4302  sortase family protein  26.92 
 
 		 222 aa  68.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000168018  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3139  sortase family protein  28.08 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.211754  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0578  sortase family protein  23.48 
 
 		 210 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.276833  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0602  sortase family protein  24.58 
 
 		 210 aa  65.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3291  sortase family protein  29.93 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0961  sortase SrtA  27.19 
 
 		 247 aa  62.4  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000962691  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2383  peptidase C60, sortase A and B  30.07 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.480623  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2301  sortase family protein  26.36 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.206988  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4642  sortase family protein  32.33 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.068472  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0022  sortase family protein  26.09 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0212  sortase family protein  32.79 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2615  sortase family protein  26.24 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.209279  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2542  peptidase C60, sortase A and B  38.02 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0900562  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1357  sortase family protein  34.82 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2138  sortase family protein  35.14 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3111  sortase family protein  34.09 
 
 		 298 aa  58.9  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0211  sortase family protein  31.97 
 
 		 187 aa  58.5  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0051  sortase family protein  32.82 
 
 		 521 aa  58.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.447645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1613  sortase family protein  43.37 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0056  sortase family protein  32.06 
 
 		 556 aa  57.4  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.761592 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1255  sortase (surface protein transpeptidase)  29.91 
 
 		 253 aa  57  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.20645  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0374  sortase family protein  30.08 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4170  sortase family protein  33.58 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.578913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0016  sortase family protein  34.23 
 
 		 249 aa  54.7  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4317  fimbria associated protein  30.7 
 
 		 223 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0027  sortase family protein  28.57 
 
 		 238 aa  53.9  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.6084  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3316  peptidase C60 sortase A and B  34.75 
 
 		 251 aa  53.1  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5903  sortase family protein  29.77 
 
 		 236 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0041  sortase family protein  29.93 
 
 		 238 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0060  sortase family protein  30.63 
 
 		 192 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1385  sortase  27.04 
 
 		 412 aa  51.6  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.70961  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4953  LPXTG-site transpeptidase family protein  31.08 
 
 		 206 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4938  LPXTG-site transpeptidase family protein  30.41 
 
 		 206 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27020  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  30.25 
 
 		 243 aa  51.2  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0301  LPXTG-site transpeptidase family protein  30.41 
 
 		 206 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1902  sortase family protein  32 
 
 		 350 aa  51.2  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0102426  normal  0.943943 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5808  fimbria-associated protein  24.37 
 
 		 233 aa  50.4  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0129  lpxtg-site transpeptidase sortase family protein  24.18 
 
 		 233 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000402223 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0023  sortase family protein  28.06 
 
 		 276 aa  50.1  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4565  sortase  30.2 
 
 		 206 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3923  sortase family protein  33.61 
 
 		 238 aa  49.3  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8826  sortase family protein  29.93 
 
 		 229 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.457222  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4970  LPXTG-site transpeptidase family protein  29.05 
 
 		 206 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1137  peptidase C60, sortase A and B  26.12 
 
 		 217 aa  48.5  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1003  sortase family protein  24.02 
 
 		 301 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3119  peptidase C60, sortase A and B  33.66 
 
 		 302 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000120301  unclonable  0.0000160759 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2959  peptidase C60 sortase A and B  34.65 
 
 		 298 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0608881  hitchhiker  0.000198401 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0035  sortase family protein  27.82 
 
 		 251 aa  48.5  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0157  fimbria-associated protein  28.15 
 
 		 236 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000951258  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4647  sortase family protein  29.82 
 
 		 206 aa  47.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>